The 21 references with contexts in paper M. Smolnikova V., V. Kozhevnikov S., V. Konenkov I., М. Смольникова В., В. Кожевников С., В. Коненков И. (2014) “АНАЛИЗ АССОЦИИРОВАННОСТИ АЛЛЕЛЕЙ ПРОМОТОРНЫХ РЕГИОНОВ ГЕНОВ TNFA, IL2, IL4 И IL10 С ПАРАМЕТРАМИ СОСТОЯНИЯ ИММУННОЙ СИСТЕМЫ У ВИЧ-ИНФИЦИРОВАННЫХ ПАЦИЕНТОВ // ANALYSIS OF ASSOCIATIONS BETWEEN PROMOTER ALLELES OF TNFA, IL2. IL4 AND IL10, AND PARAMETERS OF IMMUNE SYSTEM IN HIV-INFECTED PATIENTS” / spz:neicon:mimmun:y:2006:i:6:p:659-666

1
Иммунодефицитные состояния / под ред. проф. Смирнова В.С., Фрейдлин И.С. - СПб: Фолиант, 2000. - С.411-447.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=25604
    Prefix
    В то же время этот генный вариант ассоциирован с несколько сниженным уровнем сывороточного IgG по сравнению с носителями генотипа G/G. Показано, что гипергаммаглобулинемия наблюдается по мере нарастания прогрессии инфекции в хронической фазе заболевания, причем 95% иммуноглобулинов является неспецифическими
    Exact
    [1]
    Suffix
    . Это указывает на негативное значение генотипа G/A гена TNFA в характере течения ВИЧ-инфекции. Очевидно, что в результате ВИЧ-инфекции Т-лимфоциты носителей T/T генотипа, ассоциированного с заболеванием [21], более выраженно утрачивают способность эффективно пролиферировать, тем более что у этих лиц нами показан более сниженный уровень продукции IL-2, чем у носи

2
Кетлинский С.А., Симбирцев А.С., Воробьев А.А. Эндогенные иммуномодуляторы. - СПб: Гиппократ, 1992.- 256 с.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=23264
    Prefix
    Известно, что ВИЧ подавляет продукцию IL-2, встраиваясь в геном хозяина рядом с регуляторными последовательностями гена IL2, тем самым снижая его активность, кроме этого, продукт гена ВИЧ взаимодействует со структурой, в норме регулирующей экспрессию рецептора IL-2, и препятствует нормальному функционированию иммунорегулятора
    Exact
    [2]
    Suffix
    . Нами показано, что у ВИЧ-инфицированных пациентов уровень IL-2 ниже, чем у доноров, причем наиболее низкая концентрация установлена у носителей T/T варианта. Учитывая, что этот аллельный вариант -330Т имеет тенденцию к ассоциации с ВИЧ-инфекцией [21], можно предположить, что эта форма гена обладает более низкой по сравнению с вариантом -330G способностью к экспрессии

3
Смольникова М.В., Прокофьев В.Ф., Сизякина Л.П., Шемшура А.Б., Ольховский И.А., Коненков В.И. Аллельные варианты генов IL-4, IL-10 и TNFα при ВИЧ инфекции // Цитокины и воспаление. - 2002. - T.1. - N1. - C.35-39.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=9026
    Prefix
    Все ВИЧ-инфицированные (n=127) и здоровые лица (n=52) были прогенотипированы на четыре однонуклеотидных замены (SNP) в промоторных регионах генов: TNFA (G-308A), IL2 (T-330G), IL4 (C-590T), IL10 (C-597A). Генотипирование аллельных вариантов осуществляли методом рестриктного анализа продуктов амплификации специфических участков генома по описанным ранее методикам
    Exact
    [3, 21]
    Suffix
    . Определение уровня продукции цитокинов Для изучения продукции цитокинов в кондиционных средах от клеток пациентов, мононуклеарные клетки (МНК) выделяли из гепаринизированной венозной крови путем ее центрифугирования в градиенте плотности фиколл-верографина.

