The 23 reference contexts in paper A. Kozlov A., N. Zinyakov G., S. Kolosov N., N. Mudrak S., I. Chvala A., А. Козлов А., Н. Зиняков Г., С. Колосов Н., Н. Мудрак С., И. Чвала А. (2018) “Анализ последовательности полного генома штамма «О» вируса инфекционного ларинготрахеита птиц // Analysis of whole genome sequence of strain "0" of avian infectious laryngotracheitis virus” / spz:neicon:veterinary:y:2016:i:1:p:55-58

  1. Start
    5250
    Prefix
    Бахчина и коллег, где для интраназального заражения использовали изолят ВПГП A/grebe/Tyva/433/10/ H5N1, который относится к той же группе эпизоотических вирусов ГП азиатского происхождения, что и исследуемый возбудитель
    Exact
    [2]
    Suffix
    . ЗАКЛЮЧЕНИЕ В результате проведенных экспериментов было установлено, что изолят A/duck/Altai/469/14 H5N1 вызывает острое генерализованное заболевание у кур с характерными для ГП клиническими признаками и патоморфологическими поражениями органов с локализацией вируса в тканях респираторной, пищеварительной, нервной и сердечно-сосудистой систем.
    (check this in PDF content)

  2. Start
    7903
    Prefix
    ДАБ и гематоксилин, ок. ×10, об. ×40 аб ВВЕДЕНИЕ Инфекционный ларинготрахеит (ИЛТ) — экономически значимое респираторное заболевание сельскохозяйственной птицы, наносящее ущерб птицеводству во всём мире. Возбудителем является ДНК-содержащий вирус Gallid herpesvirus 1 (GaHV-1) семейства Herpesviridae, подсемейства Alphaherpesvirinae
    Exact
    [6]
    Suffix
    . На данный момент в GenBank опубликованы последовательности полных геномов десяти производственных штаммов вируса ИЛТ и десяти вирулентных штаммов, выделенных на территории США, Австралии и Китая.
    (check this in PDF content)

  3. Start
    8974
    Prefix
    Полученный материал диспергировали и подвергали однократной заморозке и оттаиванию. Очистку и концентрирование вируссодержащего материала проводили с помощью ультрацентрифугирования в градиенте плотности сахарозы
    Exact
    [1]
    Suffix
    . Для выделения ДНК из очищенного материала применяли набор DNeasy Mini Kit (Qiagen, Германия) в соответствии с инструкцией производителя. Определение первичной структуры генома проводили методом пирофосфатного секвенирования «454 Life Sciences» на автоматическом секвенаторе GS Junior (Roche, Германия) согласно протоколам изготовителя.
    (check this in PDF content)

  4. Start
    12566
    Prefix
    Высокое значение Bootstrap критерия (показатель достоверности топологии узла ветвления) в ключевых точках ветвления (рис. 2) подтверждает правомерность данного деления. Группа 1 предположительно включает две подгруппы: • подгруппа 1.1 — штаммы Сover (выделен приблизительно в 1958 г.)
    Exact
    [6]
    Suffix
    , Hudson (1962 г.) [6], Fowl laryngotracheitis (1991 г.) [5], Serva (точное время выделения этого штамма неизвестно) [6], 63140С08BR (2006 г.) [5], ACC78 (2008 г.) [3] и штамм «О» (199 г.) [2]; • подгруппа 1.2 — LT-Ivax LP (1991 г.) [5], IVAX (1991 г.) [5], 81658 (2010 г.) [5] и штамм «USDA»; а также в группу 1 включён штамм из Китая — LJS09 (2009 г.) [4].
    (check this in PDF content)

