The 7 references with contexts in paper V. Pavelko I., Yu. Babin Yu., A. Piskunov V., A. Sprygin V., O. Pruntova V., В. Павелко И., Ю. Бабин Ю., А. Пискунов В., А. Спрыгин В., О. Прунтова В. (2018) “Идентификация Haemophilus parasuis с помощью метода MALDI-TOF масс-спектрометрии // Identification of Haemophilus parasuis using MALDI-TOF mass spectrometry” / spz:neicon:veterinary:y:2016:i:2:p:61-65

1
Identification of animal Pasteurellaceae by MALDITOF mass spectrometry / P. Kuhnert [et al.] // J. Microbiol. Methods. — 2012. — Vol. 89, No 1. — P. 1–7.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=7191
    Prefix
    Первые исследования с применением MALDITOF MS для идентификации бактерий семейства Pasteurellaceae продемонстрировали родовую и видовую специфичность. Однако между близкородственными видами и подвидами идентификация была затруднена
    Exact
    [1]
    Suffix
    . Целью данной работы было дополнение базы данных спектрами H. parasuis и A. minor для расширения возможностей идентификации бактерий семейства Pasteurellaceae от близкородственных микроорганизмов семейства Pasteurellaceae.

2
Identification of Borrelia species after creation of an in-house MALDI-TOF MS database / A. Calderaro [et al.] // PLoS ONE. — 2014. — Vol. 9, No 2:e88895. — doi: 10.1371/ journal.pone.0088895.
Total in-text references: 2
  1. In-text reference with the coordinate start=9168
    Prefix
    ,313M. haemolytica DSM 5283 DSM P. multocida 1152,512P. multocida FI FLR P. multocida ATCC 157422,453P. multocida FI FLR P. multocida TS-82,418P. multocida spp. multocida DSM 16031T DSM * штаммы бактерий, которые использовали для создания профиля спектра и расширения базы данных. Пробоподготовка. Пробоподготовку осуществляли в соответствии с методикой, описанной A. Calderaro в 2014 г.
    Exact
    [2]
    Suffix
    . MALDI-TOF MS анализ. Получение и анализ спектров проводились на масс-спектрометре Autoflex III (Bruker Daltonics, Германия) с помощью программы MALDI Biotyper (версия 3.0) с базой спектров (версия 3.1.2.0; 4111 спектров, Bruker Daltonics, Германия) с параметрами по умолчанию (линейный положительный режим; частота лазера 60 Гц; напряжение источника ионов No1 20 кВ; напряжение источник

  2. In-text reference with the coordinate start=16125
    Prefix
    SNN-модель была основана на 10 областях, представленных в табл. 2, в белковом спектре со 100% специфичностью дифференцирующих H. parasuis, P. multocida, A. paragallinarum, A. minor, A. pleuropneumoniae и H. somni. Классифицирующие алгоритмы широко применяются в масс-спектрометрии для поиска биомаркеров представителей одного рода
    Exact
    [2]
    Suffix
    и для дифференциации патогенных и непатогенных штаммов одного вида [3]. Наличие пиков проверили визуально у одиночных спектров всех 6 бактерий. Пример пика массой 8407,92 Да, дифференцирующего H. parasuis, представлен на рис. 2.

3
Microbial typing by matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry: do we need guidance for data interpretation? / S. Spinali [et al.] // J. Clin. Microbiol. — 2015. — Vol. 53, No 3. — P. 760–765.
Total in-text references: 2
  1. In-text reference with the coordinate start=16196
    Prefix
    основана на 10 областях, представленных в табл. 2, в белковом спектре со 100% специфичностью дифференцирующих H. parasuis, P. multocida, A. paragallinarum, A. minor, A. pleuropneumoniae и H. somni. Классифицирующие алгоритмы широко применяются в масс-спектрометрии для поиска биомаркеров представителей одного рода [2] и для дифференциации патогенных и непатогенных штаммов одного вида
    Exact
    [3]
    Suffix
    . Наличие пиков проверили визуально у одиночных спектров всех 6 бактерий. Пример пика массой 8407,92 Да, дифференцирующего H. parasuis, представлен на рис. 2. Рис. 2. Пример дифференцирующего пика массой 8407,92 Да фиолетовый — H. parasuis; красный — A. minor; синий — A. paragallinarum; светло-зеленый — A. pleuropneumoniae; желтый — H. somni; темно-зеленый — P. multocida.