4
Ярилин А.А. Система цитокинов и принципы ее функционирования в норме и при патологии // Иммунология. - 1997. - N5. - С. 7-14.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=5535
    Prefix
    Тем самым усложняется анализ функций отдельно взятых цитокинов в качестве моделей для исследования влияния их генов, а также непосредственно белкового продукта этих генов на формирование иммунной реакции на внешние или аутологичные воздействия [12, 14, 18]. Существуют значительные индивидуальные и этнические различия в продукции цитокинов
    Exact
    [4]
    Suffix
    . Различия между максимальным и минимальным уровнями продукции некоторых цитокинов часто достигают десятикратных величин, и эти показатели постоянны в разные промежутки времени [10]. В процессе изучения ассоциированности аллельного полиморфизма генов с уровнем продукции цитокинов происходит определение взаимосвязи между индивидуальными полиморфными аллелями, а также гаплотипами гено

5
Ameisen J.C., Capron A. Cell dysfunction and depletion in AIDS: the programmed cell death hypothesis // Immunol. Today.- 1991.- V.12(4).- P.102-105.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=6419
    Prefix
    в патогенезе ВИЧ-инфекции проявляется в регуляции апоптоза иммунокомпетентных клеток у инфицированных пациентов, играющего основную роль в формировании иммуносупрессии, причиной чего является гиперпродукция TNFα, IL-4, IL-6, IL-10, стимулирующих запрограм-мированную клеточную смерть, и низкое содержание IL-2, IL-12, TGFβ, оказывающих протективное действие на клетки
    Exact
    [5]
    Suffix
    . Кроме этого, цитокины оказывают влияние на репликацию ВИЧ в организме, а дисбаланс продуцируемых Th1 и Th2 лимфоцитами цитокинов оказывает влияние на силу ответа иммунной системы на антигены вируса.

6
Bidwell J., Keen L., Gallageher G., Kimberly R., Huizinga T., McDermott M.F., Oksenberg J., McNicholl J., Pociot F., Hardt C., D’Alfonso S. Cytokine gene polymorphism in human disease: on-line databases // Genes Immun. - 1999. - V.1. - P. 3-19.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=5987
    Prefix
    В процессе изучения ассоциированности аллельного полиморфизма генов с уровнем продукции цитокинов происходит определение взаимосвязи между индивидуальными полиморфными аллелями, а также гаплотипами генов цитокинов и продукцией белкового продукта in vitro
    Exact
    [6, 17]
    Suffix
    . Важная роль иммуномодуляторов в патогенезе ВИЧ-инфекции проявляется в регуляции апоптоза иммунокомпетентных клеток у инфицированных пациентов, играющего основную роль в формировании иммуносупрессии, причиной чего является гиперпродукция TNFα, IL-4, IL-6, IL-10, стимулирующих запрограм-мированную клеточную смерть, и низкое содержание IL-2, IL-12, TGFβ, оказывающих протективное

7
Butera S.T. Cytokine involvement in viral permissiveness and the progression of HIV disease // J. Cell Biochem. - 1994. - N53. - P. 336-342.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=22481
    Prefix
    Отмеченный нами факт повышенной спонтанной продукции TNFα клетками инфицированных лиц по сравнению с МНК здоровых лиц может иметь важное значение в прогрессии заболевания, так как TNFα обладает способностью усиливать репликацию ВИЧ, находящегося в «дремлющем» состоянии в зараженных клетках и распространению инфекции в организме
    Exact
    [7]
    Suffix
    . В исследованной группе ВИЧ-инфицированных наблюдалось снижение уровня TNFα в ответ на стимуляцию митогеном по сравнению с ответом стимулированных клеток здоровых лиц, причем более низкий ответ клеток носителей генотипа G/A (-308А - аллель, ассоциированный с повышением экспрессии гена [16]) может говорить о более деструктивном характере поражения их клеток под влиянием вир

