The 33 references with contexts in paper T. Sokolova M., N. Fedorova E., M. Medjidova G., S. Terekhov M., L. Uryvaev V., A. Kushch A., Т. Соколова М., Н. Федорова Е., М. Меджидова Г., С. Терехов М., Л. Урываев В., А. Кущ А. (2014) “МЕХАНИЗМЫ КЛЕТОЧНОЙ РЕЗИСТЕНТНОСТИ К ЦИТОМЕГАЛОВИРУСУ СВЯЗАНЫ С ПРОЛИФЕРАТИВНЫМ СОСТОЯНИЕМ И ТРАНСКРИПЦИОННОЙ АКТИВНОСТЬЮ ГЕНОВ ЛЕЙКОЦИТАРНОГО И ИММУННОГО ИНТЕРФЕРОНОВ // MECHANISMS OF CELL RESISTANCE TO CYTOMEGALOVIRUS ARE CONNECTED WITH CELL PROLIFERATION STATE AND TRANSCRIPTION ACTIVITY OF LEUKOCYTE AND IMMUNE INTERFERON GENES” / spz:neicon:mimmun:y:2007:i:5:p:457-466

1
Вирусология. Методы / Под ред. Мейхи Б. – М.: Мир, 1988. – 290 с.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=13576
    Prefix
    Клетки, окрашенные МКА, подсчитывали и выражали в процентах от общего числа клеток. Инфекционный титр ЦМВ определяли микрометодом «черных бляшек» под агаровым покрытием с помощью смеси МКА к структурным ЦМВ-белкам (рр65 и gB)
    Exact
    [1]
    Suffix
    . Результаты Развитие ЦМВ инфекции в культурах диплоидных фибробластов, отличающихся пролиферативным состоянием и чувствительностью к вирусу В изученных линиях диплоидных фибробластов человека ФЛЭЧ-110044, ФЛЭЧ-977 и ФКЧ1608, находящихся в момент заражения в 2-х пролиферативных состояниях покоя (G0) или в фазе синтеза ДНК (S), сравнили динамику развития инфекционного процесса, которая характе

2
Ершов Ф.И., Киселев О.И. Интерфероны и их индукторы – М.: ГЭОТАР-МЕДИА, 2005. – 368 с.
Total in-text references: 2
  1. In-text reference with the coordinate start=2932
    Prefix
    Ключевые слова: фибробласты человека, транскрипция мРНК интерферонов, цитомегаловирусная инфекция. Введение Функционирование системы интерферона (IFN) является важной составляющей антивирусного, антипролиферативного и иммунного ответов на вирусную инфекцию
    Exact
    [2]
    Suffix
    . Человеческие IFN разделены на типы I и II [11, 14]. Первый тип включает многочисленные подтипы IFNα, а также IFNβ, IFNω, IFNτ, IFNκ, IFNε, IFNλ и IFNξ. Ко второму типу относится IFNγ. В настоящее время наиболее изучены α (лейкоцитарный), β (фибробластный) и γ (иммунный) IFN, которые производятся как лекарственные средства.

  2. In-text reference with the coordinate start=23280
    Prefix
    Поэтому уровень резистентности исследованных линий фибробластов человека к ЦМВ не был связан с уровнями экспрессии мРНК IFNβ. Обсуждение В организме человека ЦМВ преимущественно находится в латентной форме. Активация ЦМВинфекции происходит на фоне иммунодефицитных состояний
    Exact
    [2, 23]
    Suffix
    . ЦМВ обладает рядом механизмов иммуносупрессии и ускользания от иммунного ответа организма. Продукты генов US2, US3, US6, US11 вирусного генома интерферируют с процессингом и презентацией антигенов.

3
Соколова Т.М., Бибикова О.В., Быстров Н.С., Урываев Л.В. Экспрессия генов системы интерферона и клеточного апоптоза в пробах крови человека // Вопр. вирусол. – 2005. – No 1. – С. 19-23.
Total in-text references: 3
  1. In-text reference with the coordinate start=10985
    Prefix
    Сроки исследования составляли 0, 3, 6, 12, 24, 48, 72 и 120 ч (см. раздел Результаты). Содержание мРНК α-, β- и IFNγ определяли с помощью полуколичественного варианта метода обратная транскрипция – полимеразная цепная реакция (ОТ-ПЦР)
    Exact
    [3, 13]
    Suffix
    . Для выделения суммарной клеточной РНК использовали метод гуанидин-тиоцианат-фенол-хлороформ [12]. Реакцию обратной транскрипции (ОТ) проводили на матрице поли(А)РНК с универсальным праймером олиго(дТ)16 и ферментом обратная транскриптаза (200 ед/мкл MBI «Fermentas» Латвия) при 42°С 1 ч.

  2. In-text reference with the coordinate start=11510
    Prefix
    Аликвоты полученных кДНК без разведения и в 10-кратных разведениях (от 10-1 до 10-4) амплифицировали в ПЦР со специфическими парами праймеров, рассчитанными нами по известным нуклеотидным последовательностям мРНК IFNα, β и γ
    Exact
    [3, 4]
    Suffix
    . Условия проведения ПЦР: 50 циклов амплификации на матрицах кДНК с термостабильной Taq-полимеразой (5 ед/мкл MBI «Fermentas», Латвия) при температуре отжига 53-55°С (точно соответствующим рассчитанным для каждой пары праймеров).

  3. In-text reference with the coordinate start=13155
    Prefix
    Прямой праймер безошибочно связывается с кДНК 5-ти разновидностей IFNα (4, 7, 8, 17 и 21), а обратный – комплементарен участкам мРНК 7-ми вариантов IFNα (1, 2, 4, 7, 13, 14 и 21) (рис. 1). Пары праймеров для мРНК IFNβ и IFNγ являются высокоспецифичными, так как связываются только с собственными матрицами
    Exact
    [3]
    Suffix
    . Выявление вирусных белков (IEp72, рp65, gB) в клетках на разных сроках ЦМВ-инфекции проводили методом иммуноферментного анализа in situ с использованием моноклональных антител (МКА) [6]. Клетки, окрашенные МКА, подсчитывали и выражали в процентах от общего числа клеток.

