The 8 references with contexts in paper A. Timina M., N. Zinyakov G., A. Scherbakov V., D. Lozovoy A., А. Тимина М., Н. Зиняков Г., А. Щербаков В., Д. Лозовой А. (2018) “ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ИЗОЛЯТОВ ВИРУСА ЯЩУРА, ВЫЯВЛЕННЫХ НА ПОСТСОВЕТСКОМ ПРОСТРАНСТВЕ И В МОНГОЛИИ В 2016 ГОДУ // PHYLOGENETIC ANALYSIS OF FMDV ISOLATES RECOVERED IN POST-SOVIET STATES AND MONGOLIA IN 2016” / spz:neicon:veterinary:y:2017:i:4:p:3-8

1
Щербаков А. В., Перевозчикова Н. А., Дрыгин В. В. Методические указания по индикации генома и штаммовой дифференциации вируса ящура методом полимеразной цепной реакции и секвенированием гена VP1 // Методические указания по диагностике заболеваний сельскохозяйственных животных методом полимеразной цепной реакции. – Владимир, 1998. – С. 31–41.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=5486
    Prefix
    Амплификацию гена VP1 проводили методом ОТ-ПЦР в соответствии с «Методическими указаниями по индикации генома и штаммовой дифференциации вируса ящура методом полимеразной цепной реакции и секвенированием гена VP1»
    Exact
    [1]
    Suffix
    . Секвенирование. Секвенирование осуществляли с использованием набора BigDye® Terminator Cycle Sequencing Kit и автоматического секвенатора ABI Prism 3130 (Applied Biosystems, США). Анализ нуклеотидных последовательностей проводили с использованием пакета программ BioEdit.

2
Application of RT-PCR and nucleotide sequencing in footand-mouth disease diagnosis / A. Scherbakov, N. Lomakina, V. Drygin, A. Gusev // Vet. Q. – 1998. – Vol. 20, No. 2. – P. 32–34.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=5200
    Prefix
    Для исследований использовали пробы афтозного эпителия от крупного рогатого скота. Выделение РНК. РНК выделяли из 10%-й суспензии эпителия методом аффинной сорбции на стекловолокнистых фильтрах
    Exact
    [2]
    Suffix
    . Обратная транскрипция и полимеразная цепная реакция (ОТ-ПЦР). Амплификацию гена VP1 проводили методом ОТ-ПЦР в соответствии с «Методическими указаниями по индикации генома и штаммовой дифференциации вируса ящура методом полимеразной цепной реакции и секвенированием гена VP1» [1].

3
Foot-and-mouth disease. – URL: http:www.foot-and-mouth. org (дата обращения: 02.02.17).
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=871
    Prefix
    В настоящее время в мире существует семь экосистем (пулов) вируса ящура: 1 – Юго-Восточная Азия и Китай, 2 – Южная Азия, 3 – Ближний и Средний Восток, 4 – Западная и Центральная Африка, 5 – Восточная Африка, 6 – Южная Африка и 7 – Южная Америка
    Exact
    [3]
    Suffix
    . В каждом пуле циркулируют штаммы вируса ящура, отличающиеся по генетическим и антигенным свойствам. Эти устойчивые генетические группы получили название топотипов [6, 8]. В пределах каждого топотипа различают многочисленные генетические линии и сублинии вируса ящура.

4
Foot-and-mouth disease, China. – URL: http://oie.int/ wahis_2/public/wahid.php/Reviewreport/Review?page_refer= MapFullEventReport&reportid=21595 (дата обращения: 29.09.17).
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=12619
    Prefix
    Mongolian isolates 2016 on Type A FMDV phylogenetic tree diagram The tree diagram is based on VP1 gene sequence comparison с территории КНР попал в приграничные населенные пункты Забайкальского края России. В 2016 г. Китай сообщал о вспышках ящура типа О на своей территории
    Exact
    [4]
    Suffix
    , однако их генетическая характеристика пока неизвестна. В настоящее время актуальной задачей является определение эффективности вакцины, применяемой в буферной зоне Российской Федерации, против вируса ящура линии O/Ind-2001d.

5
Incursions of foot-and-mouth disease virus into Europe between 1985 and 2006 / J. F. Valarcher, Y. Leforban, M. Rweyemamu [et al.] // Transbound. Emerg. Dis. – 2008. – Vol. 55, No. 1. – P. 14–34.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=6626
    Prefix
    Эта генетическая линия эндемична в Южной Азии и до 2015 г. за пределами полуострова Индостан обнаруживалась только в Саудовской Аравии в 1995 г. и в Европе (Албания и Македония) в 1996 г.
    Exact
    [5]
    Suffix
    . Осенью 2015 г. вирус ящура A/G-VII вызвал многочисленные вспышки болезни сразу в нескольких странах за предеБОЛЕЗНИ КРУПНОГО РОГАТОГО СКОТА CATTLE DISEASES Fig. 2. Middle Asian isolates on Type O FMDV tree diagram The tree diagram is based on VP1 gene sequence comparison.