8
Digeon M., Laver M., Riza J., Bach J.F. Detection of circulating immune complexes in human sera by simplified assays with polyethylene glycol // J. Immunol. Methods. - 1977. – V.16. - P. 165-183.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=11948
    Prefix
    Функциональное состояние В-лимфоцитов оценивалось по содержанию иммуноглобулинов (IgA, IgM, IgG) в сыворотке крови методом радиальной иммунодиффузии по Манчини с использованием тест-систем “Диагностикум” (Институт иммунологии МЗ РФ, Москва). Определение количества циркулирующих иммунных комплексов (ЦИК) в сыворотке крови проводили турбодиметрическим методом
    Exact
    [8]
    Suffix
    . Для оценки состояния фагоцитарного звена у ВИЧ-инфицированных изучали интенсивность окислительно-восстановительных процессов МНК в НСТ-тесте (Т.В. Михеенко с соавт., 1991). В дополнение к этому у ВИЧ-инфицированных анализировали специфические тесты: титр ВИЧ-антител для оценки гуморального звена иммунитета; уровень провирусной нагрузки мононуклеаров периферической крови (P

9
Foli A., Saville M.W., Baseler M.W., Yarchoan R. Effects of the Th1 and Th2 stimulatory cytokines interleukin-12 and interleukin-4 on human immunodeficiency virus replication // Blood. -1995. - V.85(8). - P.2114-2123.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=23881
    Prefix
    имеет тенденцию к ассоциации с ВИЧ-инфекцией [21], можно предположить, что эта форма гена обладает более низкой по сравнению с вариантом -330G способностью к экспрессии и обуславливает пониженную продукцию IL-2 у инфицированных лиц. Резюмируя полученные ранее и описанные в литературе данные, можно было бы ожидать увеличения уровня продукции цитокина у носителей аллеля -590Т
    Exact
    [9, 15]
    Suffix
    . Тем более что наши результаты по распределению аллельных вариантов гена IL4 показали повышенную частоту генотипа T/T среди инфицированных лиц и тенденцию к ассоциации аллеля -590Т с ВИЧ-инфекцией [21].

10
Gandhi R., Chen B., Straus S., Dale J.K., Lenardo M.J., Baltimore D. HIV-1 directly kills CD4 T cells by a Fas-independent mechanism // J. Exp. Med.- 1998. - V.187(7). - P.1113-1122.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=5722
    Prefix
    Существуют значительные индивидуальные и этнические различия в продукции цитокинов [4]. Различия между максимальным и минимальным уровнями продукции некоторых цитокинов часто достигают десятикратных величин, и эти показатели постоянны в разные промежутки времени
    Exact
    [10]
    Suffix
    . В процессе изучения ассоциированности аллельного полиморфизма генов с уровнем продукции цитокинов происходит определение взаимосвязи между индивидуальными полиморфными аллелями, а также гаплотипами генов цитокинов и продукцией белкового продукта in vitro [6, 17].

11
Hutchinson I.V., Pravica V., Hajeer A., Sinnott P.J. Identification of high and low responders to allografts // Rev Immunogenetics. –1999.-V.1.-P.323-333.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=24776
    Prefix
    Известно, что происходящее при ВИЧ-инфекции угнетение функционирования иммунной системы человека, является следствием проникновения вируса в организм при непосредственной гибели (некроз и апоптоз) клеток крови, на которых экспрессируется рецептор CD4 в результате прямого разрушающего действия вируса при образовании и отпочковывании вирионов
    Exact
    [11]
    Suffix
    . Как один из подтверждающих фактов этого заключения можно представить изученное нами статистически значимое снижение параметров клеточного звена (содержание CD3, CD4-позитивных клеток) у носителей генотипа G/A промотора гена TNFA, наиболее часто встречающегося у инфицированных лиц и, как отмечено выше, ассоциированного с инфекцией.