4
Соколова Т.М., Урываев Л.В. Способ определения цитокинового статуса человека на генетическом уровне. – Пат. на изобретение No 2181177 от 27.04.2002, РФ.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=11510
    Prefix
    Аликвоты полученных кДНК без разведения и в 10-кратных разведениях (от 10-1 до 10-4) амплифицировали в ПЦР со специфическими парами праймеров, рассчитанными нами по известным нуклеотидным последовательностям мРНК IFNα, β и γ
    Exact
    [3, 4]
    Suffix
    . Условия проведения ПЦР: 50 циклов амплификации на матрицах кДНК с термостабильной Taq-полимеразой (5 ед/мкл MBI «Fermentas», Латвия) при температуре отжига 53-55°С (точно соответствующим рассчитанным для каждой пары праймеров).

5
Соколова Т.М., Федорова Н.Е., Меджидова М.Г., Терехов С.М., Урываев Л.В., Кущ А.А. Регуляция уровня генной активности 2`, 5`-олигоаденилатсинтетазы в фибробластах человека при цитомегаловирусной инфекции // Вопр. вирусол. – 2007. – No 1. – С. 28-36.
Total in-text references: 3
  1. In-text reference with the coordinate start=18350
    Prefix
    Продукция инфекционного вируса чувствительными эмбриональными клетками была в 2,5 раза больше (6 lg БОЕ/ мл) и их гибель наступала раньше (на 2-3 день). На основании этих данных линия клеток ФЛЭЧ977 отнесена к высокочувствительной к ЦМВ, а линия клеток ФКЧ-1608 обладала резистентностью к ЦМВ
    Exact
    [5]
    Suffix
    . Транскрипционная активность IFN-генов в фибробластах человека, отличающихся пролиферативным состоянием и чувствительностью к ЦМВ Сравнительное определение конститутивных уровней экспрессии IFN-генов в диплоидных фибробластах человека, находившихся в состоянии пролиферативного покоя и в фазе синтеза ДНК показало, что в S-фазе клеточного цикла у фибробластов линии ФЛЭЧ-110044 активность ге

  2. In-text reference with the coordinate start=27202
    Prefix
    При высокой множественности заражения покоящихся фибробластов почти все чувствительные клетки (88-97%) к 24 ч инфекции содержали вирусные белки IEp72 и рр65 и около 50% клеток – белок gB. На ранних сроках острой вирусной инфекции (заражение чувствительных к ЦМВ неделящихся фибробластов) ЦМВ наиболее сильно активировал транскрипцию генов IFNα и фермента 2`, 5`-ОАС
    Exact
    [5]
    Suffix
    . Значительно слабее и только кратковременно ЦМВ индуцировал синтез мРНК IFNβ и IFNγ. При этом стимуляция активности гена IFNγ позитивно коррелировала с клеточной резистентностью к ЦМВ, а повышенная экспрессия гена IFNβ, наоборот, – с чувствительностью клеток к вирусу.

  3. In-text reference with the coordinate start=31939
    Prefix
    Таким образом, резистентность фибробластов человека к ЦМВ прямо коррелирует с конститутивным уровнем генной активности IFNα и сохранением его высокого уровня в процессе вирусной репликации. Ранее нами было показано, что в исследованных линиях клеток уровень репродукции ЦМВ зависит от активности гена IFN-зависимого фермента ОАС1
    Exact
    [5]
    Suffix
    . Сочетанное влияние ОАС, IFNα и IFNγ, по-видимому, является частью общего механизма ограничения репликации ЦМВ в фибробластах человека. Таким образом, развитие ЦМВ инфекции находится под контролем экспрессии генов лейкоцитарного и иммунного IFN.

6
Федорова Н.Е., Меджидова А.А., Меджидова М.Г., Кущ А.А. Блок клеточной пролиферации и патологии митоза в клетках, инфицированных цитомегаловирусом: роль периода клеточного цикла в момент заражения // Докл. АН. – 2003. – Т. 392. – No 4. – С. 552-555.
Total in-text references: 3
  1. In-text reference with the coordinate start=10645
    Prefix
    Синхронизация фибробластов в состоянии пролиферативного покоя (G0) и синтеза ДНК (S) достигалась лишением клеток сывороточных факторов роста на 48 ч с последующей стимуляцией пролиферации путем добавления среды с 15% ЭТС
    Exact
    [6]
    Suffix
    . Эксперименты на контрольных (незараженных) и опытных (зараженных ЦМВ) клетках ставили параллельно. Сроки исследования составляли 0, 3, 6, 12, 24, 48, 72 и 120 ч (см. раздел Результаты). Содержание мРНК α-, β- и IFNγ определяли с помощью полуколичественного варианта метода обратная транскрипция – полимеразная цепная реакция (ОТ-ПЦР) [3, 13].

  2. In-text reference with the coordinate start=13343
    Prefix
    Пары праймеров для мРНК IFNβ и IFNγ являются высокоспецифичными, так как связываются только с собственными матрицами [3]. Выявление вирусных белков (IEp72, рp65, gB) в клетках на разных сроках ЦМВ-инфекции проводили методом иммуноферментного анализа in situ с использованием моноклональных антител (МКА)
    Exact
    [6]
    Suffix
    . Клетки, окрашенные МКА, подсчитывали и выражали в процентах от общего числа клеток. Инфекционный титр ЦМВ определяли микрометодом «черных бляшек» под агаровым покрытием с помощью смеси МКА к структурным ЦМВ-белкам (рр65 и gB) [1].

