The 16 references with contexts in paper E. Anaev Kh., Э. Анаев Х. (2017) “Современные представления об идиопатическом легочном фиброзе: в фокусе – биомаркеры // Current concepts of idiopathic pulmonary fibrosis: focus on biomarkers” / spz:neicon:pulmonology:y:2017:i:1:p:56-64

1
Hutchinson J., Fogarty A., Hubbard R., McKeever T. Global incidence and mortality of idiopathic pulmonary fibrosis: a systematic review. Eur. Respir. J. 2015; 46 (3): 795–806. DOI: 10.1183/09031936.00185114.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=5501
    Prefix
    Russian Pulmonology. 2017; 27 (1): 56–64 (in Russian). DOI: 10.18093/0869-0189-2017-27-1-56-64 Идиопатический легочный фиброз (ИЛФ) – хроническое прогрессирующее заболевание с неблагоприятным прогнозом
    Exact
    [1]
    Suffix
    . Хотя этиология и патогенез ИЛФ до сих пор изучены недостаточно, эффективность в замедлении прогрессирования заболевания показали 2 противофиброзных препарата – пирфенидон и нинтеданиб [2–4].

2
King T.E., Bradford W.Z., Castro-Bernardini S. et al. A phase 3 trial of pirfenidone in patients with idiopathic pulПульмонология. 2017; 27 (1): 56–64. DOI: 10.18093/0869301893201732731356364 monary fibrosis. N. Engl. J. Med.2014; 370 (22): 2083–2092. DOI: 10.1056/NEJMoa1402582.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=5704
    Prefix
    Хотя этиология и патогенез ИЛФ до сих пор изучены недостаточно, эффективность в замедлении прогрессирования заболевания показали 2 противофиброзных препарата – пирфенидон и нинтеданиб
    Exact
    [2–4]
    Suffix
    . Последние разработки в области постгеномных технологий положили начало Пульмонология. 2017; 27 (1): 56–64. DOI: 10.18093/0869301893201732731356364 системной биологии, благодаря которой появились не только персонализированная медицина, обладающая огромным потенциалом, но и новые идеи в понимании и лечении ИЛФ [4, 5].

3
Richeldi L., du Bois R.M., Raghu G. et al. Efficacy and safety of nintedanib in idiopathic pulmonary fibrosis. N. Engl. J. Med.2014; 370 (22): 2071–2082. DOI: 10.1056/ NEJMoa1402584.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=5704
    Prefix
    Хотя этиология и патогенез ИЛФ до сих пор изучены недостаточно, эффективность в замедлении прогрессирования заболевания показали 2 противофиброзных препарата – пирфенидон и нинтеданиб
    Exact
    [2–4]
    Suffix
    . Последние разработки в области постгеномных технологий положили начало Пульмонология. 2017; 27 (1): 56–64. DOI: 10.18093/0869301893201732731356364 системной биологии, благодаря которой появились не только персонализированная медицина, обладающая огромным потенциалом, но и новые идеи в понимании и лечении ИЛФ [4, 5].

4
Woodcock H.V., Maher T.M. The treatment of idiopathic pulmonary fibrosis. F1000Prime Rep.2014; 6: 16. DOI: 10.12703/P6-16.
Total in-text references: 2
  1. In-text reference with the coordinate start=5704
    Prefix
    Хотя этиология и патогенез ИЛФ до сих пор изучены недостаточно, эффективность в замедлении прогрессирования заболевания показали 2 противофиброзных препарата – пирфенидон и нинтеданиб
    Exact
    [2–4]
    Suffix
    . Последние разработки в области постгеномных технологий положили начало Пульмонология. 2017; 27 (1): 56–64. DOI: 10.18093/0869301893201732731356364 системной биологии, благодаря которой появились не только персонализированная медицина, обладающая огромным потенциалом, но и новые идеи в понимании и лечении ИЛФ [4, 5].

  2. In-text reference with the coordinate start=6041
    Prefix
    DOI: 10.18093/0869301893201732731356364 системной биологии, благодаря которой появились не только персонализированная медицина, обладающая огромным потенциалом, но и новые идеи в понимании и лечении ИЛФ
    Exact
    [4, 5]
    Suffix
    . В данном обзоре обсуждаются биомаркеры ИЛФ, при использовании которых улучшается диагностика и выявляются потенциально новые терапевтические мишени и предикторы ответа на лечение.