12
Koss K., Satsangi J., Fanning G.C., Welsh K.I., Jewell D.P. Cytokine (TNFα, LT-α and IL-10) polymorphisms in inflammatory bowel diseases and normal controls: differential effects on production and allele frequencies // Gen. Immun. - 2000. - V.1. - P. 185-190.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=5429
    Prefix
    Тем самым усложняется анализ функций отдельно взятых цитокинов в качестве моделей для исследования влияния их генов, а также непосредственно белкового продукта этих генов на формирование иммунной реакции на внешние или аутологичные воздействия
    Exact
    [12, 14, 18]
    Suffix
    . Существуют значительные индивидуальные и этнические различия в продукции цитокинов [4]. Различия между максимальным и минимальным уровнями продукции некоторых цитокинов часто достигают десятикратных величин, и эти показатели постоянны в разные промежутки времени [10].

13
Luxton R.W., Thompson E.J. Affinity distributions of antigen-specific IgG in patients with multiple sclerosis and in patients with viral encephalitis // J. Immunol. Methods. – 1990. – V.131(2). - P. 277-282.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=12474
    Prefix
    В дополнение к этому у ВИЧ-инфицированных анализировали специфические тесты: титр ВИЧ-антител для оценки гуморального звена иммунитета; уровень провирусной нагрузки мононуклеаров периферической крови (PVL) и показатель аффинности (RHAV), который характеризует активность Fabфрагмента (аффинность анти-ВИЧ - антител)
    Exact
    [13]
    Suffix
    . Статистическая обработка данных Все расчеты проводили с помощью программ «STATISTICA for Windows 5,0» и «Microsoft Excel 97». Результаты Было показано, что у здоровых индивидов МНК с генотипом G/G промоторного участка G-308A гена TNFА в среднем спонтанно продуцировали 18,4± 7,9 pg/ml фактора некроза опухоли альфа.

14
Marsh D.G., Neely J.D., Breazeale D.R., Ghosh B., Freidhoff L.R., Ehrlich-Kautzky E., Schou C., Krishnaswamy G., Beaty T.H. Linkage analysis of IL4 and other chromosome 5q31.1 markers and total serum immunoglobulin E concentration // Science. – 1994. – V. 264. – P. 1152-1156.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=5429
    Prefix
    Тем самым усложняется анализ функций отдельно взятых цитокинов в качестве моделей для исследования влияния их генов, а также непосредственно белкового продукта этих генов на формирование иммунной реакции на внешние или аутологичные воздействия
    Exact
    [12, 14, 18]
    Suffix
    . Существуют значительные индивидуальные и этнические различия в продукции цитокинов [4]. Различия между максимальным и минимальным уровнями продукции некоторых цитокинов часто достигают десятикратных величин, и эти показатели постоянны в разные промежутки времени [10].

15
Naif H., Ho-Shon M., Chang J., Cunningham A.L. Molecular mechanisms of IL-4 effect on HIV expression in promonocytic cell linesand primary human monocytes // J. Leukoc. Biol. – 1994. - V.56(3) - P.335339.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=23881
    Prefix
    имеет тенденцию к ассоциации с ВИЧ-инфекцией [21], можно предположить, что эта форма гена обладает более низкой по сравнению с вариантом -330G способностью к экспрессии и обуславливает пониженную продукцию IL-2 у инфицированных лиц. Резюмируя полученные ранее и описанные в литературе данные, можно было бы ожидать увеличения уровня продукции цитокина у носителей аллеля -590Т
    Exact
    [9, 15]
    Suffix
    . Тем более что наши результаты по распределению аллельных вариантов гена IL4 показали повышенную частоту генотипа T/T среди инфицированных лиц и тенденцию к ассоциации аллеля -590Т с ВИЧ-инфекцией [21].

