The 18 references with contexts in paper V. Konenkov I., V. Prokof’ev F., A. Shevchenko V., O. Golovanova V., E. Zonova V., M. Korolev A., J. Leonova B., В. Коненков И., В. Прокофьев Ф., А. Шевченко В., О. Голованова В., Е. Зонова В., М. Королев А., Ю. Леонова Б. (2014) “КОМПЛЕКСНЫЙ АНАЛИЗ ПОЛИМОРФИЗМА В ПРОМОТОРНЫХ УЧАСТКАХ ГЕНОВ ЦИТОКИНОВ IL-1B T-31C, IL-6 G-174C, TNFA G-238A, TNFA G-308A, TNFA C-863A, IL-4 C-590T И IL-10 C-592α В ПРОГНОЗЕ ЭФФЕКТА ОТ ЛЕЧЕНИЯ РЕВМАТОИДНОГО АРТРИТА // COMBINATION ANALYSIS OF CYTOKINE GENE PROMOTER POLYMORPHISMS OF IL1B T-31C, IL-6 G-174C, TNFA G-238A, TNFA G-308A, TNFA C-863A, IL4 C-590T, IL-10 C-592A FOR PREDICTION OF TREATMENT EFFICIENCY IN RHEUMATOID ARTHRITIS” / spz:neicon:mimmun:y:2010:i:5:p:361-374

1
Вейр Б. Анализ генетических данных: Дискретные генетические признаки: пер. с англ. – М.: Мир, 1995. – 400 с.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=11667
    Prefix
    Частоту аллелей генов цитокинов вычисляли методом прямого подсчета по формуле: f = n/2N, где n – количество раз встречаемости аллеля (у гомозигот он учитывался дважды), 2N – удвоенная численность обследованных. Распределение генотипов по исследованным полиморфным локусам проверяли на соответствие равновесию Харди–Вайнберга согласно рекомендациям Вейр Б.
    Exact
    [1]
    Suffix
    . Частоту встречаемости отдельных генотипов и их комбинаций определяли как процентное отношение индивидов, несущих генотип (комбинацию генотипов), к общему числу обследованных в группе по формуле: f = n/N, где n – количество раз встречаемости генотипа (комбинации генотипов), N – численность обследованных.

2
Власов В.В. Эффективность диагностических исследований. – М.: Медицина, 1988. – 245 с.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=14693
    Prefix
    В качестве операционных характеристик генетических комплексов в качестве прогностических критериев использовали также показатели чувствительности, специфичности, безошибочности, предсказательной ценности положительного результата и предсказательной ценности отрицательного результата по стандартным формулам
    Exact
    [2, 7, 9, 12]
    Suffix
    . Результаты По результатам проведенного 24 недельного лечения пациенты были разделены на группы с высокой эффективностью проведенного лечения, с отсутствием клинически значимого эффекта от проведенной терапии и с развитием неблагоприятных побочных реакций.

3
Гланц С. Медико-биологическая статистика: пер. с англ. – М.: Практика, 1998. – 459 с.
Total in-text references: 2
  1. In-text reference with the coordinate start=12510
    Prefix
    Достоверность (P) ассоциаций и различий частот распределения изучаемых признаков в альтернативных группах определяли по критерию χ2 с поправкой Йетса на непрерывность и двустороннему варианту точного метода Фишера для четырехпольных таблиц
    Exact
    [3, 11]
    Suffix
    . Отбор генетических комплексов, пригодных для индивидуального прогнозирования эффективности терапии, проводился на основе значений трех статистических критериев: двусторонний вариант точного метода Фишера; информационная мера Кульбака (Jku); диагностический (прогностический) коэффициент Таблица 1.