  3. In-text reference with the coordinate start=15137
    Prefix
    Наблюдение за жизнеспособностью клеток позволило установить, что гибель большей части клеточной популяции (ЦПД вируса) в культуре покоящихся ФЛЭЧ110044 происходила на 4-5 день. В пролиферирующих клетках клеточная гибель наступала намного позднее, только на 10-11 день, и сопровождалась патологическими митозами
    Exact
    [6]
    Suffix
    . Сравнительное изучение клеточной резистентности к ЦМВ проводили на 2-х клеточных линиях фибробластов человека (ФЛЭЧ-977 и ФКЧРисунок 1. Гомология участков мРНК разных подтипов семейства IFNα в местах взаимодействия с прямым (А) и обратным (Б) праймерами Примечания.

7
Abate D.A., Watanabe S., Mocarski E.S. Major human cytomegalovirus structural protein pp65 (ppUL83) prevents interferon response factor 3 activation in the interferon response // J. Virol. – 2004. – Vol. 78. – P. 10995-11006.
Total in-text references: 2
  1. In-text reference with the coordinate start=8301
    Prefix
    Так, ЦМВ нарушал экспрессию генов IFN и МНС класса II, снижая уровень JAK1 в результате деградации [24]. Установлено, что вирионный белок рр65 ЦМВ подавлял процесс сигнальной трансдукции генов клеточной защиты
    Exact
    [7, 9]
    Suffix
    . Применив специальный метод (SVD-ДНК-чип анализ) для оценки ранее полученных данных действия ЦМВинфекции на транкрипцию генов человека, были выявлены новые функционально-важные гены, участвующие в регуляции транскрипции, клеточного цикла, онкогенеза, иммунного и интерферонного ответа [10].

  2. In-text reference with the coordinate start=29541
    Prefix
    По механизму действия белок IEp72 имеет сходство с недавно открытым у мышиного ЦМВ белком M27 (79 kDa), который инактивирует сигнальную трансдукцию, вызываемую IFNγ с участием STAT2 [34]. Структурный вирусный белок рр65 (UL83), по данным литературы
    Exact
    [7, 9]
    Suffix
    , также способен оказывать ингибирующее действие на индукцию и экспрессию антивирусных генов. Остается неизвестным, могут ли известные антагонисты антивирусного действия IFN (ингибиторы сигнальной трансдукции IFN-зависимых генов) неструктурный ранний вирусный белок IEp72 и основной структурный белок рр65, а также дсРНК-связывающий белок TRSI и белок IRSI [16] негативно влиять на экспрессию ге

8
Browne E., Wing B., Coleman D., Shenk T. Altered cellular mRNA levels in human cytomegalovirus-infected fibroblast: viral block to the accumulation of antiviral mRNAs // J. Virol. – 2001. – Vol. 75. – P. 12319-12330.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=5465
    Prefix
    к разным таксономическим группам (герпеса, гриппа, гепатита А, энцефалита, иммунодефицита человека), используют неодинаковые механизмы как индукции, так и подавления активности генов системы IFN [9, 15, 19, 25, 26]. Анализ экспрессии клеточных генов в фибробластах человека, зараженных ЦМВ, выполненный с применением технологии ДНК-чипов, показал изменения активности более чем 250 генов
    Exact
    [8, 17, 33]
    Suffix
    . Наибо лее выраженная реакция наблюдалась в группе IFNзависимых генов и генов, участвующих в контроле Sokolova T.M., Fedorova N.E., Medjidova M.G., Terekhov S.M., Uryvaev L.V., Kushch A.A. MechanisMs of cell resistance to cytoMegalovirus are connected with cell proliferation state and transcription activity of leukocyte and iMMune interferon genes abstract.

9
Browne E.P., Shenk T. Human cytomegalovirus UL83-coded pp65 virion protein inhibits antiviral gene expression in infected cells // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. – 2003. – Vol. 100. – P. 11439-11444.
Total in-text references: 3
  1. In-text reference with the coordinate start=5269
    Prefix
    Имеющиеся данные показывают, что вирусы, относящиеся к разным таксономическим группам (герпеса, гриппа, гепатита А, энцефалита, иммунодефицита человека), используют неодинаковые механизмы как индукции, так и подавления активности генов системы IFN
    Exact
    [9, 15, 19, 25, 26]
    Suffix
    . Анализ экспрессии клеточных генов в фибробластах человека, зараженных ЦМВ, выполненный с применением технологии ДНК-чипов, показал изменения активности более чем 250 генов [8, 17, 33]. Наибо лее выраженная реакция наблюдалась в группе IFNзависимых генов и генов, участвующих в контроле Sokolova T.

  2. In-text reference with the coordinate start=8301
    Prefix
    Так, ЦМВ нарушал экспрессию генов IFN и МНС класса II, снижая уровень JAK1 в результате деградации [24]. Установлено, что вирионный белок рр65 ЦМВ подавлял процесс сигнальной трансдукции генов клеточной защиты
    Exact
    [7, 9]
    Suffix
    . Применив специальный метод (SVD-ДНК-чип анализ) для оценки ранее полученных данных действия ЦМВинфекции на транкрипцию генов человека, были выявлены новые функционально-важные гены, участвующие в регуляции транскрипции, клеточного цикла, онкогенеза, иммунного и интерферонного ответа [10].