  2. In-text reference with the coordinate start=17081
    Prefix
    Таблица 2 Дифференцирующие пики модели SNN No п/п Соотношение масса/заряд белкового пика 12562,52---+-23478,49--+--33600,84+----43844,7-----+ 54187,6+--+-+ 64266,02-+---74595,82--+--84666,73--+--96304,33++---+ 107149,08----++ 117201,39+----128407,92----+139189,56--+--1412803,31+----1519476,08---+-Способность метода определять клональность изолятов используют для быстрого субтипирования
    Exact
    [3]
    Suffix
    . По сравнению с биохимическими и генетическими методами, такими как секвенирование и типирование на основе мультилокусного секвенирования, дифференциация бактерий с помощью MALDI-TOF MS быстрее, дешевле и менее трудозатратна.

4
Olvera A., Segalés J., Aragon V. Update on the diagnosis of Haemophilus parasuis infection in pigs and novel genotyping methods // Vet. J. — 2007. — Vol. 174, No 3. — P. 522–529.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=6652
    Prefix
    При бактериологическом исследовании эти виды можно дифференцировать по биохимическим признакам [6], но это требует наличия дорогостоящих бактериальных сред сложного состава и временных затрат
    Exact
    [4]
    Suffix
    . В последнее время MALDI-TOF масс-спектрометрию (MALDI-TOF MS) часто используют в качестве экспресс-метода идентификации бактерий. Данный метод представляет универсальную, высокочувствительную, быструю и дешевую альтернативу генетическим и фенотипическим методам идентификации.

5
Pathologic observations of pigs intranasally inoculated with serovar 1, 4 and 5 of Haemophilus parasuis using immunoperoxidase method / H. Amano, M. Shibata, N. Kajio, T. Morozumi // J. Vet. Med. Sci. — 1994. — Vol. 56, No 4. — P. 639–644.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=6024
    Prefix
    Алгоритм действий при оценке биологической безопасности свиноводческого хозяйства ВВЕДЕНИЕ Гемофилезный полисерозит, или болезнь Глессера, — инфекционное заболевание свиней, характеризующееся серозно-фибринозным перикардитом, плевритом, перитонитом, артритом и менингоэнцефалитом
    Exact
    [5]
    Suffix
    . Возбудителем болезни Глессера является грамотрицательная палочковидная бактерия Haemophilus parasuis (H. parasuis) из семейства Pasteurellaceae. Кроме нее респираторной тракт свиней может быть колонизирован такими бактериями, как Actinobacillus minor (A. minor), Actinobacillus indolicus (A. indolicus), Actinobacillus porcinus (A. porcinus), Actinobacillus pleuropneum

6
Phenotypic and genetic characterization of NADdependent Pasteurellaceae from the respiratory tract of pigs and their possible pathogenetic importance / P. Kielstein [et al.] // Vet. Microbiol. — 2001. — Vol. 81, No 3. — P. 243–255.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=6555
    Prefix
    Кроме нее респираторной тракт свиней может быть колонизирован такими бактериями, как Actinobacillus minor (A. minor), Actinobacillus indolicus (A. indolicus), Actinobacillus porcinus (A. porcinus), Actinobacillus pleuropneumonia (A. pleuropneumonia). При бактериологическом исследовании эти виды можно дифференцировать по биохимическим признакам
    Exact
    [6]
    Suffix
    , но это требует наличия дорогостоящих бактериальных сред сложного состава и временных затрат [4]. В последнее время MALDI-TOF масс-спектрометрию (MALDI-TOF MS) часто используют в качестве экспресс-метода идентификации бактерий.

7
Phylogenomic and molecular demarcation of the core members of the polyphyletic Pasteurellaceae genera Actinobacillus, Haemophilus, and Pasteurella / S. Naushad [et al.] // Int. J. Genomics. — 2015. — Vol. 2015. — URL: http:// dx.doi.org/10.1155/2015/198560.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=17828
    Prefix
    Протеомические профили бактерий рода Actinobacillus, Haemophilus и Pasteurella, в том числе представленные в базе данных, образуют смешанные клады, как и полногеномные последовательности
    Exact
    [7]
    Suffix
    . Представители A. paragalinarum, H. somni, A. pleuropneumoniae, P. multocida, использованные для поиска дифференцирующих пиков, входят в кластеры, образованные другими представителями соответствующих родов.