  2. In-text reference with the coordinate start=14206
    Prefix
    /IL6174GG/TNFA238GG/ TNFA308GG/IL-1B31CC 12,900,009,80,0495100,00 IL-4590CT/IL6174GG/TNFA238GG/ 13,330,009,90,0460100,00 TNFA863CC/IL-1B31CC IL-4590CT/IL6174GG/TNFA308GG/ 13,330,009,90,0460100,00 TNFA863CC/IL-1B31CC IL-6174GG/TNFA238GG/TNFA308GG/ 13,330,009,90,0460100,00 TNFA863CC/IL-1B31CC по формуле: DK = 10 lg (P1/P2), где P1 и P2 – частота прогностического признака в сравниваемых группах
    Exact
    [3, 5, 7]
    Suffix
    . Необходимо напомнить, что согласно данному методу анализа, при достижении прогностического коэффициента величины 12,8 вероятность реализации прогноза составляет 95%. В качестве операционных характеристик генетических комплексов в качестве прогностических критериев использовали также показатели чувствительности, специфичности, безошибочности, предсказательной ценности положительного результата

5
Гублер Е.В. Вычислительные методы анализа и распознавания патологических процессов. – Л.: Медицина, 1983. – 296 с.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=14206
    Prefix
    /IL6174GG/TNFA238GG/ TNFA308GG/IL-1B31CC 12,900,009,80,0495100,00 IL-4590CT/IL6174GG/TNFA238GG/ 13,330,009,90,0460100,00 TNFA863CC/IL-1B31CC IL-4590CT/IL6174GG/TNFA308GG/ 13,330,009,90,0460100,00 TNFA863CC/IL-1B31CC IL-6174GG/TNFA238GG/TNFA308GG/ 13,330,009,90,0460100,00 TNFA863CC/IL-1B31CC по формуле: DK = 10 lg (P1/P2), где P1 и P2 – частота прогностического признака в сравниваемых группах
    Exact
    [3, 5, 7]
    Suffix
    . Необходимо напомнить, что согласно данному методу анализа, при достижении прогностического коэффициента величины 12,8 вероятность реализации прогноза составляет 95%. В качестве операционных характеристик генетических комплексов в качестве прогностических критериев использовали также показатели чувствительности, специфичности, безошибочности, предсказательной ценности положительного результата

6
Коненков В.И. Медицинская и экологическая иммуногенетика. – СО РАМН, Новосибирск, 1999. – 250 с.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=6149
    Prefix
    В России таких исследований явно недостаточно, тем более что этногенетические особенности населения такой многонациональной страны, как Российская федерация, требуют критичного отношения к использованию подобных данных, полученных на других европеоидных, монголоидных и негроидных популяциях
    Exact
    [6]
    Suffix
    . По современным стандартам целью фармакотерапии РА является достижение полной (или хотя бы частичной) ремиссии. Следует отметить, что терапия должна начинаться как можно раньше, желательно в течение 3-6 месяцев от начала болезни [16].

7
Ластед Л.Б. Введение в проблему принятия решений в медицине. – М.: Мир, 1971. – 282 с.
Total in-text references: 2
  1. In-text reference with the coordinate start=14206
    Prefix
    /IL6174GG/TNFA238GG/ TNFA308GG/IL-1B31CC 12,900,009,80,0495100,00 IL-4590CT/IL6174GG/TNFA238GG/ 13,330,009,90,0460100,00 TNFA863CC/IL-1B31CC IL-4590CT/IL6174GG/TNFA308GG/ 13,330,009,90,0460100,00 TNFA863CC/IL-1B31CC IL-6174GG/TNFA238GG/TNFA308GG/ 13,330,009,90,0460100,00 TNFA863CC/IL-1B31CC по формуле: DK = 10 lg (P1/P2), где P1 и P2 – частота прогностического признака в сравниваемых группах
    Exact
    [3, 5, 7]
    Suffix
    . Необходимо напомнить, что согласно данному методу анализа, при достижении прогностического коэффициента величины 12,8 вероятность реализации прогноза составляет 95%. В качестве операционных характеристик генетических комплексов в качестве прогностических критериев использовали также показатели чувствительности, специфичности, безошибочности, предсказательной ценности положительного результата

