The 24 reference contexts in paper A. Scherbakov V., А. Щербаков В. (2018) “Молекулярная эпизоотология ящура в России (филогенетический анализ российских изолятов вируса ящура) // FMD molecular epizootology in Russia (phylogenetic analysis *^ß of Russian FMDV isolates)” / spz:neicon:veterinary:y:2015:i:3:p:30-36

  1. Start
    2183
    Prefix
    В настоящее время в мире существует семь экосистем (пулов) ВЯ: 1 — Юго-Восточная Азия и Китай, 2 — Южная Азия, 3 — Ближний и Средний Восток, 4 — Западная и Центральная Африка, 5 — Восточная Африка, 6 — Южная Африка и 7 — Южная Америка
    Exact
    [18]
    Suffix
    . В каждом пуле циркулируют штаммы ВЯ, отличающиеся по генетическим и антигенным свойствам. Эти устойчивые генетические группы получили название топотипов (географических типов) [13, 17].
    (check this in PDF content)

  2. Start
    2378
    Prefix
    Восточная Азия и Китай, 2 — Южная Азия, 3 — Ближний и Средний Восток, 4 — Западная и Центральная Африка, 5 — Восточная Африка, 6 — Южная Африка и 7 — Южная Америка [18]. В каждом пуле циркулируют штаммы ВЯ, отличающиеся по генетическим и антигенным свойствам. Эти устойчивые генетические группы получили название топотипов (географических типов)
    Exact
    [13, 17]
    Suffix
    . В пределах каждого топотипа различают многочисленные генетические линии ВЯ. В России ящур не эндемичен, однако существует постоянная угроза заноса этой болезни из соседних азиатских стран.
    (check this in PDF content)

  3. Start
    2735
    Prefix
    В России ящур не эндемичен, однако существует постоянная угроза заноса этой болезни из соседних азиатских стран. Вспышки ящура, вызванные заносом инфекции извне, регистрировались в современной России в 1995, 2000, 2004–2006 и 2010–2014 гг.
    Exact
    [1, 2, 4, 5, 19, 20]
    Suffix
    . Для определения происхождения вирусов, ответственных за вспышки ящура, используется технология, предполагающая секвенирование и филогенетический анализ нуклеотидных последовательностей гена VP1.
    (check this in PDF content)

  4. Start
    3067
    Prefix
    Для определения происхождения вирусов, ответственных за вспышки ящура, используется технология, предполагающая секвенирование и филогенетический анализ нуклеотидных последовательностей гена VP1. Впервые данный подход в исследованиях ящура применили в 1987 г. E. Beck и K. Strohmaier
    Exact
    [9]
    Suffix
    . В РФ филогенетический анализ применяется в эпизоотологических исследованиях ящура с начала 90-х гг. прошлого века [14]. Филогенетические исследования позволяют не только устанавливать происхождение ВЯ, вызвавшего вспышку болезни, но и отслеживать пути распространения эпизоотий, а также изучать процесс эволюции и смены штаммов/генетических линий в регионах, где вир
    (check this in PDF content)

  5. Start
    3200
    Prefix
    Впервые данный подход в исследованиях ящура применили в 1987 г. E. Beck и K. Strohmaier [9]. В РФ филогенетический анализ применяется в эпизоотологических исследованиях ящура с начала 90-х гг. прошлого века
    Exact
    [14]
    Suffix
    . Филогенетические исследования позволяют не только устанавливать происхождение ВЯ, вызвавшего вспышку болезни, но и отслеживать пути распространения эпизоотий, а также изучать процесс эволюции и смены штаммов/генетических линий в регионах, где вирус ящура эндемичен.
    (check this in PDF content)