5
Pathak R.R., DavéV. Integrating omics technologies to study pulmonary physiology and pathology at the systems level. Cell Physiol. Biochem. 2014; 33 (5): 1239–1260. DOI: 10.1159/000358693.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=6041
    Prefix
    DOI: 10.18093/0869301893201732731356364 системной биологии, благодаря которой появились не только персонализированная медицина, обладающая огромным потенциалом, но и новые идеи в понимании и лечении ИЛФ
    Exact
    [4, 5]
    Suffix
    . В данном обзоре обсуждаются биомаркеры ИЛФ, при использовании которых улучшается диагностика и выявляются потенциально новые терапевтические мишени и предикторы ответа на лечение.

6
Raghu G., Collard H.R., Egan J.J. et al. An official ATS/ERS/JRS/ALAT statement: idiopathic pulmonary fibrosis: evidence-based guidelines for diagnosis and management. Am. J. Respir. Crit. Care Med.2011; 183 (6): 788–824. DOI: 10.1164/rccm.2009-040GL.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=6674
    Prefix
    В данном руководстве определены точные диагностические критерии, основанные на клинических, рентгенологических и морфологических особенностях, а также место междисциплинарного обсуждения среди пульмонологов, рентгенологов и патологоанатомов в качестве «золотого стандарта» диагностики ИЛФ
    Exact
    [6, 7]
    Suffix
    . Диагноз ИЛФ в 2/3случаев устанавливается на основе соответствующей клинической картины и типичной картины обычной интерстициальной пневмонии (ОИП) при мультиспиральной компьютерной томографии (МСКТ).

7
Чучалин А.Г., Авдеев С.Н., Айсанов З.Р. и др. Диагностика и лечение идиопатического легочного фиброза. Федеральные клинические рекомендации. Пульмоно( логия. 2016; 26 (4): 399–419. DOI: 10.18093/0869-01892016-26-4-399-419. / Chuchalin A.G., Avdeev S.N., Aisanov Z.R. et al. Diagnosis and Treatment of Idiopathic Pulmonary Fibrosis. Federal Guidelines. Pul'monologiya. 2016; 26 (4): 399–419 (in Russian). DOI: 10.18093/08690189-2016-26-4-399-419.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=6674
    Prefix
    В данном руководстве определены точные диагностические критерии, основанные на клинических, рентгенологических и морфологических особенностях, а также место междисциплинарного обсуждения среди пульмонологов, рентгенологов и патологоанатомов в качестве «золотого стандарта» диагностики ИЛФ
    Exact
    [6, 7]
    Suffix
    . Диагноз ИЛФ в 2/3случаев устанавливается на основе соответствующей клинической картины и типичной картины обычной интерстициальной пневмонии (ОИП) при мультиспиральной компьютерной томографии (МСКТ).

8
Hutchinson J.P., Fogarty A.W., McKeever T.M., Hubbard R.B. In-hospital mortality after surgical lung biopsy for interstitial lung disease in the United States. 2000 to 2011. Am. J. Respir. Crit. Care Med. 2016; 193 (10): 1161–1167. DOI: 10.1164/rccm.201508-1632OC.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=7220
    Prefix
    В сложных клинических случаях и нетипичной картине МСКТ для гистологического подтверждения диагноза ОИП рекомендуется проведение открытой (хирургической) биопсии легкого, которая из-за риска прогрессирования заболевания противопоказана тяжелым больным и пожилым пациентам с сопутствующими патологиями
    Exact
    [8]
    Suffix
    . Даже в специализированных крупных центрах диагноз «неклассифицируемое интерстициальное заболевание легких» (ИЗЛ) устанавливается у 10 % больных с первоначально выявленным прогрессирующим легочным фиброзом [9].