  2. In-text reference with the coordinate start=14693
    Prefix
    В качестве операционных характеристик генетических комплексов в качестве прогностических критериев использовали также показатели чувствительности, специфичности, безошибочности, предсказательной ценности положительного результата и предсказательной ценности отрицательного результата по стандартным формулам
    Exact
    [2, 7, 9, 12]
    Suffix
    . Результаты По результатам проведенного 24 недельного лечения пациенты были разделены на группы с высокой эффективностью проведенного лечения, с отсутствием клинически значимого эффекта от проведенной терапии и с развитием неблагоприятных побочных реакций.

8
Насонов Е.Л. Иммунопатология ревматических заболеваний // Инновационные технологии в диагностике и лечении ревматических заболеваний: Лекции цикла повышения квалификации врачей. – Москва, 2009. – С. 4-10.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=4322
    Prefix
    Это открытие привело к созданию нового класса лекарственных препаратов – биологических агентов, или генно-инженерных препаратов, в основе которых лежат моноклональные антитела к различным эпитопам цитокинов или их рецепторам. Воспаление, лежащее в основе патологического процесса при РА, во многом зависит от баланса продукции цитокинов с провоспалительной и антивоспалительной активностью
    Exact
    [8, 21]
    Suffix
    . Казалось бы, очевидная мысль об использовании показателей их содержания в сыворотке крови не нашла своего развития на практике. Основанием этому послужило наличие чрезвычайно широких колебаний концентраций цитокинов в сыворотке крови, как здоровых лиц, так и пациентов с РА и зависимость их концентраций не столько от активности ревматоидного воспаления, сколько от множества динамичных фактор

9
Реброва О.Ю. Статистический анализ медицинских данных. Применение пакета прикладных программ Statistica. – М.: Медиасфера, 2002. – 312 с.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=14693
    Prefix
    В качестве операционных характеристик генетических комплексов в качестве прогностических критериев использовали также показатели чувствительности, специфичности, безошибочности, предсказательной ценности положительного результата и предсказательной ценности отрицательного результата по стандартным формулам
    Exact
    [2, 7, 9, 12]
    Suffix
    . Результаты По результатам проведенного 24 недельного лечения пациенты были разделены на группы с высокой эффективностью проведенного лечения, с отсутствием клинически значимого эффекта от проведенной терапии и с развитием неблагоприятных побочных реакций.

10
Смольникова М.В., Соловьева И.Г., Коненкова Л.П., Сизиков А.Э., Герцог О.А., Кожевников В.С., Коненков В.И. Распределение аллельных вариантов генов цитокинов (TNFA и IL-10) у больных ревматоидным артритом европеоидов // Медицинская иммунология. – 2007. – Т. 9, No 2-3. – С. 204-205.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=5691
    Prefix
    Зависимость уровня продукции клетками цитокинов от точечных замен в промоторных участках генов цитокинов, делает более понятным ассоциированность аллельных вариантов этих генов с РА и ставит их в первый ряд кандидатных генов для фармагенетических исследований в ревматологии
    Exact
    [10, 17, 23]
    Suffix
    . Такие попытки научных центрах различных стран неоднократно предпринимаются, однако их эффективность требует проверки клинической практикой [15, 28, 34, 37]. В России таких исследований явно недостаточно, тем более что этногенетические особенности населения такой многонациональной страны, как Российская федерация, требуют критичного отношения к использованию подобных данных, полученных на

11
Фишер Р.А. Статистические методы для исследователей. – М.: Госстатиздат, 1958. – 268 с.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=12510
    Prefix
    Достоверность (P) ассоциаций и различий частот распределения изучаемых признаков в альтернативных группах определяли по критерию χ2 с поправкой Йетса на непрерывность и двустороннему варианту точного метода Фишера для четырехпольных таблиц
    Exact
    [3, 11]
    Suffix
    . Отбор генетических комплексов, пригодных для индивидуального прогнозирования эффективности терапии, проводился на основе значений трех статистических критериев: двусторонний вариант точного метода Фишера; информационная мера Кульбака (Jku); диагностический (прогностический) коэффициент Таблица 1.