  5. Start
    12592
    Prefix
    Высокое значение Bootstrap критерия (показатель достоверности топологии узла ветвления) в ключевых точках ветвления (рис. 2) подтверждает правомерность данного деления. Группа 1 предположительно включает две подгруппы: • подгруппа 1.1 — штаммы Сover (выделен приблизительно в 1958 г.) [6], Hudson (1962 г.)
    Exact
    [6]
    Suffix
    , Fowl laryngotracheitis (1991 г.) [5], Serva (точное время выделения этого штамма неизвестно) [6], 63140С08BR (2006 г.) [5], ACC78 (2008 г.) [3] и штамм «О» (199 г.) [2]; • подгруппа 1.2 — LT-Ivax LP (1991 г.) [5], IVAX (1991 г.) [5], 81658 (2010 г.) [5] и штамм «USDA»; а также в группу 1 включён штамм из Китая — LJS09 (2009 г.) [4].
    (check this in PDF content)

  6. Start
    12632
    Prefix
    Группа 1 предположительно включает две подгруппы: • подгруппа 1.1 — штаммы Сover (выделен приблизительно в 1958 г.) [6], Hudson (1962 г.) [6], Fowl laryngotracheitis (1991 г.)
    Exact
    [5]
    Suffix
    , Serva (точное время выделения этого штамма неизвестно) [6], 63140С08BR (2006 г.) [5], ACC78 (2008 г.) [3] и штамм «О» (199 г.) [2]; • подгруппа 1.2 — LT-Ivax LP (1991 г.) [5], IVAX (1991 г.) [5], 81658 (2010 г.) [5] и штамм «USDA»; а также в группу 1 включён штамм из Китая — LJS09 (2009 г.) [4].
    (check this in PDF content)

  7. Start
    12697
    Prefix
    Группа 1 предположительно включает две подгруппы: • подгруппа 1.1 — штаммы Сover (выделен приблизительно в 1958 г.) [6], Hudson (1962 г.) [6], Fowl laryngotracheitis (1991 г.) [5], Serva (точное время выделения этого штамма неизвестно)
    Exact
    [6]
    Suffix
    , 63140С08BR (2006 г.) [5], ACC78 (2008 г.) [3] и штамм «О» (199 г.) [2]; • подгруппа 1.2 — LT-Ivax LP (1991 г.) [5], IVAX (1991 г.) [5], 81658 (2010 г.) [5] и штамм «USDA»; а также в группу 1 включён штамм из Китая — LJS09 (2009 г.) [4].
    (check this in PDF content)

  8. Start
    12725
    Prefix
    Группа 1 предположительно включает две подгруппы: • подгруппа 1.1 — штаммы Сover (выделен приблизительно в 1958 г.) [6], Hudson (1962 г.) [6], Fowl laryngotracheitis (1991 г.) [5], Serva (точное время выделения этого штамма неизвестно) [6], 63140С08BR (2006 г.)
    Exact
    [5]
    Suffix
    , ACC78 (2008 г.) [3] и штамм «О» (199 г.) [2]; • подгруппа 1.2 — LT-Ivax LP (1991 г.) [5], IVAX (1991 г.) [5], 81658 (2010 г.) [5] и штамм «USDA»; а также в группу 1 включён штамм из Китая — LJS09 (2009 г.) [4].
    (check this in PDF content)

  9. Start
    12746
    Prefix
    Группа 1 предположительно включает две подгруппы: • подгруппа 1.1 — штаммы Сover (выделен приблизительно в 1958 г.) [6], Hudson (1962 г.) [6], Fowl laryngotracheitis (1991 г.) [5], Serva (точное время выделения этого штамма неизвестно) [6], 63140С08BR (2006 г.) [5], ACC78 (2008 г.)
    Exact
    [3]
    Suffix
    и штамм «О» (199 г.) [2]; • подгруппа 1.2 — LT-Ivax LP (1991 г.) [5], IVAX (1991 г.) [5], 81658 (2010 г.) [5] и штамм «USDA»; а также в группу 1 включён штамм из Китая — LJS09 (2009 г.) [4]. Группа 2: штаммы SA2 (1966 г.) [6] и А20 (1983 г.) [6].
    (check this in PDF content)

