The 11 references in paper A. Karpenko P., K. Matveeva O., V. Bulanov A., А. Карпенко П., В. Буланов А., К. Матвеева О. (2016) “Решение задачи молекулярного докинга модифицированным методом роя частиц // Solving a molecular docking problem by the modified PSO method” / spz:neicon:technomag:y:2014:i:4:p:339-353

1
Ewing T.J., Makino S., Skillman A.G., Kuntz I.D. DOCK 4.0: search strategies for automated molecular docking of flexible molecule databases // Journal of Computer-Aided Molecular Design. 2001. Vol. 15. P. 411-428.
(check this in PDF content)
2
Verdonk M.L., Cole J. C., Hartshorn M.J., Murray C. W., Taylor R.D. Improved proteinligand docking using GOLD // Proteins: Structure, Function and Genetics. 2003. Vol. 52. P. 609-623.
(check this in PDF content)
3
Thomsen R., Christensen M.H. MolDock: A New Technique for High-Accuracy Molecular Docking // Journal of Medicinal Chemistry. 2006. Vol. 49, no. 11. P. 3315-3321.
(check this in PDF content)
4
Романов А.Н., Кондакова О.А., Григорьев Ф.В., Сулимов А.В., Лущекина С.В., Мартынов Я.Б., Сулимов В.Б. Компьютерный дизайн лекарственных средств: программа докинга SOL // Вычислительные методы и программирование. 2008. Т. 9. C. 213-233.
(check this in PDF content)
5
Chen H.-M., Liu B.-F., Huang H.-L., Hwang S.-F., Ho S.-Y. SODOCK: Swarm optimization for highly flexible protein-ligand docking // Journal of Computational Chemistry. 2007. Vol. 28, no. 2. P. 612-623.
(check this in PDF content)
6
Namasivayam V., G ̈unther R. pso@autodock: a fast flexible molecular docking program based on Swarm intelligence // Chemical Biology & Drug Design. 2007. Vol. 70, no. 6. P. 475-484. DOI: 10.1111/j.1747-0285.2007.00588.x
(check this in PDF content)
7
Halgren T. Merck Molecular Force Field. I. Basis, Form, Scope, Parameterization, and Performance of MMFF94 // Journal of Computational Chemistry. 1996. Vol. 17. P. 490-519.
(check this in PDF content)
8
Карпенко А.П., Селиверстов Е.Ю. Глобальная оптимизация методом роя частиц. Обзор // Информационные технологии. 2010. No 2. С. 25-34.
(check this in PDF content)
9
Tang K., Yao X., Suganthan P.N., MacNish C., Chen Y.P., Chen C.M., Yang Z. Benchmark Functions for the CEC’2008 Special Session and Competition on Large Scale Global Optimization: Technical Report // Nature Inspired Computation and Applications Laboratory, USTC, China, 2007. Available at: http://sci2s.ugr.es/eamhco/cec2010_functions.pdf , accessed 01.03.2014.
(check this in PDF content)
10
HIV-1 Протеаза // База знаний по биологии человека: сайт. Режим доступа: http://humbio.ru/humbio/peptides/00060494.htm (дата обращения 01.03.2014).
(check this in PDF content)
11
Eiben A.E., Michalewicz Z., Schoenauer M., Smith J.E. Parameter Control in Evolutionary Algorithms // Parameter Setting in Evolutionary Algorithms. Springer Berlin Heidelberg, 2007. P. 19-46. DOI: 10.1007/978-3-540-69432-8_2
(check this in PDF content)