The 14 reference contexts in paper L. Scherbakova O., S. Kolosov N., Z. Nikonova B., N. Zinyakov G., Ye. Ovchinnikova V., I. Chvala A., Л. Щербакова О., С. Колосов Н., З. Никонова Б., Н. Зиняков Г., Е. Овчинникова В., И. Чвала А. (2018) “ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ИЗОЛЯТОВ ВИРУСА ИНФЕКЦИОННОГО БРОНХИТА КУР, ВЫЯВЛЕННЫХ НА ТЕРРИТОРИИ СТРАН СНГ В 2015–2017 ГГ. // GENETIC CHARACTERIZATION OF AVIAN INFECTIOUS BRONCHITIS VIRUS ISOLATES RECOVERED IN CIS COUNTRIES IN 2015–2017” / spz:neicon:veterinary:y:2018:i:3:p:30-39

  1. Start
    1062
    Prefix
    Непрерывное появление точечных мутаций, инсерций и делеций, а также рекомбинаций (в слу­ чае одновременного размножения в одном хозяине генетически отличающихся изолятов) – все это приво­ дит к появлению новых вариантов вируса
    Exact
    [4]
    Suffix
    . Частота мутаций в гипервариабельной области гена S1 вируса ИБК, изолированного от вакцинированных птиц, дости­ гает 1,5% в год, но при отсутствии поствакцинального иммунитета вирус эволюционирует более медленными темпами (0,3%) [11].
    (check this in PDF content)

  2. Start
    1294
    Prefix
    Частота мутаций в гипервариабельной области гена S1 вируса ИБК, изолированного от вакцинированных птиц, дости­ гает 1,5% в год, но при отсутствии поствакцинального иммунитета вирус эволюционирует более медленными темпами (0,3%)
    Exact
    [11]
    Suffix
    . Высокая вариабельность генома вируса ИБК приво­ дит к сложностям в классификации вируса. Постоянно появляются новые варианты вируса. Многие из них неспособны к воспроизводству или выживают только в течение короткого промежутка времени.
    (check this in PDF content)

  3. Start
    4667
    Prefix
    При большом разнообразии уже извест­ ных генотипов выявляются изоляты, не относящиеся ни к одному из ранее выявленных генотипов вируса ИБК. Такие изоляты принято называть вариантными. В 2016 г. V. Valastro и соавт.
    Exact
    [14]
    Suffix
    предложили рацио­ нальную и стандартизированную номенклатуру генети­ ческих групп вируса ИБК на основе сравнения 1286 по­ следовательностей гена S1, исключая нуклеотидные последовательности рекомбинантных форм вируса ИБК.
    (check this in PDF content)

  4. Start
    5691
    Prefix
    МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ Для исследования использовали 840 проб внутрен­ них органов (легкие, трахеи, почки, кишечник), инкуба­ ционные яйца, фекалии кур разных возрастов, получен­ ные из птицефабрик Российской Федерации и Республик Беларусь, Таджикистан и Казахстан в 2015–2017 гг. Реакции ОТ­ПЦР и ОТ­ПЦР в режиме реального вре­ мени проводили в соответствии с методическими ука­ заниями
    Exact
    [1, 2]
    Suffix
    . Для генотипирования вируса ИБК использовали сравнительный анализ фрагмента гена S1 примерно 500 н. о. (позиция 112–653 н. о. на гене S относительно штамма Н­120). Для анализа использовали нуклеотид­ ные последовательности прототипных штаммов, пред­ ложенных V.
    (check this in PDF content)

  5. Start
    5986
    Prefix
    Для генотипирования вируса ИБК использовали сравнительный анализ фрагмента гена S1 примерно 500 н. о. (позиция 112–653 н. о. на гене S относительно штамма Н­120). Для анализа использовали нуклеотид­ ные последовательности прототипных штаммов, пред­ ложенных V. Valastro и соавт.
    Exact
    [14]
    Suffix
    . Определение нуклеотидной последовательности осуществляли по методу Сэнгера с использованием флуоресцентно меченых терминирующих нуклеотидов на автоматическом секвенаторе ABI Prism 3130 (Applied Biosystems, США) согласно инструкции изготовителя.
    (check this in PDF content)

  6. Start
    8176
    Prefix
    Минимальный возраст птицы, у кото­ рой был выявлен изолят вируса ИБК генотипа GI­19 (QX), составлял 8 сут, максимальный – 578 сут. Впервые ви­ Рис. 1. Генетические линии вируса ИБК, выявленные в 2015–2017 гг. рус GI­19 (QX) был изолирован в Китае
    Exact
    [10]
    Suffix
    . В настоя­ щее время вирус GI­19 (QX) широко распространен в Европе, Юго­Восточной Азии, Африке и на Ближнем Востоке [6]. Представители генетической линии GI­ 19 (QX) впервые были выявлены на территории РФ еще в 2001 г. [13].
    (check this in PDF content)