  10. Start
    12772
    Prefix
    Группа 1 предположительно включает две подгруппы: • подгруппа 1.1 — штаммы Сover (выделен приблизительно в 1958 г.) [6], Hudson (1962 г.) [6], Fowl laryngotracheitis (1991 г.) [5], Serva (точное время выделения этого штамма неизвестно) [6], 63140С08BR (2006 г.) [5], ACC78 (2008 г.) [3] и штамм «О» (199 г.)
    Exact
    [2]
    Suffix
    ; • подгруппа 1.2 — LT-Ivax LP (1991 г.) [5], IVAX (1991 г.) [5], 81658 (2010 г.) [5] и штамм «USDA»; а также в группу 1 включён штамм из Китая — LJS09 (2009 г.) [4]. Группа 2: штаммы SA2 (1966 г.) [6] и А20 (1983 г.) [6].
    (check this in PDF content)

  11. Start
    12818
    Prefix
    Группа 1 предположительно включает две подгруппы: • подгруппа 1.1 — штаммы Сover (выделен приблизительно в 1958 г.) [6], Hudson (1962 г.) [6], Fowl laryngotracheitis (1991 г.) [5], Serva (точное время выделения этого штамма неизвестно) [6], 63140С08BR (2006 г.) [5], ACC78 (2008 г.) [3] и штамм «О» (199 г.) [2]; • подгруппа 1.2 — LT-Ivax LP (1991 г.)
    Exact
    [5]
    Suffix
    , IVAX (1991 г.) [5], 81658 (2010 г.) [5] и штамм «USDA»; а также в группу 1 включён штамм из Китая — LJS09 (2009 г.) [4]. Группа 2: штаммы SA2 (1966 г.) [6] и А20 (1983 г.) [6]. Группа 3: штаммы CSW-1 (1970 г.) [7] и V1-99 (1999 г.) [7].
    (check this in PDF content)

  12. Start
    12838
    Prefix
    1 предположительно включает две подгруппы: • подгруппа 1.1 — штаммы Сover (выделен приблизительно в 1958 г.) [6], Hudson (1962 г.) [6], Fowl laryngotracheitis (1991 г.) [5], Serva (точное время выделения этого штамма неизвестно) [6], 63140С08BR (2006 г.) [5], ACC78 (2008 г.) [3] и штамм «О» (199 г.) [2]; • подгруппа 1.2 — LT-Ivax LP (1991 г.) [5], IVAX (1991 г.)
    Exact
    [5]
    Suffix
    , 81658 (2010 г.) [5] и штамм «USDA»; а также в группу 1 включён штамм из Китая — LJS09 (2009 г.) [4]. Группа 2: штаммы SA2 (1966 г.) [6] и А20 (1983 г.) [6]. Группа 3: штаммы CSW-1 (1970 г.) [7] и V1-99 (1999 г.) [7].
    (check this in PDF content)

  13. Start
    12859
    Prefix
    две подгруппы: • подгруппа 1.1 — штаммы Сover (выделен приблизительно в 1958 г.) [6], Hudson (1962 г.) [6], Fowl laryngotracheitis (1991 г.) [5], Serva (точное время выделения этого штамма неизвестно) [6], 63140С08BR (2006 г.) [5], ACC78 (2008 г.) [3] и штамм «О» (199 г.) [2]; • подгруппа 1.2 — LT-Ivax LP (1991 г.) [5], IVAX (1991 г.) [5], 81658 (2010 г.)
    Exact
    [5]
    Suffix
    и штамм «USDA»; а также в группу 1 включён штамм из Китая — LJS09 (2009 г.) [4]. Группа 2: штаммы SA2 (1966 г.) [6] и А20 (1983 г.) [6]. Группа 3: штаммы CSW-1 (1970 г.) [7] и V1-99 (1999 г.) [7]. Кроме того, одной из причин появления штаммов, образующих отдельные филогенетические ветви, является рекомбинация между штаммами разных филогенетических групп.
    (check this in PDF content)