9
Ryerson C.J., Urbania T.H., Richeldi L. et al. Prevalence and prognosis of unclassifiable interstitial lung disease.Eur. Respir. J.2013; 42 (3): 750–757. DOI: 10.1183/09031936. 00131912. 17. Ley B., Bradford W.Z., Weycker D. et al. Unified baseline and longitudinal mortality prediction in idiopathic pulmonary fibrosis. Eur. Respir. J. 2015; 45 (5): 1374–1381. 18. Kolb M., Collard H.R. Staging of idiopathic pulmonary fibrosis: past, present and future.Eur. Respir. Rev.2014; 23 (132): 220–224. DOI: 10.1183/09059180.00002114. 19. Ley B., Brown K.K., Collard H.R. Molecular biomarkers in idiopathic pulmonary fibrosis. Am. J. Physiol. Lung Cell Mol. Physiol. 2014; 307 (9): L681–691. DOI: 10.1152/ajplung. 00014.2014. 20. Spagnolo P., Tzouvelekis A., Maher
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=7449
    Prefix
    Даже в специализированных крупных центрах диагноз «неклассифицируемое интерстициальное заболевание легких» (ИЗЛ) устанавливается у 10 % больных с первоначально выявленным прогрессирующим легочным фиброзом
    Exact
    [9]
    Suffix
    . В недавнем исследовании с участием пациентов (n= 117) с фиброзирующими ИЗЛ показано, что бронхоскопическая криобиопсия легкого может оказаться безопасной и эффективной в получении адекватных образцов легочной ткани для диагностики ИЛФ [10].

10
1097/MCP.0000000000000187. 21. Han M.K., Zhou Y., Murray S. et al. Lung microbiome and disease progression in idiopathic pulmonary fibrosis: an analysis of the COMET study.Lancet Respir. Med.2014; 2 (7): 548–556. DOI: 10.1016/S2213-2600(14)70069-4. 22. Jenkins R.G., Simpson J.K., Saini G. et al. Longitudinal change in collagen degradation biomarkers in idiopathic pulmonary fibrosis: an analysis from the prospective, multicentre PROFILE study. Lancet Respir. Med. 2015; 3 (6): 462–472. DOI: 10.1016/S2213-2600(15)00048-X. 23. Noth I., Zhang Y., Ma S.F. et al. Genetic variants associated with idiopathic pulmonary fibrosis susceptibility and mortality: a genome-wide association study.Lancet Respir. Med. 2013; 1 (4): 309–317. 24. Stock C.J., Sato H
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=7705
    Prefix
    В недавнем исследовании с участием пациентов (n= 117) с фиброзирующими ИЗЛ показано, что бронхоскопическая криобиопсия легкого может оказаться безопасной и эффективной в получении адекватных образцов легочной ткани для диагностики ИЛФ
    Exact
    [10]
    Suffix
    . Эта малоинвазивная методика представляет собой альтернативу открытой биопсии легкого и в ближайшее время будет включена в алгоритм диагностики ИЛФ и других фиброзирующих ИЗЛ. Основным патогенетическим механизмом ИЛФ 20 лет назад считалось хроническое воспаление, предшествующее прогрессирующему фиброзу.

11
King T.E., Pardo A., Selman M. Idiopathic pulmonary fibrosis. Lancet. 2011; 378 (9807): 1949–1961. DOI: 10.1016/S0140-6736(11)60052-4.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=8295
    Prefix
    В последнее десятилетие признано, что у лиц, имеющих генетическую предрасположенность, фиброзирование обусловлено персистирующими или периодическими микротравмами альвеолярного эпителия (например, сигаретным дымом, микроаспирацией или инфекцией)
    Exact
    [11]
    Suffix
    . По результатам многочисленных исследований показано, что повреждение альвеолярных эпителиальных клеток сопровождается внесосудистым свертыванием и активацией иммунной системы [12].

12
Ahluwalia N., Shea B.S., Tager A.M. New therapeutic targets in idiopathic pulmonary fibrosis. Aiming to rein in runaway wound-healing responses. Am. J. Respir. Crit. Care Med.2014; 190 (8): 867–878. DOI: 10.1164/rccm.201403-0509PP.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=8495
    Prefix
    предрасположенность, фиброзирование обусловлено персистирующими или периодическими микротравмами альвеолярного эпителия (например, сигаретным дымом, микроаспирацией или инфекцией) [11]. По результатам многочисленных исследований показано, что повреждение альвеолярных эпителиальных клеток сопровождается внесосудистым свертыванием и активацией иммунной системы
    Exact
    [12]
    Suffix
    . Альвеолярные эпителиальные клетки индуцируют миграцию и пролиферацию фибробластов, приток циркулирующих фиброцитов в очаг повреждения и способствуют дифференцировке фибробластов в миофибробласты.