16
Pociot F., Wilson A.G., Nerup J., Duff G.W. No independent association between a TNF-α promoter region polymorphism and insulin-dependent diabetes mellitus // Eur. J. Immunol . - 1993. – V.23. - P. 30433049.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=22793
    Prefix
    В исследованной группе ВИЧ-инфицированных наблюдалось снижение уровня TNFα в ответ на стимуляцию митогеном по сравнению с ответом стимулированных клеток здоровых лиц, причем более низкий ответ клеток носителей генотипа G/A (-308А - аллель, ассоциированный с повышением экспрессии гена
    Exact
    [16]
    Suffix
    ) может говорить о более деструктивном характере поражения их клеток под влиянием вируса и более глубокой иммуносупрессии. Известно, что ВИЧ подавляет продукцию IL-2, встраиваясь в геном хозяина рядом с регуляторными последовательностями гена IL2, тем самым снижая его активность, кроме этого, продукт гена ВИЧ взаимодействует со структурой, в норме регулирующей экспрессию рецептора IL-

17
Pravica V., Asderakis A., Perrey C., Hajeer A., Sinnott P.J., Hutchinson I.V. In vitro production of IFN-γ correlates with CA repeat polymorphism in the human IFN-γ gene // Eur. J. of Immunogenetics. – 1999. - V.26. - P.1-3.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=5987
    Prefix
    В процессе изучения ассоциированности аллельного полиморфизма генов с уровнем продукции цитокинов происходит определение взаимосвязи между индивидуальными полиморфными аллелями, а также гаплотипами генов цитокинов и продукцией белкового продукта in vitro
    Exact
    [6, 17]
    Suffix
    . Важная роль иммуномодуляторов в патогенезе ВИЧ-инфекции проявляется в регуляции апоптоза иммунокомпетентных клеток у инфицированных пациентов, играющего основную роль в формировании иммуносупрессии, причиной чего является гиперпродукция TNFα, IL-4, IL-6, IL-10, стимулирующих запрограм-мированную клеточную смерть, и низкое содержание IL-2, IL-12, TGFβ, оказывающих протективное

18
Reynard M.P., Turner D., Navarrete C.V. Allele frequencies of polymorphisms of the tumour necrosis factor-α, interleukin-10, interferon-γ and interleukin-2 genes in a North European Caucasoid group from the UK // Eur. J. Immunogenetics. - 2000. - V.27. - P. 241-249.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=5429
    Prefix
    Тем самым усложняется анализ функций отдельно взятых цитокинов в качестве моделей для исследования влияния их генов, а также непосредственно белкового продукта этих генов на формирование иммунной реакции на внешние или аутологичные воздействия
    Exact
    [12, 14, 18]
    Suffix
    . Существуют значительные индивидуальные и этнические различия в продукции цитокинов [4]. Различия между максимальным и минимальным уровнями продукции некоторых цитокинов часто достигают десятикратных величин, и эти показатели постоянны в разные промежутки времени [10].

19
Sennikov S.V., Krysov S.V., Injelevskaya T.V., Silkov A.N., Grishina L.V., Kozlov V.A. Quantitative analysis of human immunoregulatory cytokines by electrochemiluminescence method // J. Immunol. Methods. – 2003. – V.275(1-2). – P.81-88.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=9566
    Prefix
    Клетки культивировали в конечной концентрации 1х106 кл/мл в 24 луночных планшетах в течение 48 часов в полной среде RPMI-1640 и 10% FCS (телячья эмбриональная сыворотка) при температуре 37°С и при концентрации СО2 5%, как описано ранее
    Exact
    [19]
    Suffix
    . Клетки стимулировали ConА, добавленном в конечной концентрации 10 мкг/мл. Супернатанты от клеточных культур хранили при -70°С до момента анализа. Измерение спонтанной и стимулированной ConА продукции цитокинов в супернатантах было осуществлено у части ВИЧ-инфицированных (n=30) и здоровых лиц (n=15) с помощью иммуноферментного метода.