6
Knowles N. J., Samuel A. R. Molecular epidemiology of footand-mouth disease virus // Virus Res. – 2003. – Vol. 91, No. 1. – P. 65–80.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=1052
    Prefix
    экосистем (пулов) вируса ящура: 1 – Юго-Восточная Азия и Китай, 2 – Южная Азия, 3 – Ближний и Средний Восток, 4 – Западная и Центральная Африка, 5 – Восточная Африка, 6 – Южная Африка и 7 – Южная Америка [3]. В каждом пуле циркулируют штаммы вируса ящура, отличающиеся по генетическим и антигенным свойствам. Эти устойчивые генетические группы получили название топотипов
    Exact
    [6, 8]
    Suffix
    . В пределах каждого топотипа различают многочисленные генетические линии и сублинии вируса ящура. Ситуация по ящуру в мире очень динамична. Ежегодно регистрируются многочисленные случаи заноса болезни из эндемичных регионов в страны, свободные от ящура.

7
Molecular epidemiology reports produced by the FAO World Reference Laboratory for FMD. – URL: http://www.wrlfmd. org/fmd_genotyping (дата обращения: 02.02.17).
Total in-text references: 3
  1. In-text reference with the coordinate start=7484
    Prefix
    Положение среднеазиатских изолятов на филогенетическом древе вируса ящура типа О Дендрограмма основана на сравнении полных нуклеотидных последовательностей гена VP1. лами своего естественного ареала: Саудовской Аравии, Турции и Иране
    Exact
    [7]
    Suffix
    . Очевидно, именно с территории Турции этот вирус был занесен в Армению. Главная опасность ситуации заключалась в том, что традиционные вакцинные штаммы не способны защищать животных от вируса ящура A/G-VII.

  2. In-text reference with the coordinate start=8871
    Prefix
    В 2007 г. данный вирус распространился из Южной Азии на Ближний Восток и Центральную Азию, вытеснил из этих регионов линию O/PanAsia и доминирует в них до настоящего времени. За этот период вирус значительно дивергировал, образовав несколько генетических сублиний
    Exact
    [7]
    Suffix
    . Проведенные исследования свидетельствуют о том, что ситуация по ящуру в Средней Азии принципиально не изменилась: здесь по-прежнему циркулирует вирус, принадлежащий к генетической линии O/PanAsia-2, а значит, вакцина на основе данного штамма попрежнему актуальна для стран этого региона. 12 августа 2016 г. в ФГБУ «ВНИИЗЖ» поступил патологический материал от крупного ро

  3. In-text reference with the coordinate start=11785
    Prefix
    Использование базы данных Всемирной референтной лаборатории МЭБ/ФАО по ящуру (Великобритания) позволило установить, что забайкальский вирус на 99,2% идентичен тайским изолятам TAI-225-2016R3 и TAI-269-2-2016 и на 99,1% – непальским изолятам 2015–2016 гг.
    Exact
    [7]
    Suffix
    . Занос вируса ящура в Забайкальский край из этих стран маловероятен. Более вероятным представляется другой сценарий: вирус ящура линии O/ME-SA/Ind-2001 был занесен из одной из этих стран сначала в Китай, там получил достаточно широкое распространение и затем уже БОЛЕЗНИ КРУПНОГО РОГАТОГО СКОТА CATTLE DISEASES Рис. 3.

8
Samuel A. R., Knowles N. J. Foot-and-mouth disease type O viruses exhibit genetically and geographically distinct evolutionary lineages (topotypes) // J. Gen. Virol. – 2001. – Vol. 82, No. 3. – P. 609–621. БОЛЕЗНИ КРУПНОГО РОГАТОГО СКОТА CATTLE DISEASES
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=1052
    Prefix
    экосистем (пулов) вируса ящура: 1 – Юго-Восточная Азия и Китай, 2 – Южная Азия, 3 – Ближний и Средний Восток, 4 – Западная и Центральная Африка, 5 – Восточная Африка, 6 – Южная Африка и 7 – Южная Америка [3]. В каждом пуле циркулируют штаммы вируса ящура, отличающиеся по генетическим и антигенным свойствам. Эти устойчивые генетические группы получили название топотипов
    Exact
    [6, 8]
    Suffix
    . В пределах каждого топотипа различают многочисленные генетические линии и сублинии вируса ящура. Ситуация по ящуру в мире очень динамична. Ежегодно регистрируются многочисленные случаи заноса болезни из эндемичных регионов в страны, свободные от ящура.