  3. In-text reference with the coordinate start=29541
    Prefix
    По механизму действия белок IEp72 имеет сходство с недавно открытым у мышиного ЦМВ белком M27 (79 kDa), который инактивирует сигнальную трансдукцию, вызываемую IFNγ с участием STAT2 [34]. Структурный вирусный белок рр65 (UL83), по данным литературы
    Exact
    [7, 9]
    Suffix
    , также способен оказывать ингибирующее действие на индукцию и экспрессию антивирусных генов. Остается неизвестным, могут ли известные антагонисты антивирусного действия IFN (ингибиторы сигнальной трансдукции IFN-зависимых генов) неструктурный ранний вирусный белок IEp72 и основной структурный белок рр65, а также дсРНК-связывающий белок TRSI и белок IRSI [16] негативно влиять на экспрессию ге

10
Challcombe J.F., Rechtsteiner A., Gottardo R., Rocha L.M., Browne E.P., Shenk T., Altherr M.R., Brettin T.S. Evaluation of the host transcriptional response to human cytomegalovirus infection // Physiol. Genomics. – 2004. – Vol. 18. – P. 51-62.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=8596
    Prefix
    Применив специальный метод (SVD-ДНК-чип анализ) для оценки ранее полученных данных действия ЦМВинфекции на транкрипцию генов человека, были выявлены новые функционально-важные гены, участвующие в регуляции транскрипции, клеточного цикла, онкогенеза, иммунного и интерферонного ответа
    Exact
    [10]
    Suffix
    . Вместе с тем многие вопросы, связанные с функционированием генов системы IFN в ЦМВ-инфицированных клетках, остаются нерешенными. К ним относятся такие, как зависимость экспрессии индивидуальных генов IFN I и II типа от скорости и формы развития ЦМВинфекции (острая и латентная).

11
Chen J., Baig E., Fish E.N. Diversity and relatedness among type I interferons // J. Interferon Cytokine Res. – 2004. – Vol. 24. – P. 687-698.
Total in-text references: 2
  1. In-text reference with the coordinate start=2980
    Prefix
    Введение Функционирование системы интерферона (IFN) является важной составляющей антивирусного, антипролиферативного и иммунного ответов на вирусную инфекцию [2]. Человеческие IFN разделены на типы I и II
    Exact
    [11, 14]
    Suffix
    . Первый тип включает многочисленные подтипы IFNα, а также IFNβ, IFNω, IFNτ, IFNκ, IFNε, IFNλ и IFNξ. Ко второму типу относится IFNγ. В настоящее время наиболее изучены α (лейкоцитарный), β (фибробластный) и γ (иммунный) IFN, которые производятся как лекарственные средства.

  2. In-text reference with the coordinate start=3978
    Prefix
    Хотя IFN типа I связываются на поверхности клеток с общим рецептором, состоящим из 2-х трансмембранных субъединиц (АR-1 и АR-2), между IFNα и IFNβ имеются отличия в индуцируемых сигнальных процессах
    Exact
    [11]
    Suffix
    . IFNγ имеет другой рецептор связывания с клетками – GR, также состоящий из 2-х субъединиц (GR1 и GR2). После взаимодействия IFN со специфическими рецепторами происходит активация тирозиновых киназ (JAK) и фосфорилирование латентных цитоплазматических факторов транскрипции (STAT).

12
Chomzynski P., Sacchi N. Single-step method of RNA isolation by acid guanidinium thioocyanatephenol-chloroform extraction // Anal. Biochem. – 1987. – Vol. 162. – P. 156-159.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=11086
    Prefix
    Содержание мРНК α-, β- и IFNγ определяли с помощью полуколичественного варианта метода обратная транскрипция – полимеразная цепная реакция (ОТ-ПЦР) [3, 13]. Для выделения суммарной клеточной РНК использовали метод гуанидин-тиоцианат-фенол-хлороформ
    Exact
    [12]
    Suffix
    . Реакцию обратной транскрипции (ОТ) проводили на матрице поли(А)РНК с универсальным праймером олиго(дТ)16 и ферментом обратная транскриптаза (200 ед/мкл MBI «Fermentas» Латвия) при 42°С 1 ч. Аликвоты полученных кДНК без разведения и в 10-кратных разведениях (от 10-1 до 10-4) амплифицировали в ПЦР со специфическими парами праймеров, рассчитанными нами по известным нуклеотидным последовательно

13
Dallman M.J., Porter A.C.G. Semiquantitative PCR for the analysis of gene expression // PCR. A practical approach / Ed. by M.J. McPherson et al. – Oxford, 1993. – P. 215-224.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=10985
    Prefix
    Сроки исследования составляли 0, 3, 6, 12, 24, 48, 72 и 120 ч (см. раздел Результаты). Содержание мРНК α-, β- и IFNγ определяли с помощью полуколичественного варианта метода обратная транскрипция – полимеразная цепная реакция (ОТ-ПЦР)
    Exact
    [3, 13]
    Suffix
    . Для выделения суммарной клеточной РНК использовали метод гуанидин-тиоцианат-фенол-хлороформ [12]. Реакцию обратной транскрипции (ОТ) проводили на матрице поли(А)РНК с универсальным праймером олиго(дТ)16 и ферментом обратная транскриптаза (200 ед/мкл MBI «Fermentas» Латвия) при 42°С 1 ч.

14
Diaz M.O., Bohlander S., Allen G. Nomenclature of the human interferon genes // J. Interferon. Cytokine Res. –1996. – Vol. 16. – P. 179-180.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=2980
    Prefix
    Введение Функционирование системы интерферона (IFN) является важной составляющей антивирусного, антипролиферативного и иммунного ответов на вирусную инфекцию [2]. Человеческие IFN разделены на типы I и II
    Exact
    [11, 14]
    Suffix
    . Первый тип включает многочисленные подтипы IFNα, а также IFNβ, IFNω, IFNτ, IFNκ, IFNε, IFNλ и IFNξ. Ко второму типу относится IFNγ. В настоящее время наиболее изучены α (лейкоцитарный), β (фибробластный) и γ (иммунный) IFN, которые производятся как лекарственные средства.

15
Goswami B.B., Kulka M., Ngo D., Cebula T.A. Apoptosis induced by a cytopathic hepatitis A virus is dependent on caspase activation following ribosomal RNA degradation but occurs in the absence of 2’-5’ oligoadenylate synthetase // Antiviral Res. – 2004. – Vol. 63. – P. 153-166.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=5269
    Prefix
    Имеющиеся данные показывают, что вирусы, относящиеся к разным таксономическим группам (герпеса, гриппа, гепатита А, энцефалита, иммунодефицита человека), используют неодинаковые механизмы как индукции, так и подавления активности генов системы IFN
    Exact
    [9, 15, 19, 25, 26]
    Suffix
    . Анализ экспрессии клеточных генов в фибробластах человека, зараженных ЦМВ, выполненный с применением технологии ДНК-чипов, показал изменения активности более чем 250 генов [8, 17, 33]. Наибо лее выраженная реакция наблюдалась в группе IFNзависимых генов и генов, участвующих в контроле Sokolova T.

