The 13 references with contexts in paper A. Burmistrova L., D. Stashkevich S., T. Susslova A., I. Devald V., A. Issakanova O., O. Dimcheva N., А. Бурмистрова Л., Д. Сташкевич С., Т. Суслова А., И. Девальд В., А. Исаканова О., О. Димчева Н. (2014) “МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ПОЛИМОРФИЗМОВ ГЕНОВ ЦИТОКИНОВ – ИНТЕРЛЕЙКИНА-1Β, РЕЦЕПТОРА АНТАГОНИСТА ИНТЕРЛЕЙКИНА-1 И ИНТЕРЛЕЙКИНА-4 У БОЛЬНЫХ РЕВМАТОИДНЫМ АРТРИТОМ БАШКИРСКОЙ ЭТНИЧЕСКОЙ ГРУППЫ, ПРОЖИВАЮЩИХ В ЧЕЛЯБИНСКОЙ ОБЛАСТИ // MOLECULAR BIOLOGY ANALYSIS OF IL -1Β, IL -4, AND IL -1Β RA GENE POLYMORPHISMS IN ETHNIC BASHKIR PATIENTS WITH RHEUMATOID ARTHRITIS, LIVING IN C HELYABINSK REGION” / spz:neicon:mimmun:y:2007:i:6:p:631-634

1
Бурмистрова А.Л., Девальд И.В., Черешнев В.А., Суслова Т.А., Празднов А.С. Иммуногенетический анализ башкирской этнической группы Южно-уральского региона и ассоциация генов HLA I и II классов с ревматоидным артритом у башкир // Иммунология. – 2005. – No 2 . – С. 68-71.
Total in-text references: 2
  1. In-text reference with the coordinate start=4006
    Prefix
    Ранее группой авторов показано, что возраст начала заболевания, наличие системных проявлений и иммунологический вариант РА в башкирской популяции не зависят от генов HLA: локусов A, B, DRB1, DQA1, DQB1
    Exact
    [1]
    Suffix
    . Цель данной работы: оценить частоты встречаемости аллельных форм и генотипов генов цитокинов – IL-1β, IL-1Ра, IL-4 у больных ревматоидным артритом башкирской этнической группы, проживающих на территории Челябинской области.

  2. In-text reference with the coordinate start=5098
    Prefix
    У 49 человек обнаруживался ревматоидный фактор (РФ), а у 11 человек был серонегативный РА. У 59 больных было отмечено поражение суставов в форме полиартрита, и только у одного человека был олигоартрит
    Exact
    [1]
    Suffix
    . Контрольную группу составляли кадровые доноры ОГУП «Челябинская областная станция переливания крови»: 89 человек. Этническая принадлежность больных РА и здоровых лиц определялась согласно рекомендациям Международного Уоркшопа (1980 г.

2
Зарецкая Ю.М. Клиническая иммуногенетика. – М.: Медицина, 1983. – 208 с.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=7963
    Prefix
    Параметрами для определения служили: частоты аллельных вариантов генов цитокинов и их генотипов. Для оценки частот аллельных вариантов использовался критерий Пирсона, который рассчитывался по формуле
    Exact
    [2]
    Suffix
    : χ2 2 = − ++++ Nabbc abcdacbd () ()()()() При расчете достоверности распределения генотипов для каждого полиморфизма данные о частотах встречаемости генотипов сводили в таблицу сопряженности с двумя входами: генотип, состояние здоровья (больной РА, здоровый).

3
Реброва О.Ю. Статистический анализ медицинских данных: Применение пакета прикладных программ STATISTICA. – М.: МедиаСфера, 2002. – 312 с.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=9040
    Prefix
    Для оценки вероятности возникновения заболевания в зависимости от возраста у носителей различных генотипов использовали анализ отношения шансов (шанс – отношение вероятности того, что событие произойдет, к вероятности того, что событие не произойдет)
    Exact
    [3]
    Suffix
    . Во всех случаях различия считали статистически значимыми при р ≤ 0,05, незначимыми при р > 0,10; для промежуточных значений р (0,05 ≤ р ≤ 0,10) обсуждали тенденцию к различиям. Результаты и обсуждение На первом этапе работы была проведена оценка распределения частот аллелей и генотипов в группах здоровых лиц и больных РА башкирской этнической группы, проживающих в Челябинской облас