  14. Start
    12939
    Prefix
    в 1958 г.) [6], Hudson (1962 г.) [6], Fowl laryngotracheitis (1991 г.) [5], Serva (точное время выделения этого штамма неизвестно) [6], 63140С08BR (2006 г.) [5], ACC78 (2008 г.) [3] и штамм «О» (199 г.) [2]; • подгруппа 1.2 — LT-Ivax LP (1991 г.) [5], IVAX (1991 г.) [5], 81658 (2010 г.) [5] и штамм «USDA»; а также в группу 1 включён штамм из Китая — LJS09 (2009 г.)
    Exact
    [4]
    Suffix
    . Группа 2: штаммы SA2 (1966 г.) [6] и А20 (1983 г.) [6]. Группа 3: штаммы CSW-1 (1970 г.) [7] и V1-99 (1999 г.) [7]. Кроме того, одной из причин появления штаммов, образующих отдельные филогенетические ветви, является рекомбинация между штаммами разных филогенетических групп.
    (check this in PDF content)

  15. Start
    12974
    Prefix
    1962 г.) [6], Fowl laryngotracheitis (1991 г.) [5], Serva (точное время выделения этого штамма неизвестно) [6], 63140С08BR (2006 г.) [5], ACC78 (2008 г.) [3] и штамм «О» (199 г.) [2]; • подгруппа 1.2 — LT-Ivax LP (1991 г.) [5], IVAX (1991 г.) [5], 81658 (2010 г.) [5] и штамм «USDA»; а также в группу 1 включён штамм из Китая — LJS09 (2009 г.) [4]. Группа 2: штаммы SA2 (1966 г.)
    Exact
    [6]
    Suffix
    и А20 (1983 г.) [6]. Группа 3: штаммы CSW-1 (1970 г.) [7] и V1-99 (1999 г.) [7]. Кроме того, одной из причин появления штаммов, образующих отдельные филогенетические ветви, является рекомбинация между штаммами разных филогенетических групп.
    (check this in PDF content)

  16. Start
    12994
    Prefix
    laryngotracheitis (1991 г.) [5], Serva (точное время выделения этого штамма неизвестно) [6], 63140С08BR (2006 г.) [5], ACC78 (2008 г.) [3] и штамм «О» (199 г.) [2]; • подгруппа 1.2 — LT-Ivax LP (1991 г.) [5], IVAX (1991 г.) [5], 81658 (2010 г.) [5] и штамм «USDA»; а также в группу 1 включён штамм из Китая — LJS09 (2009 г.) [4]. Группа 2: штаммы SA2 (1966 г.) [6] и А20 (1983 г.)
    Exact
    [6]
    Suffix
    . Группа 3: штаммы CSW-1 (1970 г.) [7] и V1-99 (1999 г.) [7]. Кроме того, одной из причин появления штаммов, образующих отдельные филогенетические ветви, является рекомбинация между штаммами разных филогенетических групп.
    (check this in PDF content)

  17. Start
    13031
    Prefix
    (точное время выделения этого штамма неизвестно) [6], 63140С08BR (2006 г.) [5], ACC78 (2008 г.) [3] и штамм «О» (199 г.) [2]; • подгруппа 1.2 — LT-Ivax LP (1991 г.) [5], IVAX (1991 г.) [5], 81658 (2010 г.) [5] и штамм «USDA»; а также в группу 1 включён штамм из Китая — LJS09 (2009 г.) [4]. Группа 2: штаммы SA2 (1966 г.) [6] и А20 (1983 г.) [6]. Группа 3: штаммы CSW-1 (1970 г.)
    Exact
    [7]
    Suffix
    и V1-99 (1999 г.) [7]. Кроме того, одной из причин появления штаммов, образующих отдельные филогенетические ветви, является рекомбинация между штаммами разных филогенетических групп. Так, например, штаммы CSW-1 и V1-99 [6, 7], ACC78 и СL9 [6, 3], и 1874C5 являются рекомбинантами [6] (рис. 2).
    (check this in PDF content)