16
Hakki M., Geballe A.P. Double-standed RNA binding by human cytomegalovirus pTRSI // J. Virol. – 2005. – Vol. 79. – P. 7311-7318.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=29908
    Prefix
    Остается неизвестным, могут ли известные антагонисты антивирусного действия IFN (ингибиторы сигнальной трансдукции IFN-зависимых генов) неструктурный ранний вирусный белок IEp72 и основной структурный белок рр65, а также дсРНК-связывающий белок TRSI и белок IRSI
    Exact
    [16]
    Suffix
    негативно влиять на экспрессию генов IFNα. По нашим данным, скорость и уровень синтеза вирусных белков IEp72 и рр65 в высокочувствительных клетках были значительно выше, чем в резистентных. Как стимулирующий, так и ингибиторный эффекты ЦМВ на экспрессию генов IFNα имели временную зависимость и прямо зависели от динамики синтеза каждого из этих белков.

17
Hertel L., Mocarski E.S. Global analysis of host cell gene expression late during cytomegalovirus infection reveals extensive dysregulation of cell cycle gene expression and induction of pseudomitosis independent of US28 function // J. Virol. – 2004. – Vol. 78. – P. 11988-12011.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=5465
    Prefix
    к разным таксономическим группам (герпеса, гриппа, гепатита А, энцефалита, иммунодефицита человека), используют неодинаковые механизмы как индукции, так и подавления активности генов системы IFN [9, 15, 19, 25, 26]. Анализ экспрессии клеточных генов в фибробластах человека, зараженных ЦМВ, выполненный с применением технологии ДНК-чипов, показал изменения активности более чем 250 генов
    Exact
    [8, 17, 33]
    Suffix
    . Наибо лее выраженная реакция наблюдалась в группе IFNзависимых генов и генов, участвующих в контроле Sokolova T.M., Fedorova N.E., Medjidova M.G., Terekhov S.M., Uryvaev L.V., Kushch A.A. MechanisMs of cell resistance to cytoMegalovirus are connected with cell proliferation state and transcription activity of leukocyte and iMMune interferon genes abstract.

18
Iyer V.R., Eisen M.B., Ross D.T., Schuler G., Moore T., Lee J.C., Trent J.M., Staudt L.M., Hud son J.Jr.,Boguski M.S., Lashkari D., Shalon D., Botstein D., Brown P.O. The transcriptional program in the response of human fibroblasts to serum // Science. – 1999. – Vol. 283. – P. 83-87.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=19161
    Prefix
    Это означает, что в фибробластах человека транскрипционная активность генов IFNα позитивно коррелирует с уровнем синтеза клеточной ДНК. Можно предположить, что в регуляции генов IFNα принимают участие известные регуляторы клеточного цикла и синтеза клеточной ДНК (р53, циклин-зависимых киназ, E2F и др.)
    Exact
    [18]
    Suffix
    . Высокие уровни транскрипции мРНК IFNα в фазе синтеза ДНК, которые определяются полуколичественной ОТПЦР в разведении кДНК в 1000 раз, не сопровождаются секрецией из клеток биологически активного IFN (данные не приводятся).

19
Karpov A.V. Endogenous and exogenous interferons in HIV-infection // Eur. J. Med. Res. –
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=5269
    Prefix
    Имеющиеся данные показывают, что вирусы, относящиеся к разным таксономическим группам (герпеса, гриппа, гепатита А, энцефалита, иммунодефицита человека), используют неодинаковые механизмы как индукции, так и подавления активности генов системы IFN
    Exact
    [9, 15, 19, 25, 26]
    Suffix
    . Анализ экспрессии клеточных генов в фибробластах человека, зараженных ЦМВ, выполненный с применением технологии ДНК-чипов, показал изменения активности более чем 250 генов [8, 17, 33]. Наибо лее выраженная реакция наблюдалась в группе IFNзависимых генов и генов, участвующих в контроле Sokolova T.

20
1. – Vol. 6. – P. 507-524. 20. Knipe D.M., Samuel C.E., Palese P. Virushost cell interactions // Fields virology / Ed. by D.M. Knipe et al. – Lippincott-Raven, Philadelphia, 2001. – P. 133-170.
Total in-text references: 2
  1. In-text reference with the coordinate start=5012
    Prefix
    При вирусной инфекции происходит преимущественная активация IFN-регулируемого фактора IRF-3, а также дополнительно факторов IRF-7 и IRF-9 [27]. ДНК- и РНК-содержащие вирусы кодируют белки, нарушающие процесс сигнальной активации JAK-STAT IFN-генов
    Exact
    [20]
    Suffix
    . Имеющиеся данные показывают, что вирусы, относящиеся к разным таксономическим группам (герпеса, гриппа, гепатита А, энцефалита, иммунодефицита человека), используют неодинаковые механизмы как индукции, так и подавления активности генов системы IFN [9, 15, 19, 25, 26].

  2. In-text reference with the coordinate start=23770
    Prefix
    Более того, ген UL18 ЦМВ кодирует гомолог HLA I класса, а вирусный белок рр65 селективкДНК кДНК ЦМВ 383 383 А Б – 1 1 10 10 + 6 6 100 100 + 2 2 100 100 – 7 7 1000 1000 – 3 3 1000 1000 + 8 8 10000 10000 + 4 4 10000 10000 – 5 5 10 10 но подавляет образование антигенных пептидов
    Exact
    [20, 27]
    Suffix
    . Представленные данные впервые свидетельствуют о существовании в фибробластах человека IFN-зависимого транскрипционного механизма контроля развития ЦМВ-инфекции, в котором ведущая роль принадлежит генам IFNα.