12
Юнкеров В.И., Григорьев С.Г. Математикостатистическая обработка данных медицинских исследований. – СПб.: ВМедА, 2002. – 266 с.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=14693
    Prefix
    В качестве операционных характеристик генетических комплексов в качестве прогностических критериев использовали также показатели чувствительности, специфичности, безошибочности, предсказательной ценности положительного результата и предсказательной ценности отрицательного результата по стандартным формулам
    Exact
    [2, 7, 9, 12]
    Suffix
    . Результаты По результатам проведенного 24 недельного лечения пациенты были разделены на группы с высокой эффективностью проведенного лечения, с отсутствием клинически значимого эффекта от проведенной терапии и с развитием неблагоприятных побочных реакций.

14
Choi E., Lee H.J., Yoo T., Chanock S. A common haplotype of interleukin-4 gene IL-4 is associated with severe respiratory syncytial virus disease in Korean children // The Journal of Infectious Diseases. – 2002. – Vol. 186. – P. 12071211.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=10375
    Prefix
    Анализ исследуемых полиморфизмов проводился с использованием метода рестрикционного анализа продуктов амплификации (ПДРФ-анализ). Амплификация специфических участков генома проводилась с использованием праймеров и параметров температурных циклов, описанных в литературе: TNFA [13, 24, 30], IL-1B [38], IL-4
    Exact
    [14]
    Suffix
    , IL-6 [18], IL-10 [26]. Продукты амплификации подвергались рестрикции соответствующими эндонуклеазами: в случае генотипирования полиморфизма TNFA С-863А – Bst BAI, TNFA G-308A – Bsp19 I , TNFA G-238A – Msp I, IL-1B T-31C – Alu I, IL-4 C-590T – Bme 18 I, IL-6 G-174C – SfaN I, IL10 C-592A – RsaI («СибЭнзим», Новосибирск).

16
Combe B. Early rheumatoid arthritis: strategies for prevention and management // Best Pract. Res. Clin. Rheumatol. – 2007. – Vol. 21, N 1. – P. 27-42.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=6388
    Prefix
    По современным стандартам целью фармакотерапии РА является достижение полной (или хотя бы частичной) ремиссии. Следует отметить, что терапия должна начинаться как можно раньше, желательно в течение 3-6 месяцев от начала болезни
    Exact
    [16]
    Suffix
    . В настоящее время метотрексат (МТ) получил статус «золотого стандарта» среди всех БПВП, использующихся для лечения РА [31]. Так же широко используются другие препараты – лефлуномид, сульфасалазин, гидроксихлорохин и различные комбинированные схемы [4, 27].

17
Dieude P., Cornelis F. Genetic basis of rheumatoid arthritis // Jt. Bone Spine. – 2005. – Vol. 9. – P. 3-7.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=5691
    Prefix
    Зависимость уровня продукции клетками цитокинов от точечных замен в промоторных участках генов цитокинов, делает более понятным ассоциированность аллельных вариантов этих генов с РА и ставит их в первый ряд кандидатных генов для фармагенетических исследований в ревматологии
    Exact
    [10, 17, 23]
    Suffix
    . Такие попытки научных центрах различных стран неоднократно предпринимаются, однако их эффективность требует проверки клинической практикой [15, 28, 34, 37]. В России таких исследований явно недостаточно, тем более что этногенетические особенности населения такой многонациональной страны, как Российская федерация, требуют критичного отношения к использованию подобных данных, полученных на