  18. Start
    13053
    Prefix
    этого штамма неизвестно) [6], 63140С08BR (2006 г.) [5], ACC78 (2008 г.) [3] и штамм «О» (199 г.) [2]; • подгруппа 1.2 — LT-Ivax LP (1991 г.) [5], IVAX (1991 г.) [5], 81658 (2010 г.) [5] и штамм «USDA»; а также в группу 1 включён штамм из Китая — LJS09 (2009 г.) [4]. Группа 2: штаммы SA2 (1966 г.) [6] и А20 (1983 г.) [6]. Группа 3: штаммы CSW-1 (1970 г.) [7] и V1-99 (1999 г.)
    Exact
    [7]
    Suffix
    . Кроме того, одной из причин появления штаммов, образующих отдельные филогенетические ветви, является рекомбинация между штаммами разных филогенетических групп. Так, например, штаммы CSW-1 и V1-99 [6, 7], ACC78 и СL9 [6, 3], и 1874C5 являются рекомбинантами [6] (рис. 2).
    (check this in PDF content)

  19. Start
    13255
    Prefix
    Кроме того, одной из причин появления штаммов, образующих отдельные филогенетические ветви, является рекомбинация между штаммами разных филогенетических групп. Так, например, штаммы CSW-1 и V1-99
    Exact
    [6, 7]
    Suffix
    , ACC78 и СL9 [6, 3], и 1874C5 являются рекомбинантами [6] (рис. 2). Приведённое деление на филогенетические группы несколько отличается от представленного ранее K.R. Menendez и соавт. [6].
    (check this in PDF content)

  20. Start
    13275
    Prefix
    Кроме того, одной из причин появления штаммов, образующих отдельные филогенетические ветви, является рекомбинация между штаммами разных филогенетических групп. Так, например, штаммы CSW-1 и V1-99 [6, 7], ACC78 и СL9
    Exact
    [6, 3]
    Suffix
    , и 1874C5 являются рекомбинантами [6] (рис. 2). Приведённое деление на филогенетические группы несколько отличается от представленного ранее K.R. Menendez и соавт. [6]. В их работе штаммы, входящие в первую филогенетическую группу (рис. 2), разделены на две группы (клады).
    (check this in PDF content)

  21. Start
    13317
    Prefix
    Кроме того, одной из причин появления штаммов, образующих отдельные филогенетические ветви, является рекомбинация между штаммами разных филогенетических групп. Так, например, штаммы CSW-1 и V1-99 [6, 7], ACC78 и СL9 [6, 3], и 1874C5 являются рекомбинантами
    Exact
    [6]
    Suffix
    (рис. 2). Приведённое деление на филогенетические группы несколько отличается от представленного ранее K.R. Menendez и соавт. [6]. В их работе штаммы, входящие в первую филогенетическую группу (рис. 2), разделены на две группы (клады).
    (check this in PDF content)

  22. Start
    13454
    Prefix
    Так, например, штаммы CSW-1 и V1-99 [6, 7], ACC78 и СL9 [6, 3], и 1874C5 являются рекомбинантами [6] (рис. 2). Приведённое деление на филогенетические группы несколько отличается от представленного ранее K.R. Menendez и соавт.
    Exact
    [6]
    Suffix
    . В их работе штаммы, входящие в первую филогенетическую группу (рис. 2), разделены на две группы (клады). Учитывая то, что они более близки по отношению друг к другу, чем к другим филогенетическим группам, в данной работе выделили их в общую группу, но в отдельные подгруппы.
    (check this in PDF content)

  23. Start
    15243
    Prefix
    Картирование нуклеотидной последовательности полного генома штамма «О» вируса ИЛТ (относительно последовательности референтного штамма Serva HQ630064) с обозначением генов, их расположения в геноме и указанием направления считывания с них аминокислотной последовательности, а также отмечены сайты инициации репликации вирусной ДНК (oriS и oriL
    Exact
    [4]
    Suffix
    ) CHARACTERIZATION OF AVIAN ADENOVIRUS FAdV4/6/2009 ISOLATE ХАРАКТЕРИСТИКА ИЗОЛЯТА АДЕНОВИРУСА ПТИЦ FAdV4/6/2009 SUMMARY Avian adenovirus was isolated from livers of 154-day-old hens on one farm located in the Krasnodar Krai in 2009.
    (check this in PDF content)