  7. Start
    8305
    Prefix
    Генетические линии вируса ИБК, выявленные в 2015–2017 гг. рус GI­19 (QX) был изолирован в Китае [10]. В настоя­ щее время вирус GI­19 (QX) широко распространен в Европе, Юго­Восточной Азии, Африке и на Ближнем Востоке
    Exact
    [6]
    Suffix
    . Представители генетической линии GI­ 19 (QX) впервые были выявлены на территории РФ еще в 2001 г. [13]. Сравнительный анализ изолятов вируса ИБК, вы­ явленных в течение трех лет, с 2015 по 2017 г., пока­ зывает, что каждый год кроме генетической линии GI­19 (QX) выявляются изоляты GI­1 (Масс), GI­12 (D274), GI­13 (793B) (рис. 2).
    (check this in PDF content)

  8. Start
    8411
    Prefix
    В настоя­ щее время вирус GI­19 (QX) широко распространен в Европе, Юго­Восточной Азии, Африке и на Ближнем Востоке [6]. Представители генетической линии GI­ 19 (QX) впервые были выявлены на территории РФ еще в 2001 г.
    Exact
    [13]
    Suffix
    . Сравнительный анализ изолятов вируса ИБК, вы­ явленных в течение трех лет, с 2015 по 2017 г., пока­ зывает, что каждый год кроме генетической линии GI­19 (QX) выявляются изоляты GI­1 (Масс), GI­12 (D274), GI­13 (793B) (рис. 2).
    (check this in PDF content)

  9. Start
    9235
    Prefix
    Нефропато­ генный штамм вируса ИБК GI­14 (B1648) впервые был выделен в 1984 г. в Бельгии. Несмотря на интенсивную вакцинацию, GI­14 (B1648) и его варианты по­прежнему циркулируют в Европе и Северной Африке
    Exact
    [8]
    Suffix
    . В 2015 г. на птицефабриках Казахстана и в 2016 г. в РФ был выявлен вирус генетической линии GI­23 (Variant­2). Ранее случаев выявления данного генотипа вируса ИБК на территории этих двух стран не было.
    (check this in PDF content)

  10. Start
    9683
    Prefix
    Линия GI­23 представляет собой кластер уникального типа, гео­ графически ограниченный странами Среднего Востока. Штаммы, принадлежащие к этой линии, были обнару­ жены в 1998 г. в Израиле и продолжают циркулировать в этом регионе
    Exact
    [7, 12]
    Suffix
    . Некоторые из них стали доми­ нирующими для большинства ферм, вызывая респира­ торную и почечную патологии у кур [9]. В 2017 г. появились представители двух новых для РФ генетических линий вируса ИБК: GI­16 (Q1) и GI­22.
    (check this in PDF content)

  11. Start
    9802
    Prefix
    Штаммы, принадлежащие к этой линии, были обнару­ жены в 1998 г. в Израиле и продолжают циркулировать в этом регионе [7, 12]. Некоторые из них стали доми­ нирующими для большинства ферм, вызывая респира­ торную и почечную патологии у кур
    Exact
    [9]
    Suffix
    . В 2017 г. появились представители двух новых для РФ генетических линий вируса ИБК: GI­16 (Q1) и GI­22. Гене­ тическая линия вируса ИБК GI­16 (Q1) была обнаружена у кур в Италии, Испании, Китае, в большинстве стран Латинской Америки и Ближнего Востока [6].
    (check this in PDF content)

  12. Start
    10056
    Prefix
    В 2017 г. появились представители двух новых для РФ генетических линий вируса ИБК: GI­16 (Q1) и GI­22. Гене­ тическая линия вируса ИБК GI­16 (Q1) была обнаружена у кур в Италии, Испании, Китае, в большинстве стран Латинской Америки и Ближнего Востока
    Exact
    [6]
    Suffix
    . Результа­ ты экспериментов, проводимых с вирусом GI­16 (Q1), впервые были опубликованы L. Yu и соавт. [5]. Вирус был изолирован из железистого желудка молодых несушек. При экспериментальном заражении у птиц проявлялись респираторные признаки заболевания, диарея, поражение железистого желудка.
    (check this in PDF content)

  13. Start
    10168
    Prefix
    Гене­ тическая линия вируса ИБК GI­16 (Q1) была обнаружена у кур в Италии, Испании, Китае, в большинстве стран Латинской Америки и Ближнего Востока [6]. Результа­ ты экспериментов, проводимых с вирусом GI­16 (Q1), впервые были опубликованы L. Yu и соавт.
    Exact
    [5]
    Suffix
    . Вирус был изолирован из железистого желудка молодых несушек. При экспериментальном заражении у птиц проявлялись респираторные признаки заболевания, диарея, поражение железистого желудка.
    (check this in PDF content)

  14. Start
    13818
    Prefix
    Ра­ нее были описаны случаи выявления рекомбинантов, где родительскими вирусами были полевые вирусы ге­ нотипов QX и Масс, а также вакцинные штаммы D274, 4/91 и Н­120 в разных комбинациях между собой, вклю­ чая комбинацию из двух вакцинных штаммов Н­120 и D274
    Exact
    [3]
    Suffix
    . В 2017 г. в двух пробах, полученных с птицефабрики из Марий Эл, были выявлены два изолята вируса ИБК (IBV03­17 и IBV04­17), часть гена S1 которых имела про­ исхождение от вируса генетической линии GI­13 (D274), а другая часть – от GI­1 (Масс) (рис. 3).
    (check this in PDF content)