4
Шабалдин А.В., Филипенко М.Л., Воронина Е.Н., Глушков А.Н., Симонова Т.А. Полиморфизм генов антагониста рецептора интерлейкина-1 и интерлейкина-4 при репродуктивных нарушениях // Иммунология. – 2005. – No 1. – С. 6-9.
Total in-text references: 4
  1. In-text reference with the coordinate start=5478
    Prefix
    Этническая принадлежность больных РА и здоровых лиц определялась согласно рекомендациям Международного Уоркшопа (1980 г., Лос-Анджелес, США). Характеристика исследуемых полиморфизмов. Гены IL-1β и IL-1Rа расположены на второй хромосоме в районе 2q12
    Exact
    [4, 7]
    Suffix
    . Для исследования полиморфизма по одному нуклеотиду (SNP) в 5 экзоне гена IL-1β (положение +3953) использовали разновидность ПЦР – ПДРФ – анализ полиморфизма длины рестрикционных фрагментов.

  2. In-text reference with the coordinate start=6448
    Prefix
    При наличии аллеля C происходит разрезание ампликона на два фрагмента 146 п.н. и 404 п.н., гомозиготность по этому аллелю обозначена w/w (сокращение от wild – аллель дикого типа), а гетерозиготное состояние С/Т в данном исследовании обозначено как w/m
    Exact
    [4]
    Suffix
    . Для определения полиморфизма типа варьирующего числа тандемных повторов (VNTR) в гене IL-1Ra использовали ПЦР с праймерами, фланкирующими полиморфный регион в пределах второго интрона, в котором находится VNTR участка длиной 86 п.н.

  3. In-text reference with the coordinate start=6860
    Prefix
    полиморфизма типа варьирующего числа тандемных повторов (VNTR) в гене IL-1Ra использовали ПЦР с праймерами, фланкирующими полиморфный регион в пределах второго интрона, в котором находится VNTR участка длиной 86 п.н. В результате амплификации мы идентифицировали фрагменты ДНК размером 438, 524, 610, и 696 н.п, соответственно, с 2, 3, 4 и 5 копиями тандемных повторов
    Exact
    [4]
    Suffix
    . Эти аллели были обозначены как 2R, 3R, 4R и 5R в данном исследовании. Ген IL-4 расположен на длинном плече 5 хромосомы [6]. Для исследования VNTR IL-4 проводили ПЦР с праймерами, фланкирующими полиморфный регион в пределах 3-го интрона, в котором находится вариабельное количество тандемных повторов размером 70 н.п.

  4. In-text reference with the coordinate start=7379
    Prefix
    Для исследования VNTR IL-4 проводили ПЦР с праймерами, фланкирующими полиморфный регион в пределах 3-го интрона, в котором находится вариабельное количество тандемных повторов размером 70 н.п. В результате амплификации идентифицировали фрагменты ДНК размерами 255 и 325 н.п., соответственно, с 2 и 3 копиями тандемных повторов. Эти аллели были обозначены как 2R и 3R
    Exact
    [4]
    Suffix
    . Наборы для типирования генов цитокинов любезно предоставлены группой фармакогеномики инсти2007, Т. 9, No 6Полиморфизм генов цитокинов при РА тута Химической Биологии и Фундаментальной Медицины (ИХБФМ СО РАН).

5
Buchs N., Silvestri T., di Giovine F.S., Chabaud M., Vannier E., Duff G. W., Miossec P. IL-4 VNTR gene polymorphism in chronic polyarthritis. The rare allele is associated with protection: against destruction // Rheumatology. – 2000. – Vol. 39.– P. 1126-1131.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=13828
    Prefix
    о наличии связи между 2R аллелем гена IL-4 и возрастом начала заболевания и (или) выраженностью клинических симптомов некоторых наследственно-обусловленных заболеваний: Vandenbroeck К. показал ассоциацию между частотой встречаемости 2R аллеля гена IL-4 и поздней атакой множественного склероза у больных рассеянным склерозом (РС), коренных жителей Сардинии [13], Buchs N.
    Exact
    [5]
    Suffix
    продемонстрировал, что 2R аллель IL-4 может быть протективным фактором тяжести деструкции суставов при РА (пациенты с недеструктивным артритом имели повышенную частоту встречаемости 2R аллеля).