18
Fernandez-Real J.M., Vendrell J., Richart C., Gutierrez C., Ricart W. Platelet count and Interleukin 6 Gene polymorphism in healthy subjects // BMC Medical Genetics. – 2001. – Vol. 2, N 6. – P. 14712350.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=10386
    Prefix
    Анализ исследуемых полиморфизмов проводился с использованием метода рестрикционного анализа продуктов амплификации (ПДРФ-анализ). Амплификация специфических участков генома проводилась с использованием праймеров и параметров температурных циклов, описанных в литературе: TNFA [13, 24, 30], IL-1B [38], IL-4 [14], IL-6
    Exact
    [18]
    Suffix
    , IL-10 [26]. Продукты амплификации подвергались рестрикции соответствующими эндонуклеазами: в случае генотипирования полиморфизма TNFA С-863А – Bst BAI, TNFA G-308A – Bsp19 I , TNFA G-238A – Msp I, IL-1B T-31C – Alu I, IL-4 C-590T – Bme 18 I, IL-6 G-174C – SfaN I, IL10 C-592A – RsaI («СибЭнзим», Новосибирск).

20
Fransen J., Creemers M.C., Van Riel P.L. Remission in rheumatoid arthritis: agreement of the disease activity score (DAS28) with the ARA preliminary remission criteria // Rheumatology (Oxford). – 2004. – N 43. – Р. 1252-1255.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=9676
    Prefix
    Если активность заболевания по DAS28 после лечения оставалась высокой (более 5,1 балла), то удовлетворительным эффектом терапии можно было считать только значительную его динамику, т.е. уменьшение DAS28 более чем на 1,2 балла
    Exact
    [20]
    Suffix
    . Методы исследования полиморфизма генов. Геномную ДНК выделяли из ядросодержащих клеток 500 мкл переферической крови при помощи набора реагентов производства ООО «Лаборатория Медиген» (г. Новосибирск).

21
Goldblatt F., Isenberg D.A. New therapy for rheumatoid arthritis // Clin. Exp. Immunol. – 2005. – N 140. – Р. 195-204.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=4322
    Prefix
    Это открытие привело к созданию нового класса лекарственных препаратов – биологических агентов, или генно-инженерных препаратов, в основе которых лежат моноклональные антитела к различным эпитопам цитокинов или их рецепторам. Воспаление, лежащее в основе патологического процесса при РА, во многом зависит от баланса продукции цитокинов с провоспалительной и антивоспалительной активностью
    Exact
    [8, 21]
    Suffix
    . Казалось бы, очевидная мысль об использовании показателей их содержания в сыворотке крови не нашла своего развития на практике. Основанием этому послужило наличие чрезвычайно широких колебаний концентраций цитокинов в сыворотке крови, как здоровых лиц, так и пациентов с РА и зависимость их концентраций не столько от активности ревматоидного воспаления, сколько от множества динамичных фактор

23
John S., Myerscough A., Marlow A., Hajeer A., Silman A., Ollier W., Worthington J. Linkage of cytokine genes to rheumatoid arthritis. Evidence of genetic heterogeneity // Ann. Rheum. Dis. – 1998. – Vol. 57, N 6. – p. 361-365. Li H.Q., Li Z., Liu Y., Li J.H., Dong J.Q., Gao J.R., Gou C.Y., Li H. Association of polymorphism of tumor necrosis factor-alpha gene promoter region with outcome of hepatitis B virus infection // World J. Gastroenterol. – 2005. – Vol. 11, N 33. – P. 52135217.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=5691
    Prefix
    Зависимость уровня продукции клетками цитокинов от точечных замен в промоторных участках генов цитокинов, делает более понятным ассоциированность аллельных вариантов этих генов с РА и ставит их в первый ряд кандидатных генов для фармагенетических исследований в ревматологии
    Exact
    [10, 17, 23]
    Suffix
    . Такие попытки научных центрах различных стран неоднократно предпринимаются, однако их эффективность требует проверки клинической практикой [15, 28, 34, 37]. В России таких исследований явно недостаточно, тем более что этногенетические особенности населения такой многонациональной страны, как Российская федерация, требуют критичного отношения к использованию подобных данных, полученных на