  6. Start
    4009
    Prefix
    Патматериал поступил в ФГБУ «ВНИИЗЖ» в 1995–2014 гг. из различных регионов РФ. Выделение РНК. РНК выделяли из 10%-й суспензии эпителия методом аффинной сорбции на стекловолокнистых фильтрах, как описано ранее
    Exact
    [7]
    Suffix
    . Обратная транскрипция и полимеразная цепная реакция (ОТ-ПЦР). Амплификацию гена VP1 проводили методом ОТ-ПЦР в соответствии с «Методическими указаниями по индикации генома и штаммовой дифференциации вируса ящура методом полимеразной цепной реакции и секвенированием гена VP1» [3].
    (check this in PDF content)

  7. Start
    4310
    Prefix
    Амплификацию гена VP1 проводили методом ОТ-ПЦР в соответствии с «Методическими указаниями по индикации генома и штаммовой дифференциации вируса ящура методом полимеразной цепной реакции и секвенированием гена VP1»
    Exact
    [3]
    Suffix
    . Секвенирование. В 1995–2006 гг. секвенирование ПЦР-продуктов проводили с использованием набора fmol DNA Cycle Sequencing System (Promega, США) в соответствии с рекомендациями фирмы-производителя.
    (check this in PDF content)

  8. Start
    5796
    Prefix
    Этот топотип эндемичен в КНР и имеет уникальную биологическую особенность: в отличие от всех других топотипов ВЯ он поражает только свиней и не способен вызывать клиническое заболевание у крупного и мелкого рогатого скота
    Exact
    [8]
    Suffix
    . Полученная в результате филогенетического анализа информация о китайском происхождении подмосковного изолята позволила оперативно установить источник инфекции: им оказалась свинина, которую импортировал из КНР подмосковный мясокомбинат, расположенный в непосредственной близости от хозяйства «Петровское».
    (check this in PDF content)

  9. Start
    6775
    Prefix
    К 2000 г. паназиатский штамм вызвал вспышки ящура практически во всех азиатских странах, в том числе в Монголии, Южной Корее и Японии, где болезнь регистрировалась до этого в 1973, 1934 и 1908 гг. соответственно
    Exact
    [11]
    Suffix
    . В связи с тем, что панзоотия, обусловленная этим вирусом, охватила весь Азиатский континент, штамм и получил название «ПанАзия». В 2001 г. паназиатский штамм был занесен в Западную Европу и вызвал опустошительную эпизоотию в Великобритании.
    (check this in PDF content)

  10. Start
    9547
    Prefix
    Учитывая географию вспышки, можно предполагать, что и в этом случае ящур на территорию РФ был занесен из Китая. В 2005 г. вспышки ящура были зарегистрированы в Амурской области (1 очаг), Хабаровском крае (4 очага) и Приморском крае (9 очагов) РФ
    Exact
    [6]
    Suffix
    . Все они были вызваны экзотическим для России серотипом Азия-1 ВЯ. Филогенетический анализ показал, что все российские изоляты генетически очень близки вирусу, вызвавшему в 2005–2006 гг. масштабную эпизоотию ящура этого типа в Китае (рис. 2) [16].
    (check this in PDF content)

  11. Start
    9818
    Prefix
    Все они были вызваны экзотическим для России серотипом Азия-1 ВЯ. Филогенетический анализ показал, что все российские изоляты генетически очень близки вирусу, вызвавшему в 2005–2006 гг. масштабную эпизоотию ящура этого типа в Китае (рис. 2)
    Exact
    [16]
    Suffix
    . Это доказывает, что вспышки ящура типа Азия-1 в РФ в 2005 г. были вызваны заносом болезни с территории КНР. В 2006 г. в России были зарегистрированы еще две вспышки ящура типа Азия-1: по одному очагу в Читинской и Амурской областях.
    (check this in PDF content)

  12. Start
    10694
    Prefix
    Макарово Шилкинского района. Филогенетический анализ изолятов, ответственных за эти вспышки, показал, что они относятся к генетической линии Mya-98 (Мьянма-98) топотипа SEA (ЮгоВосточная Азия) серотипа О
    Exact
    [10]
    Suffix
    , но к разным сублиниям (рис. 1). Изолят из с. Абагайтуй (на рис. 1 он обозначен как O/Zabaikalskiy/1/RUS/2010) имел очень близкое генетическое родство с вирусом, вызвавшим в 2009 г. многочисленные вспышки ящура во Вьетнаме, а в 2010 г. — в Китае, Южной Корее и Японии.
    (check this in PDF content)