6
Cantagrel A., Navaux F. Interleukin-1β, Interleukin-1 receptor Antagonist, Interleukin-4, and Interleukin-10 gene polymorphisms relationship to occurrence and severity of rheumatoid arthritis // Arthritis Rheum. – 1999. – Vol. 42. – P. 1093-1100.
Total in-text references: 4
  1. In-text reference with the coordinate start=3451
    Prefix
    Данные о поляризации локальных цитокиновых полей (цитокиновый профиль синовиальной жидкости) чрезвычайно противоречивы, что возможно связано как с гетерогенностью заболевания, так и с полиморфизмом генов цитокинов
    Exact
    [6, 10]
    Suffix
    . Тем не менее, большинство авторов считает, что гены цитокинов определяют не столько предрасположенность к РА, сколько клиническое течение заболевания: промоторные полиморфизмы в генах IL-1β, IL-1Ra ассоциируются с более тяжелыми клиническими формами РА, а полиморфизм в экзоне IL-4 связан с выраженной деструкцией хряща [10].

  2. In-text reference with the coordinate start=6986
    Prefix
    В результате амплификации мы идентифицировали фрагменты ДНК размером 438, 524, 610, и 696 н.п, соответственно, с 2, 3, 4 и 5 копиями тандемных повторов [4]. Эти аллели были обозначены как 2R, 3R, 4R и 5R в данном исследовании. Ген IL-4 расположен на длинном плече 5 хромосомы
    Exact
    [6]
    Suffix
    . Для исследования VNTR IL-4 проводили ПЦР с праймерами, фланкирующими полиморфный регион в пределах 3-го интрона, в котором находится вариабельное количество тандемных повторов размером 70 н.п.

  3. In-text reference with the coordinate start=11142
    Prefix
    Литературные данные по оценке распределения аллельных форм и генотипов генов IL-1β, IL-1Ra, IL-4 между выборками здоровых лиц и больных РА различных этнических групп противоречивы: в работе Cantagrel A. еt al.
    Exact
    [6]
    Suffix
    , проведенной на больных РА европеоидного происхождения, обнаружено достоверное повышение частоты встречаемости аллеля с 2-кратным повтором гена IL-4 у больных РА, а по полиморфизмам генов IL-1β, IL-1Ra не было различий.

  4. In-text reference with the coordinate start=11541
    Prefix
    6], проведенной на больных РА европеоидного происхождения, обнаружено достоверное повышение частоты встречаемости аллеля с 2-кратным повтором гена IL-4 у больных РА, а по полиморфизмам генов IL-1β, IL-1Ra не было различий. Высокопродуктивный аллельный вариант Т SNP полиморфизма +3953 в гене IL-1β связан с выраженным эрозивным артритом только в сочетании с наличием HLA-DR общего эпитопа
    Exact
    [6]
    Suffix
    . Группой исследователей во главе с Carreira P.E. при обследовании испанской популяции показано повышение частоты аллельного варианта с 2-кратным повтором VNTR гена IL-1Ra в группе больных РА по сравнению с группой здоровых лиц, кроме того, гомозиготное состояние по аллелю 2r было ассоциировано с большим числом пораженных суставов в течение первого года заболевания [7].

7
Carreira P.E., Gonzalez-Crespo M. R., Ciruelo E., Pablos J.L., Santiago B., Gomez-Camara A., GomezReino J.J. Polymorphism of the Interleukin-1 Receptor antagonist gene a factor in susceptibility to rheumatoid arthritis in a Spanish population // Arthritis Rheum. – 2005. – Vol. 52. – P. 3015-3019.
Total in-text references: 2
  1. In-text reference with the coordinate start=5478
    Prefix
    Этническая принадлежность больных РА и здоровых лиц определялась согласно рекомендациям Международного Уоркшопа (1980 г., Лос-Анджелес, США). Характеристика исследуемых полиморфизмов. Гены IL-1β и IL-1Rа расположены на второй хромосоме в районе 2q12
    Exact
    [4, 7]
    Suffix
    . Для исследования полиморфизма по одному нуклеотиду (SNP) в 5 экзоне гена IL-1β (положение +3953) использовали разновидность ПЦР – ПДРФ – анализ полиморфизма длины рестрикционных фрагментов.

  2. In-text reference with the coordinate start=11925
    Prefix
    Группой исследователей во главе с Carreira P.E. при обследовании испанской популяции показано повышение частоты аллельного варианта с 2-кратным повтором VNTR гена IL-1Ra в группе больных РА по сравнению с группой здоровых лиц, кроме того, гомозиготное состояние по аллелю 2r было ассоциировано с большим числом пораженных суставов в течение первого года заболевания
    Exact
    [7]
    Suffix
    . На втором этапе работы мы провели анализ частот встречаемости генотипов генов IL-1β, IL-1Ra, IL-4 и возможной ассоциации полиморфизмов IL-1β, IL-1Ra, IL-4 с наличием системных проявлений, иммунологическим вариантом РА и возрастом начала РА.