21
Kotenko S.V., Saccani S., Izotova L.S., Microchnitchenko O.V., Pestka S. Human cytomegalovirus harbors its own unique IL-10 homolog (cmv IL-10) // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. – 2000. – Vol. 97. – P. 1695-1700.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=28837
    Prefix
    В ЦМВ-геноме найден гомолог клеточного IL-10, который играет ключевую роль в контроле экспрессии генов IFN и антигенов главного комплекса гистосовместимости (HLA), подавляет пролиферацию лимфоцитов и моноцитов и продукцию ими провоспалительных цитокинов (TNFα, IL-1, IL-6)
    Exact
    [21, 30]
    Suffix
    . По своему действию IL-10 относится к иммуносупрессивным лимфокинам. Установлено, что он подавляет ответ клеток на IFNα и IFNγ, блокируя транскрипционный фактор STAT1 путем активации универсального ингибитора SOCS.

22
Lee G.C., Yi H.A., Lee C.H. Stimulation of interferon-beta gene expression by human cytomegalovirus via nuclear factor kappa B and phosphatidylinositol 3-kinase pathway // Virus Res. – 2006. – Vol. 117. – P. 209-214.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=27607
    Prefix
    При этом стимуляция активности гена IFNγ позитивно коррелировала с клеточной резистентностью к ЦМВ, а повышенная экспрессия гена IFNβ, наоборот, – с чувствительностью клеток к вирусу. Возможно, что разные штаммы ЦМВ отличаются IFN-индуцирующей активностью (в работе использован штамм AD169). По данным литературы
    Exact
    [22]
    Suffix
    , штамм Towne ЦМВ в чувствительной культуре фибробластах человека стимулировал транскрипцию гена IFNβ через 3 и 6 ч после заражения, при этом в культуральную среду секретировался биологически активный IFNβ.

23
Loenen W., Bruggemen C., Wiertz E. Immune evasion by human cytomegalovirus: lesions in immunology and cell biology // Semin. Immunol. – 2001. – Vol. 13. – P. 41-49.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=23280
    Prefix
    Поэтому уровень резистентности исследованных линий фибробластов человека к ЦМВ не был связан с уровнями экспрессии мРНК IFNβ. Обсуждение В организме человека ЦМВ преимущественно находится в латентной форме. Активация ЦМВинфекции происходит на фоне иммунодефицитных состояний
    Exact
    [2, 23]
    Suffix
    . ЦМВ обладает рядом механизмов иммуносупрессии и ускользания от иммунного ответа организма. Продукты генов US2, US3, US6, US11 вирусного генома интерферируют с процессингом и презентацией антигенов.

24
Miller D.M., Rahill B.M., Boss J.M. Human cytomegalovirus inhibits major Histocompatibility complex class II expression by disruption of the JAK/STAT pathway // J. Exp. Med. – 1998. – Vol. 187. – P. 675-683.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=8189
    Prefix
    Уровень стимуляции генной активности отдельных IFN-регулируемых генов нативным (инфекционным) ЦМВ по сравнению с инактивированным (неинфекционным) был заметно ниже. Поэтому ЦМВ скорее негативно регулировал клеточный антивирусный ответ. Так, ЦМВ нарушал экспрессию генов IFN и МНС класса II, снижая уровень JAK1 в результате деградации
    Exact
    [24]
    Suffix
    . Установлено, что вирионный белок рр65 ЦМВ подавлял процесс сигнальной трансдукции генов клеточной защиты [7, 9]. Применив специальный метод (SVD-ДНК-чип анализ) для оценки ранее полученных данных действия ЦМВинфекции на транкрипцию генов человека, были выявлены новые функционально-важные гены, участвующие в регуляции транскрипции, клеточного цикла, онкогенеза, иммунного и интерферонного отв

25
Ohyama K., Sano T., Toyoda H. Predominant contribution of IFN-beta expression to apoptosis induction in human uterine cervical fibroblast cells by influenza-virus infection // Biol. Pharm. Bull. – 2004. – Vol. 27. – P. 1750-1757.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=5269
    Prefix
    Имеющиеся данные показывают, что вирусы, относящиеся к разным таксономическим группам (герпеса, гриппа, гепатита А, энцефалита, иммунодефицита человека), используют неодинаковые механизмы как индукции, так и подавления активности генов системы IFN
    Exact
    [9, 15, 19, 25, 26]
    Suffix
    . Анализ экспрессии клеточных генов в фибробластах человека, зараженных ЦМВ, выполненный с применением технологии ДНК-чипов, показал изменения активности более чем 250 генов [8, 17, 33]. Наибо лее выраженная реакция наблюдалась в группе IFNзависимых генов и генов, участвующих в контроле Sokolova T.

26
Paulus Ch., Krauss S., Nevels M. A human cytomegalovirus antagonist of type I IFN-dependent signal transducer and activator of transcription signaling // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. – 2006. – Vol. 103. – P. 3840-3845.
Total in-text references: 3
  1. In-text reference with the coordinate start=5269
    Prefix
    Имеющиеся данные показывают, что вирусы, относящиеся к разным таксономическим группам (герпеса, гриппа, гепатита А, энцефалита, иммунодефицита человека), используют неодинаковые механизмы как индукции, так и подавления активности генов системы IFN
    Exact
    [9, 15, 19, 25, 26]
    Suffix
    . Анализ экспрессии клеточных генов в фибробластах человека, зараженных ЦМВ, выполненный с применением технологии ДНК-чипов, показал изменения активности более чем 250 генов [8, 17, 33]. Наибо лее выраженная реакция наблюдалась в группе IFNзависимых генов и генов, участвующих в контроле Sokolova T.