  13. Start
    14786
    Prefix
    Из сообщений Всемирной референтной лаборатории по ящуру (WRL-FMD, Пирбрайт, Великобритания) известно, что в 2010 г. штамм O-PanAsia вызвал многочисленные вспышки ящура во Вьетнаме, Камбодже и Лаосе
    Exact
    [20]
    Suffix
    . Вероятно, именно из Юго-Восточной Азии этот вирус попал в 2011 г. в Китай, откуда затем был занесен в Восточный Казахстан (в августе 2011 г. и мае 2012 г.) и в Приморский край РФ. Очень сложная ситуация по ящуру наблюдалась в РФ в 2013 г.
    (check this in PDF content)

  14. Start
    15922
    Prefix
    Эта генетическая линия впервые была выявлена в Иране в 2003 г., в течение 2005–2006 гг. она распространилась по всей территории Ближнего Востока и доминирует в этом регионе до настоящего времени
    Exact
    [15, 20]
    Suffix
    . За эти годы вирус значительно дивергировал, и в пределах генетической линии возникло множество сублиний. Большинство сублиний после появления быстро исчезает, однако некоторые сохраняются и доминируют в течение какого-то времени [12].
    (check this in PDF content)

  15. Start
    16188
    Prefix
    За эти годы вирус значительно дивергировал, и в пределах генетической линии возникло множество сублиний. Большинство сублиний после появления быстро исчезает, однако некоторые сохраняются и доминируют в течение какого-то времени
    Exact
    [12]
    Suffix
    . Начиная с 2011 г., в Турции доминирует сублиния SIS-10 ВЯ A/Iran-05 [15]. Именно к этой сублинии принадлежали и все российские изоляты, ответственные за вспышки ящура на Северном Кавказе в 2013 г. [20].
    (check this in PDF content)

  16. Start
    16270
    Prefix
    Большинство сублиний после появления быстро исчезает, однако некоторые сохраняются и доминируют в течение какого-то времени [12]. Начиная с 2011 г., в Турции доминирует сублиния SIS-10 ВЯ A/Iran-05
    Exact
    [15]
    Suffix
    . Именно к этой сублинии принадлежали и все российские изоляты, ответственные за вспышки ящура на Северном Кавказе в 2013 г. [20]. Занос ящура на территорию Северного Кавказа непосредственно из Турции маловероятен.
    (check this in PDF content)

  17. Start
    16400
    Prefix
    Начиная с 2011 г., в Турции доминирует сублиния SIS-10 ВЯ A/Iran-05 [15]. Именно к этой сублинии принадлежали и все российские изоляты, ответственные за вспышки ящура на Северном Кавказе в 2013 г.
    Exact
    [20]
    Suffix
    . Занос ящура на территорию Северного Кавказа непосредственно из Турции маловероятен. Несмотря на то, что страны Закавказья официально не сообщают о вспышках ящура на своей территории, возможно, что ВЯ A/Iran-05SIS10 получил распространение в Закавказье, откуда, вероятно, и был занесен на территорию России.
    (check this in PDF content)

  18. Start
    17674
    Prefix
    Дендрограмма основана на сравнении полных нуклеотидных последовательностей гена VP1 линия эндемична в странах Юго-Восточной Азии: Вьетнаме, Таиланде, Малайзии и др. Из сообщений Всемирной организации здравоохранения животных (МЭБ)
    Exact
    [19]
    Suffix
    и Всемирной референтной лаборатории по ящуру (WRL-FMD, Пирбрайт, Великобритания) [20] известно, что в 2013 г. этот вирус вышел за пределы своего естественного ареала и был занесен в Китай.
    (check this in PDF content)