13
Wolters P.J., Collard H.R., Jones K.D. Pathogenesis of idiopathic pulmonary fibrosis. Annu. Rev. Pathol.2014; 9: 157– 179. DOI: 10.1146/annurev-pathol-012513-104706.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=9617
    Prefix
    Основным из них является трансформирующий фактор роста-β(TGF-β) – мощный профибротический медиатор, участвующий в рекрутировании клеток, дифференциации миофибробластов и индукции продукции внеклеточного матрикса
    Exact
    [13]
    Suffix
    (см. рисунок). Ранние манифестации ИЛФ в отсутствие биопсии часто трудно отличить от других ИЗЛ. Кроме того, ОИП – гистологический признак ИЛФ – встречается и при других ИЗЛ. Имеющиеся в настоящее время клинические данные не позволяют точно прогнозировать болезнь, прогрессирование которой может протекать как медленно, так и быстро, а в 5 % случаев может осложняться обос

14
Maher T.M. Beyond the diagnosis of idiopathic pulmonary fibrosis; the growing role of systems biology and stratified medicine. Curr. Opin. Pulm. Med. 2013; 19 (5): 460–465. DOI: 10.1097/MCP.0b013e328363f4b7.
Total in-text references: 2
  1. In-text reference with the coordinate start=11371
    Prefix
    Эти проблемы подчеркивают необходимость поиска и валидизации диагностических биомаркеров, специфичных для ИЛФ, и прогностических биомаркеров течения болезни в процессе лечения, в т. ч. при направлении на трансплантацию
    Exact
    [14]
    Suffix
    . После регистрации пирфенидона и нинтеданиба и выявления новых потенциальных терапевтических мишеней появилась необходимость в поиске терагностических маркеров – биомаркеров, способных оценить эффективность препарата в начале лечения.

  2. In-text reference with the coordinate start=13825
    Prefix
    или метаболитов, что способствовало появлению системной биологии – междисциплинарного подхода, основанного на интеграции моделей, направленных на изучение биологических систем в целом. Такое масштабное моделирование позволит выявить специфические молекулярные фенотипы ИЛФ, которые в будущем могут быть использованы для улучшения диагностики и при подборе лечения
    Exact
    [14]
    Suffix
    . Идеальные молекулярные биомаркеры, отражающие ключевые патологические механизмы ИЛФ, могут быть легко и точно измерены и валидизированы [19]. Стратификация и индивидуализированное лечение ИЛФ могут основываться на использовании молекулярных биомаркеров в клинической практике.

15
du Bois R.M., Weycker D., Albera C. et al. Forced vital capacity in patients with idiopathic pulmonary fibrosis: test properties and minimal clinically important difference. Am. J. Respir. Crit. Care Med.2011; 184(12): 1382–1389.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=12422
    Prefix
    Динамическое изменение форсированной жизненной емкости легких (ФЖЕЛ) и диффузионной способности легких (DLСО) являются лучшими прогностическими факторами по сравнению с исходными значениями. При снижении ФЖЕЛ на 5–10 % в течение 6 мес. смертность в течение последующего года увеличивается более чем в 2 раза
    Exact
    [15]
    Suffix
    . К независимым предикторам смерти также относятся показатели 6-минутного шагового теста и его изменение в течение 6 мес. [16]. Кроме того, при оценке прогноза необходимо учитывать интеграцию различных клинических, физиологических и рентгенологических данных при ИЛФ [17], которые, однако, не могут достоверно предсказать прогноз болезни или ответ на лечение и не позволяют выявить м

16
du Bois R.M., Albera C., Bradford W.Z. et al. 6-Minute walk distance is an independent predictor of mortality in patients with idiopathic pulmonary fibrosis. Eur. Respir. J. 2014; 43 (5): 1421–1429. http:// journal.pulmonology.ru/pulm
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=12549
    Prefix
    При снижении ФЖЕЛ на 5–10 % в течение 6 мес. смертность в течение последующего года увеличивается более чем в 2 раза [15]. К независимым предикторам смерти также относятся показатели 6-минутного шагового теста и его изменение в течение 6 мес.
    Exact
    [16]
    Suffix
    . Кроме того, при оценке прогноза необходимо учитывать интеграцию различных клинических, физиологических и рентгенологических данных при ИЛФ [17], которые, однако, не могут достоверно предсказать прогноз болезни или ответ на лечение и не позволяют выявить молекулярные фенотипы болезни.