  2. In-text reference with the coordinate start=29284
    Prefix
    Недавно показано, что белок IEp72 в ядрах инфицированных клеток, непосредственно взаимодействуя с факторами транскрипции STAT1 и STAT2, предотвращает их ассоциацию и фактора IRF9 с промоторами IFN-стимулированных генов
    Exact
    [26]
    Suffix
    . По механизму действия белок IEp72 имеет сходство с недавно открытым у мышиного ЦМВ белком M27 (79 kDa), который инактивирует сигнальную трансдукцию, вызываемую IFNγ с участием STAT2 [34]. Структурный вирусный белок рр65 (UL83), по данным литературы [7, 9], также способен оказывать ингибирующее действие на индукцию и экспрессию антивирусных генов.

  3. In-text reference with the coordinate start=31599
    Prefix
    Эти данные совместно с результатами недавно опубликованной работы вносят коррективы в представления о роли IFNβ, который называют также фибробластным, в защите диплоидных фибробластов человека от вирусной (по крайней мере, от цитомегаловирусной) инфекции
    Exact
    [26]
    Suffix
    . Таким образом, резистентность фибробластов человека к ЦМВ прямо коррелирует с конститутивным уровнем генной активности IFNα и сохранением его высокого уровня в процессе вирусной репликации. Ранее нами было показано, что в исследованных линиях клеток уровень репродукции ЦМВ зависит от активности гена IFN-зависимого фермента ОАС1 [5].

27
Samuel C.E. Antiviral actions of interferons // Clin. Microb. Rev. – 2001. – Vol. 14. – P. 778-809.
Total in-text references: 3
  1. In-text reference with the coordinate start=4902
    Prefix
    В передаче сигнала IFNγ участвуют тирозиновые киназы JAK-1 и JAK-2 и гомодимер фактора транскрипции STAT1, который, транслоцируясь в ядро, взаимодействует с γ-активируемой последовательностью (GAS), найденной в IFNγ-зависимых генах. При вирусной инфекции происходит преимущественная активация IFN-регулируемого фактора IRF-3, а также дополнительно факторов IRF-7 и IRF-9
    Exact
    [27]
    Suffix
    . ДНК- и РНК-содержащие вирусы кодируют белки, нарушающие процесс сигнальной активации JAK-STAT IFN-генов [20]. Имеющиеся данные показывают, что вирусы, относящиеся к разным таксономическим группам (герпеса, гриппа, гепатита А, энцефалита, иммунодефицита человека), используют неодинаковые механизмы как индукции, так и подавления активности генов системы IFN [9, 15, 19, 25, 26].

  2. In-text reference with the coordinate start=23770
    Prefix
    Более того, ген UL18 ЦМВ кодирует гомолог HLA I класса, а вирусный белок рр65 селективкДНК кДНК ЦМВ 383 383 А Б – 1 1 10 10 + 6 6 100 100 + 2 2 100 100 – 7 7 1000 1000 – 3 3 1000 1000 + 8 8 10000 10000 + 4 4 10000 10000 – 5 5 10 10 но подавляет образование антигенных пептидов
    Exact
    [20, 27]
    Suffix
    . Представленные данные впервые свидетельствуют о существовании в фибробластах человека IFN-зависимого транскрипционного механизма контроля развития ЦМВ-инфекции, в котором ведущая роль принадлежит генам IFNα.

  3. In-text reference with the coordinate start=28300
    Prefix
    Наиболее вероятными активаторами генов IFNα и IFNγ были вирионный белок gB (в условиях высокой множественности заражения) и сверхранний белок IE72, который образовывался в первые 3 ч острой ЦМВ-инфекции и способен индуцировать синтез IFN-регулируемых факторов транскрипции (IRF1, IRF3 и др.)
    Exact
    [27,29]
    Suffix
    . Однако последующее развитие острой ЦМВ-инфекции сопровождалось накоплением ингибиторов транскрипции генов IFNα. По нашим данным, к 24 ч инфекции в чувствительных линиях ФЛЭЧ в продуктах ЦМВ репликации содержались антагонисты генной активности IFNα.

29
Simmen K., Singh J., Luukkonen B., Lopper M., Bittner A., Miller N., Jackson M., Compton T., Fruh K. Global modification of cellular transcription by human cytomegalovirus is initiated by viral glicoprotein B // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. – 2001. – Vol. 98. – P. 7140-7145.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=28300
    Prefix
    Наиболее вероятными активаторами генов IFNα и IFNγ были вирионный белок gB (в условиях высокой множественности заражения) и сверхранний белок IE72, который образовывался в первые 3 ч острой ЦМВ-инфекции и способен индуцировать синтез IFN-регулируемых факторов транскрипции (IRF1, IRF3 и др.)
    Exact
    [27,29]
    Suffix
    . Однако последующее развитие острой ЦМВ-инфекции сопровождалось накоплением ингибиторов транскрипции генов IFNα. По нашим данным, к 24 ч инфекции в чувствительных линиях ФЛЭЧ в продуктах ЦМВ репликации содержались антагонисты генной активности IFNα.

30
Spenser J.V., Lockridge K.M., Barry P.A., Lin G., Tsang M., Penfold M.E., Shall T.J. Potent immunosuppressive activities of cytomegalovirusencoded interleukin-10 // J. Virol. – 2002. – Vol. 76. – P. 1285-1292.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=28837
    Prefix
    В ЦМВ-геноме найден гомолог клеточного IL-10, который играет ключевую роль в контроле экспрессии генов IFN и антигенов главного комплекса гистосовместимости (HLA), подавляет пролиферацию лимфоцитов и моноцитов и продукцию ими провоспалительных цитокинов (TNFα, IL-1, IL-6)
    Exact
    [21, 30]
    Suffix
    . По своему действию IL-10 относится к иммуносупрессивным лимфокинам. Установлено, что он подавляет ответ клеток на IFNα и IFNγ, блокируя транскрипционный фактор STAT1 путем активации универсального ингибитора SOCS.