  19. Start
    17770
    Prefix
    Дендрограмма основана на сравнении полных нуклеотидных последовательностей гена VP1 линия эндемична в странах Юго-Восточной Азии: Вьетнаме, Таиланде, Малайзии и др. Из сообщений Всемирной организации здравоохранения животных (МЭБ) [19] и Всемирной референтной лаборатории по ящуру (WRL-FMD, Пирбрайт, Великобритания)
    Exact
    [20]
    Suffix
    известно, что в 2013 г. этот вирус вышел за пределы своего естественного ареала и был занесен в Китай. Сравнение, проведенное с использованием банка нуклеотидных последовательностей WRL-FMD, показало, что российские изоляты из Забайкалья и Амурской области имеют максимальное генетическое родство (до 99,65%) именно с китайскими изолятами 2013 г. [20].
    (check this in PDF content)

  20. Start
    18162
    Prefix
    Сравнение, проведенное с использованием банка нуклеотидных последовательностей WRL-FMD, показало, что российские изоляты из Забайкалья и Амурской области имеют максимальное генетическое родство (до 99,65%) именно с китайскими изолятами 2013 г.
    Exact
    [20]
    Suffix
    . Это доказывает, что занос ящура в Забайкальский край и Амурскую область РФ произошел с территории Китая. Помимо России вспышки ящура, обусловленные ВЯ A/ Sea-97, были зарегистрированы в 2013 г. в Восточном Казахстане и Монголии.
    (check this in PDF content)

  21. Start
    20956
    Prefix
    Филогенетические исследования, проведенные во Всемирной референтной лаборатории по ящуру (Пирбрайт, Великобритания), показали, что китайские изоляты на 98–99% идентичны вирусу, выделенному в Индии еще в 1980–1981 гг.
    Exact
    [20]
    Suffix
    . Этот факт очень необычен. ВЯ обладает очень высокой скоростью мутационной изменчивости, и вероятность его сохранения в естественных условиях в течение 25 лет практически в неизменном состоянии исключена.
    (check this in PDF content)

  22. Start
    24184
    Prefix
    Этот топотип имеет уникальную особенность. Он способен поражать только свиней и, в отличие от всех других топотипов вируса ящура, не вызывает клинического заболевания у рогатого скота
    Exact
    [8]
    Suffix
    . В связи с этим способность к панзоотическому распространению китайского топотипа ВЯ невысока, и он не представлял большой опасности для стран — северных соседей КНР. Второй фактор, определявший благополучие стран Дальнего Востока по ящуру в ХХ веке, связан с уровнем социально-экономического развития Китая.
    (check this in PDF content)

  23. Start
    26321
    Prefix
    Вакцины, изготовленные по этой технологии, могут содержать не полностью инактивированный вирус и таким образом вызывать поствакцинальный ящур. Так, E. Beck и K. Strohmaier показали, что большинство эпизоотий и отдельных вспышек ящура в Западной Европе в период 1964–1984 гг. имели поствакцинальное происхождение
    Exact
    [9]
    Suffix
    . На поствакцинальный характер эпизоотии ящура типа Азия-1 в Китае в 2005 г. указывают и особенности ее распространения. Многочисленные вспышки ящура начали регистрироваться практически одновременно (в апреле–мае 2005 г.) в различных провинциях КНР [19], что невозможно при естественном распространении болезни, однако вполне объясняется проведением повсеместной вакцина
    (check this in PDF content)

  24. Start
    26589
    Prefix
    На поствакцинальный характер эпизоотии ящура типа Азия-1 в Китае в 2005 г. указывают и особенности ее распространения. Многочисленные вспышки ящура начали регистрироваться практически одновременно (в апреле–мае 2005 г.) в различных провинциях КНР
    Exact
    [19]
    Suffix
    , что невозможно при естественном распространении болезни, однако вполне объясняется проведением повсеместной вакцинации. Китаю потребовалось несколько лет, чтобы ликвидировать катастрофические последствия этой вакцинации: ящур типа Азия-1 удалось ликвидировать лишь в 2009 г.
    (check this in PDF content)