20
Shin H.D., Winkler C., Stephens J.C., Bream J., Young H., Goedert J.J., O’Brien T.R., Vlahov D., Buchbinder S., Giorgi J., Rinaldo C., Donfield S., Willoughby A., O’Brien S.J., Smith M.W. Genetic restriction of HIV-1 pathogenesis to AIDS by promoter alleles of IL10 // PNAS. - 2000. -V.97(26). - P. 1446714472.
Total in-text references: 1
  1. In-text reference with the coordinate start=26857
    Prefix
    локуса -592 гена IL10 происходит статистически значимое увеличение абсолютного числа CD3+ клеток по сравнению с гомозиготным вариантом C/C, вероятнее всего, за счет субпопуляции CD8+ лимфоцитов. В литературе указывается на сниженное количество CD4 позитивных клеток параллельно наблюдаемому низкому количеству IL-10 в клетках периферической крови ВИЧ-инфицированных лиц
    Exact
    [20]
    Suffix
    . Среди группы обледованных нами пациентов с генотипом C/A IL10 происходило характерное для неблагоприятного прогноза заболевания снижение индекса отношения хелперной и супрессорной субпопуляций лимфоцитов CD4+/CD8+ по сравнению с лицами, имеющими генотип C/C.

21
Smolnikova M.V., Konenkov V.I. Association of IL2, TNFA, IL4 and IL10 promoter gene polymorphisms with rate of the HIV-infection progression // Russian. J. Immunology. - 2002. - V. 7(4). - P. 349-356. поступила в редакцию 04.10.2006
Total in-text references: 4
  1. In-text reference with the coordinate start=9026
    Prefix
    Все ВИЧ-инфицированные (n=127) и здоровые лица (n=52) были прогенотипированы на четыре однонуклеотидных замены (SNP) в промоторных регионах генов: TNFA (G-308A), IL2 (T-330G), IL4 (C-590T), IL10 (C-597A). Генотипирование аллельных вариантов осуществляли методом рестриктного анализа продуктов амплификации специфических участков генома по описанным ранее методикам
    Exact
    [3, 21]
    Suffix
    . Определение уровня продукции цитокинов Для изучения продукции цитокинов в кондиционных средах от клеток пациентов, мононуклеарные клетки (МНК) выделяли из гепаринизированной венозной крови путем ее центрифугирования в градиенте плотности фиколл-верографина.

  2. In-text reference with the coordinate start=23534
    Prefix
    Нами показано, что у ВИЧ-инфицированных пациентов уровень IL-2 ниже, чем у доноров, причем наиболее низкая концентрация установлена у носителей T/T варианта. Учитывая, что этот аллельный вариант -330Т имеет тенденцию к ассоциации с ВИЧ-инфекцией
    Exact
    [21]
    Suffix
    , можно предположить, что эта форма гена обладает более низкой по сравнению с вариантом -330G способностью к экспрессии и обуславливает пониженную продукцию IL-2 у инфицированных лиц. Резюмируя полученные ранее и описанные в литературе данные, можно было бы ожидать увеличения уровня продукции цитокина у носителей аллеля -590Т [9, 15].

  3. In-text reference with the coordinate start=24100
    Prefix
    Тем более что наши результаты по распределению аллельных вариантов гена IL4 показали повышенную частоту генотипа T/T среди инфицированных лиц и тенденцию к ассоциации аллеля -590Т с ВИЧ-инфекцией
    Exact
    [21]
    Suffix
    . В наших экспериментах показано увеличение спонтанного количества IL-10 у ВИЧ-инфицированных пациентов с С/C генотипом IL10 по сравнению с донорами, имеющими этот же генотип, тогда как спонтанная продукция IL-2 клетками ВИЧ-инфицированных носителей T/T генотипа IL2 ниже, чем у здоровых.

  4. In-text reference with the coordinate start=25832
    Prefix
    Это указывает на негативное значение генотипа G/A гена TNFA в характере течения ВИЧ-инфекции. Очевидно, что в результате ВИЧ-инфекции Т-лимфоциты носителей T/T генотипа, ассоциированного с заболеванием
    Exact
    [21]
    Suffix
    , более выраженно утрачивают способность эффективно пролиферировать, тем более что у этих лиц нами показан более сниженный уровень продукции IL-2, чем у носителей варианта T/G гена IL2.