31
Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H., Derge J.G., Klausner R.D., Collins F.S., Wagner L., Shenmen C.M., Schuler G.D., Altschul S.F., Zee berg B., Buetow K.H., Schaefer C.F., Bhat N.K., Hopkins R.F., Jordan H., Moore T., Max S.I., Wang J., Hsieh F., Diatchenko L., Marusina K., Farmer A.A., Rubin G.M., Hong L., Stapleton M., Soares M.B., Bonaldo M.F., Casavant T.L., Scheetz T.E., Brownstein M.J., Usdin T.B., Toshiyuki S., Carninci P., Prange C., Raha S.S., Loquellano N.A., Peters G.J., Abramson R.D., Mullahy S.J., Bosak S.A., McEwan P.J., McKernan K.J., Malek J.A., Gunaratne P.H., Richards S., Worley K.C., Hale S., Garcia A.M., Gay L.J., Hulyk S.W., Villalon D.K., Muzny D.M., Sodergren E.J., Lu X., Gibbs R.A., Fahey J., Helton E., Ketteman M., Madan A., Rodrigues S.
Total in-text references: 2
  1. In-text reference with the coordinate start=3771
    Prefix
    В настоящее время известна первичная структура экспрессируемых мРНК 12 видов IFNα из нескольких типов клеток и только по одному виду IFNβ и IFNγ (MGC cDNA libraries, NCBI, http://mgc.nci.nih.gov)
    Exact
    [31]
    Suffix
    . Хотя IFN типа I связываются на поверхности клеток с общим рецептором, состоящим из 2-х трансмембранных субъединиц (АR-1 и АR-2), между IFNα и IFNβ имеются отличия в индуцируемых сигнальных процессах [11].

  2. In-text reference with the coordinate start=12700
    Prefix
    Проведено выравнивание всех известных нуклеотидных последовательностей, экспрессируемых мРНК разных видов α-, β- и γ-интерферонов, которые представлены последовательностями MGC в NCBI Генбанке (http://mgc.nci.nih.gov)
    Exact
    [31]
    Suffix
    . Анализ взаимодействия использованных олигонуклеотидных праймеров с исследованными матрицами показал, что пара праймеров для IFNα универсальна. Прямой праймер безошибочно связывается с кДНК 5-ти разновидностей IFNα (4, 7, 8, 17 и 21), а обратный – комплементарен участкам мРНК 7-ми вариантов IFNα (1, 2, 4, 7, 13, 14 и 21) (рис. 1).

32
Taylor R.T., Bresnahan W.A. Human cytomegalovirus immediate-early 2 gene expression blocks virus-induced beta interferon production // J. Virol. – 2005. – Vol. 79. – P. 3873-3877.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=27999
    Prefix
    [22], штамм Towne ЦМВ в чувствительной культуре фибробластах человека стимулировал транскрипцию гена IFNβ через 3 и 6 ч после заражения, при этом в культуральную среду секретировался биологически активный IFNβ. В стимуляции экспрессии гена IFNβ участвовали универсальный фактор NFκB и фосфатидилинозитол 3-киназа (PI3-K). Сверхранний вирусный белок IE86 эффективно блокировал индукцию IFNβ
    Exact
    [32]
    Suffix
    . Наиболее вероятными активаторами генов IFNα и IFNγ были вирионный белок gB (в условиях высокой множественности заражения) и сверхранний белок IE72, который образовывался в первые 3 ч острой ЦМВ-инфекции и способен индуцировать синтез IFN-регулируемых факторов транскрипции (IRF1, IRF3 и др.) [27,29].

33
Zhu H., Cong J.P., Mamtora J., Gingeras T., Shenk T. Cellular gene expression altered by human cytomegalovirus: global monitoring with oligonucleotide arrays // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. – 1998. – Vol. 95. – P. 14470-14475.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=5465
    Prefix
    к разным таксономическим группам (герпеса, гриппа, гепатита А, энцефалита, иммунодефицита человека), используют неодинаковые механизмы как индукции, так и подавления активности генов системы IFN [9, 15, 19, 25, 26]. Анализ экспрессии клеточных генов в фибробластах человека, зараженных ЦМВ, выполненный с применением технологии ДНК-чипов, показал изменения активности более чем 250 генов
    Exact
    [8, 17, 33]
    Suffix
    . Наибо лее выраженная реакция наблюдалась в группе IFNзависимых генов и генов, участвующих в контроле Sokolova T.M., Fedorova N.E., Medjidova M.G., Terekhov S.M., Uryvaev L.V., Kushch A.A. MechanisMs of cell resistance to cytoMegalovirus are connected with cell proliferation state and transcription activity of leukocyte and iMMune interferon genes abstract.

34
Zimmerman A., Trilling M., Wagner M., Wilborn M., Bubic I., Jonjic S., Koszinowski U., Hengel H. A cytomegaloviral protein reveals a dual role for STAT2 in IFNγ signaling and antiviral responses // J. Exp.Med. – 2005. – Vol. 201. –
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=29474
    Prefix
    , что белок IEp72 в ядрах инфицированных клеток, непосредственно взаимодействуя с факторами транскрипции STAT1 и STAT2, предотвращает их ассоциацию и фактора IRF9 с промоторами IFN-стимулированных генов [26]. По механизму действия белок IEp72 имеет сходство с недавно открытым у мышиного ЦМВ белком M27 (79 kDa), который инактивирует сигнальную трансдукцию, вызываемую IFNγ с участием STAT2
    Exact
    [34]
    Suffix
    . Структурный вирусный белок рр65 (UL83), по данным литературы [7, 9], также способен оказывать ингибирующее действие на индукцию и экспрессию антивирусных генов. Остается неизвестным, могут ли известные антагонисты антивирусного действия IFN (ингибиторы сигнальной трансдукции IFN-зависимых генов) неструктурный ранний вирусный белок IEp72 и основной структурный белок рр65, а также дсРНК-связы