8
Choy Ernest H.S. Cytokine pathways and joint inflammation in rheumatoid arthritis // N. Engl. Med. – 2001. – Vol. 344, No 12. – P. 907-916.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=12388
    Prefix
    Считают, что аллельные варианты генов цитокинов во многом определяют выраженность локальной или системной воспалительной реакции и ее исход, включая тканевое повреждение и репарацию
    Exact
    [8, 10]
    Suffix
    . Мы не обнаружили ассоциации между распределением генотипов и такими показателями, как: наличие или отсутствие ревБурмистрова А.Л. и др.Медицинская Иммунология матоидного фактора и количество пораженных суставов.

9
Dieude P., Cornelis F. Genetic basis of rheumatoid arthritis // Jt. Bone Spine. – 2005. – Vol. 9. – P. 3-7.
Total in-text references: 3
  1. In-text reference with the coordinate start=2723
    Prefix
    В настоящее время РА относят к мультифакторным комплексным заболеваниям, чувствительность к которым определяется генетической составляющей и условиями окружающей среды. Основным генетическим фактором риска для РА являются гены классического иммунного ответа II класса системы HLA
    Exact
    [9, 11]
    Suffix
    . Ассоциация между генами комплекса HLA и развитием РА была показана еще в 1976 г. Stasny P. [9]. Однако генами HLA II класса обеспечивается лишь 30-50% общего семейного риска развития РА (по данным разных авторов).

  2. In-text reference with the coordinate start=2824
    Prefix
    Основным генетическим фактором риска для РА являются гены классического иммунного ответа II класса системы HLA [9, 11]. Ассоциация между генами комплекса HLA и развитием РА была показана еще в 1976 г. Stasny P.
    Exact
    [9]
    Suffix
    . Однако генами HLA II класса обеспечивается лишь 30-50% общего семейного риска развития РА (по данным разных авторов). Скрининг генома показал наличие и других генов восприимчивости к РА, рассеянных по всему геному [9, 10].

  3. In-text reference with the coordinate start=3051
    Prefix
    Однако генами HLA II класса обеспечивается лишь 30-50% общего семейного риска развития РА (по данным разных авторов). Скрининг генома показал наличие и других генов восприимчивости к РА, рассеянных по всему геному
    Exact
    [9, 10]
    Suffix
    . Среди них большое внимание привлекают гены цитокинов и их рецепторов, продукты которых определяют поляризацию элементарных, локальных и системных цитокиновых полей. Данные о поляризации локальных цитокиновых полей (цитокиновый профиль синовиальной жидкости) чрезвычайно противоречивы, что возможно связано как с гетерогенностью заболевания, так и с полиморфизмом генов цитокинов [6, 10].

10
Harney S., Wordsworth B.P. Genetic epidemiology of rheumatoid arthritis // Tis. Antigens. – 2002. – Vol. 60. – P. 465-473.
Total in-text references: 4
  1. In-text reference with the coordinate start=3051
    Prefix
    Однако генами HLA II класса обеспечивается лишь 30-50% общего семейного риска развития РА (по данным разных авторов). Скрининг генома показал наличие и других генов восприимчивости к РА, рассеянных по всему геному
    Exact
    [9, 10]
    Suffix
    . Среди них большое внимание привлекают гены цитокинов и их рецепторов, продукты которых определяют поляризацию элементарных, локальных и системных цитокиновых полей. Данные о поляризации локальных цитокиновых полей (цитокиновый профиль синовиальной жидкости) чрезвычайно противоречивы, что возможно связано как с гетерогенностью заболевания, так и с полиморфизмом генов цитокинов [6, 10].

  2. In-text reference with the coordinate start=3451
    Prefix
    Данные о поляризации локальных цитокиновых полей (цитокиновый профиль синовиальной жидкости) чрезвычайно противоречивы, что возможно связано как с гетерогенностью заболевания, так и с полиморфизмом генов цитокинов
    Exact
    [6, 10]
    Suffix
    . Тем не менее, большинство авторов считает, что гены цитокинов определяют не столько предрасположенность к РА, сколько клиническое течение заболевания: промоторные полиморфизмы в генах IL-1β, IL-1Ra ассоциируются с более тяжелыми клиническими формами РА, а полиморфизм в экзоне IL-4 связан с выраженной деструкцией хряща [10].

