The 9 reference contexts in paper V. Pavelko I., Yu. Babin Yu., A. Piskunov V., A. Sprygin V., O. Pruntova V., В. Павелко И., Ю. Бабин Ю., А. Пискунов В., А. Спрыгин В., О. Прунтова В. (2018) “Идентификация Haemophilus parasuis с помощью метода MALDI-TOF масс-спектрометрии // Identification of Haemophilus parasuis using MALDI-TOF mass spectrometry” / spz:neicon:veterinary:y:2016:i:2:p:61-65

  1. Start
    6024
    Prefix
    Алгоритм действий при оценке биологической безопасности свиноводческого хозяйства ВВЕДЕНИЕ Гемофилезный полисерозит, или болезнь Глессера, — инфекционное заболевание свиней, характеризующееся серозно-фибринозным перикардитом, плевритом, перитонитом, артритом и менингоэнцефалитом
    Exact
    [5]
    Suffix
    . Возбудителем болезни Глессера является грамотрицательная палочковидная бактерия Haemophilus parasuis (H. parasuis) из семейства Pasteurellaceae. Кроме нее респираторной тракт свиней может быть колонизирован такими бактериями, как Actinobacillus minor (A. minor), Actinobacillus indolicus (A. indolicus), Actinobacillus porcinus (A. porcinus), Actinobacillus pleuropneum
    (check this in PDF content)

  2. Start
    6555
    Prefix
    Кроме нее респираторной тракт свиней может быть колонизирован такими бактериями, как Actinobacillus minor (A. minor), Actinobacillus indolicus (A. indolicus), Actinobacillus porcinus (A. porcinus), Actinobacillus pleuropneumonia (A. pleuropneumonia). При бактериологическом исследовании эти виды можно дифференцировать по биохимическим признакам
    Exact
    [6]
    Suffix
    , но это требует наличия дорогостоящих бактериальных сред сложного состава и временных затрат [4]. В последнее время MALDI-TOF масс-спектрометрию (MALDI-TOF MS) часто используют в качестве экспресс-метода идентификации бактерий.
    (check this in PDF content)

  3. Start
    6652
    Prefix
    При бактериологическом исследовании эти виды можно дифференцировать по биохимическим признакам [6], но это требует наличия дорогостоящих бактериальных сред сложного состава и временных затрат
    Exact
    [4]
    Suffix
    . В последнее время MALDI-TOF масс-спектрометрию (MALDI-TOF MS) часто используют в качестве экспресс-метода идентификации бактерий. Данный метод представляет универсальную, высокочувствительную, быструю и дешевую альтернативу генетическим и фенотипическим методам идентификации.
    (check this in PDF content)

  4. Start
    7191
    Prefix
    Первые исследования с применением MALDITOF MS для идентификации бактерий семейства Pasteurellaceae продемонстрировали родовую и видовую специфичность. Однако между близкородственными видами и подвидами идентификация была затруднена
    Exact
    [1]
    Suffix
    . Целью данной работы было дополнение базы данных спектрами H. parasuis и A. minor для расширения возможностей идентификации бактерий семейства Pasteurellaceae от близкородственных микроорганизмов семейства Pasteurellaceae.
    (check this in PDF content)

  5. Start
    9168
    Prefix
    ,313M. haemolytica DSM 5283 DSM P. multocida 1152,512P. multocida FI FLR P. multocida ATCC 157422,453P. multocida FI FLR P. multocida TS-82,418P. multocida spp. multocida DSM 16031T DSM * штаммы бактерий, которые использовали для создания профиля спектра и расширения базы данных. Пробоподготовка. Пробоподготовку осуществляли в соответствии с методикой, описанной A. Calderaro в 2014 г.
    Exact
    [2]
    Suffix
    . MALDI-TOF MS анализ. Получение и анализ спектров проводились на масс-спектрометре Autoflex III (Bruker Daltonics, Германия) с помощью программы MALDI Biotyper (версия 3.0) с базой спектров (версия 3.1.2.0; 4111 спектров, Bruker Daltonics, Германия) с параметрами по умолчанию (линейный положительный режим; частота лазера 60 Гц; напряжение источника ионов No1 20 кВ; напряжение источник
    (check this in PDF content)

  6. Start
    16125
    Prefix
    SNN-модель была основана на 10 областях, представленных в табл. 2, в белковом спектре со 100% специфичностью дифференцирующих H. parasuis, P. multocida, A. paragallinarum, A. minor, A. pleuropneumoniae и H. somni. Классифицирующие алгоритмы широко применяются в масс-спектрометрии для поиска биомаркеров представителей одного рода
    Exact
    [2]
    Suffix
    и для дифференциации патогенных и непатогенных штаммов одного вида [3]. Наличие пиков проверили визуально у одиночных спектров всех 6 бактерий. Пример пика массой 8407,92 Да, дифференцирующего H. parasuis, представлен на рис. 2.
    (check this in PDF content)

  7. Start
    16196
    Prefix
    основана на 10 областях, представленных в табл. 2, в белковом спектре со 100% специфичностью дифференцирующих H. parasuis, P. multocida, A. paragallinarum, A. minor, A. pleuropneumoniae и H. somni. Классифицирующие алгоритмы широко применяются в масс-спектрометрии для поиска биомаркеров представителей одного рода [2] и для дифференциации патогенных и непатогенных штаммов одного вида
    Exact
    [3]
    Suffix
    . Наличие пиков проверили визуально у одиночных спектров всех 6 бактерий. Пример пика массой 8407,92 Да, дифференцирующего H. parasuis, представлен на рис. 2. Рис. 2. Пример дифференцирующего пика массой 8407,92 Да фиолетовый — H. parasuis; красный — A. minor; синий — A. paragallinarum; светло-зеленый — A. pleuropneumoniae; желтый — H. somni; темно-зеленый — P. multocida.
    (check this in PDF content)

  8. Start
    17081
    Prefix
    Таблица 2 Дифференцирующие пики модели SNN No п/п Соотношение масса/заряд белкового пика 12562,52---+-23478,49--+--33600,84+----43844,7-----+ 54187,6+--+-+ 64266,02-+---74595,82--+--84666,73--+--96304,33++---+ 107149,08----++ 117201,39+----128407,92----+139189,56--+--1412803,31+----1519476,08---+-Способность метода определять клональность изолятов используют для быстрого субтипирования
    Exact
    [3]
    Suffix
    . По сравнению с биохимическими и генетическими методами, такими как секвенирование и типирование на основе мультилокусного секвенирования, дифференциация бактерий с помощью MALDI-TOF MS быстрее, дешевле и менее трудозатратна.
    (check this in PDF content)

  9. Start
    17828
    Prefix
    Протеомические профили бактерий рода Actinobacillus, Haemophilus и Pasteurella, в том числе представленные в базе данных, образуют смешанные клады, как и полногеномные последовательности
    Exact
    [7]
    Suffix
    . Представители A. paragalinarum, H. somni, A. pleuropneumoniae, P. multocida, использованные для поиска дифференцирующих пиков, входят в кластеры, образованные другими представителями соответствующих родов.
    (check this in PDF content)