  3. In-text reference with the coordinate start=3794
    Prefix
    Тем не менее, большинство авторов считает, что гены цитокинов определяют не столько предрасположенность к РА, сколько клиническое течение заболевания: промоторные полиморфизмы в генах IL-1β, IL-1Ra ассоциируются с более тяжелыми клиническими формами РА, а полиморфизм в экзоне IL-4 связан с выраженной деструкцией хряща
    Exact
    [10]
    Suffix
    . Ранее группой авторов показано, что возраст начала заболевания, наличие системных проявлений и иммунологический вариант РА в башкирской популяции не зависят от генов HLA: локусов A, B, DRB1, DQA1, DQB1 [1].

  4. In-text reference with the coordinate start=12388
    Prefix
    Считают, что аллельные варианты генов цитокинов во многом определяют выраженность локальной или системной воспалительной реакции и ее исход, включая тканевое повреждение и репарацию
    Exact
    [8, 10]
    Suffix
    . Мы не обнаружили ассоциации между распределением генотипов и такими показателями, как: наличие или отсутствие ревБурмистрова А.Л. и др.Медицинская Иммунология матоидного фактора и количество пораженных суставов.

11
Lee D.M., Weinblatt M.E. Rheumatoid arthritis // Lancet. – 2001. – Vol. 358. – P. 903-911.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=2723
    Prefix
    В настоящее время РА относят к мультифакторным комплексным заболеваниям, чувствительность к которым определяется генетической составляющей и условиями окружающей среды. Основным генетическим фактором риска для РА являются гены классического иммунного ответа II класса системы HLA
    Exact
    [9, 11]
    Suffix
    . Ассоциация между генами комплекса HLA и развитием РА была показана еще в 1976 г. Stasny P. [9]. Однако генами HLA II класса обеспечивается лишь 30-50% общего семейного риска развития РА (по данным разных авторов).

12
Sokal R.R., Rolf F. The principles and practice of statistics in biological research // J. Biometry. – N.Y.: Freeman & Co, 1995. – 850 p.
Total in-text references: 2
  1. In-text reference with the coordinate start=8420
    Prefix
    распределения генотипов для каждого полиморфизма данные о частотах встречаемости генотипов сводили в таблицу сопряженности с двумя входами: генотип, состояние здоровья (больной РА, здоровый). Полученную таблицу обрабатывали в ходе иерархического логлинейного анализа, который позволяет рассчитать критерий максимального правдоподобия (G или χ2ML) и критерий Пирсона (χ2)
    Exact
    [12]
    Suffix
    . Поскольку в таблицах имелись частоты меньше 5, то ко всем ячейкам добавляли константу δ = 0,5. В иерархическом логлинейном анализе мы использовали отклонения Фримана-Тьюки, которые позволяют определить, за счет каких ячеек комбинаций «генотип – состояние здоровья» образуется общий статистически значимый результат или тенденция к различиям [12].

  2. In-text reference with the coordinate start=8779
    Prefix
    В иерархическом логлинейном анализе мы использовали отклонения Фримана-Тьюки, которые позволяют определить, за счет каких ячеек комбинаций «генотип – состояние здоровья» образуется общий статистически значимый результат или тенденция к различиям
    Exact
    [12]
    Suffix
    . Для оценки вероятности возникновения заболевания в зависимости от возраста у носителей различных генотипов использовали анализ отношения шансов (шанс – отношение вероятности того, что событие произойдет, к вероятности того, что событие не произойдет) [3].

13
Vandenbroeck K., Martino G., Marrosu M., Consiglio A., Zaffaroni M., Vaccargiu S., Franciotta D., Ruggeri M., Comi G., Grimaldi L.M. Occurrence and clinical relevance of an Il-4 gene polymorphism in patients with multiple sclerosis //
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=13813
    Prefix
    литературы о наличии связи между 2R аллелем гена IL-4 и возрастом начала заболевания и (или) выраженностью клинических симптомов некоторых наследственно-обусловленных заболеваний: Vandenbroeck К. показал ассоциацию между частотой встречаемости 2R аллеля гена IL-4 и поздней атакой множественного склероза у больных рассеянным склерозом (РС), коренных жителей Сардинии
    Exact
    [13]
    Suffix
    , Buchs N. [5] продемонстрировал, что 2R аллель IL-4 может быть протективным фактором тяжести деструкции суставов при РА (пациенты с недеструктивным артритом имели повышенную частоту встречаемости 2R аллеля).