The 20 reference contexts in paper V. Konenkov I., V. Prokof’ev F., A. Shevchenko V., O. Golovanova V., E. Zonova V., M. Korolev A., J. Leonova B., В. Коненков И., В. Прокофьев Ф., А. Шевченко В., О. Голованова В., Е. Зонова В., М. Королев А., Ю. Леонова Б. (2014) “КОМПЛЕКСНЫЙ АНАЛИЗ ПОЛИМОРФИЗМА В ПРОМОТОРНЫХ УЧАСТКАХ ГЕНОВ ЦИТОКИНОВ IL-1B T-31C, IL-6 G-174C, TNFA G-238A, TNFA G-308A, TNFA C-863A, IL-4 C-590T И IL-10 C-592α В ПРОГНОЗЕ ЭФФЕКТА ОТ ЛЕЧЕНИЯ РЕВМАТОИДНОГО АРТРИТА // COMBINATION ANALYSIS OF CYTOKINE GENE PROMOTER POLYMORPHISMS OF IL1B T-31C, IL-6 G-174C, TNFA G-238A, TNFA G-308A, TNFA C-863A, IL4 C-590T, IL-10 C-592A FOR PREDICTION OF TREATMENT EFFICIENCY IN RHEUMATOID ARTHRITIS” / spz:neicon:mimmun:y:2010:i:5:p:361-374

  1. Start
    3404
    Prefix
    Это открытие привело к созданию нового класса лекарственных препаратов – биологических агентов, или генно-инженерных препаратов, в основе которых лежат моноклональные антитела к различным эпитопам цитокинов или их рецепторам. Воспаление, лежащее в основе патологического процесса при РА, во многом зависит от баланса продукции цитокинов с провоспалительной и антивоспалительной активностью
    Exact
    [8, 21]
    Suffix
    . Казалось бы, очевидная мысль об использовании показателей их содержания в сыворотке крови не нашла своего развития на практике. Основанием этому послужило наличие чрезвычайно широких колебаний концентраций цитокинов в сыворотке крови, как здоровых лиц, так и пациентов с РА и зависимость их концентраций не столько от активности ревматоидного воспаления, сколько от множества динамичных фактор
    (check this in PDF content)

  2. Start
    4489
    Prefix
    Наличие в регуляторных участках генов цитокинов полиморфных позиций, однонуклеотидная замена в которых приводит к различным уровням продукции клеткой биологически активных молекул соответствующих цитокинов, позволяет использовать генотипирование для определения базового уровня продукции цитокинов у индивида, не прибегая к исследованию постоянно меняющейся их концентрации в сыворотке крови
    Exact
    [22, 33, 36]
    Suffix
    . Зависимость уровня продукции клетками цитокинов от точечных замен в промоторных участках генов цитокинов, делает более понятным ассоциированность аллельных вариантов этих генов с РА и ставит их в первый ряд кандидатных генов для фармагенетических исследований в ревматологии [10, 17, 23].
    (check this in PDF content)

  3. Start
    4772
    Prefix
    Зависимость уровня продукции клетками цитокинов от точечных замен в промоторных участках генов цитокинов, делает более понятным ассоциированность аллельных вариантов этих генов с РА и ставит их в первый ряд кандидатных генов для фармагенетических исследований в ревматологии
    Exact
    [10, 17, 23]
    Suffix
    . Такие попытки научных центрах различных стран неоднократно предпринимаются, однако их эффективность требует проверки клинической практикой [15, 28, 34, 37]. В России таких исследований явно недостаточно, тем более что этногенетические особенности населения такой многонациональной страны, как Российская федерация, требуют критичного отношения к использованию подобных данных, полученных на
    (check this in PDF content)

  4. Start
    4924
    Prefix
    цитокинов от точечных замен в промоторных участках генов цитокинов, делает более понятным ассоциированность аллельных вариантов этих генов с РА и ставит их в первый ряд кандидатных генов для фармагенетических исследований в ревматологии [10, 17, 23]. Такие попытки научных центрах различных стран неоднократно предпринимаются, однако их эффективность требует проверки клинической практикой
    Exact
    [15, 28, 34, 37]
    Suffix
    . В России таких исследований явно недостаточно, тем более что этногенетические особенности населения такой многонациональной страны, как Российская федерация, требуют критичного отношения к использованию подобных данных, полученных на других европеоидных, монголоидных и негроидных популяциях [6].
    (check this in PDF content)

  5. Start
    5230
    Prefix
    В России таких исследований явно недостаточно, тем более что этногенетические особенности населения такой многонациональной страны, как Российская федерация, требуют критичного отношения к использованию подобных данных, полученных на других европеоидных, монголоидных и негроидных популяциях
    Exact
    [6]
    Suffix
    . По современным стандартам целью фармакотерапии РА является достижение полной (или хотя бы частичной) ремиссии. Следует отметить, что терапия должна начинаться как можно раньше, желательно в течение 3-6 месяцев от начала болезни [16].
    (check this in PDF content)

  6. Start
    5458
    Prefix
    По современным стандартам целью фармакотерапии РА является достижение полной (или хотя бы частичной) ремиссии. Следует отметить, что терапия должна начинаться как можно раньше, желательно в течение 3-6 месяцев от начала болезни
    Exact
    [16]
    Suffix
    . В настоящее время метотрексат (МТ) получил статус «золотого стандарта» среди всех БПВП, использующихся для лечения РА [31]. Так же широко используются другие препараты – лефлуномид, сульфасалазин, гидроксихлорохин и различные комбинированные схемы [4, 27].
    (check this in PDF content)

  7. Start
    5579
    Prefix
    Следует отметить, что терапия должна начинаться как можно раньше, желательно в течение 3-6 месяцев от начала болезни [16]. В настоящее время метотрексат (МТ) получил статус «золотого стандарта» среди всех БПВП, использующихся для лечения РА
    Exact
    [31]
    Suffix
    . Так же широко используются другие препараты – лефлуномид, сульфасалазин, гидроксихлорохин и различные комбинированные схемы [4, 27]. Принципиально важным является оптимизация выбора лекарственного средства с предварительной оценкой возможной чувствительности к выбранному методу лечения.
    (check this in PDF content)

  8. Start
    5707
    Prefix
    В настоящее время метотрексат (МТ) получил статус «золотого стандарта» среди всех БПВП, использующихся для лечения РА [31]. Так же широко используются другие препараты – лефлуномид, сульфасалазин, гидроксихлорохин и различные комбинированные схемы
    Exact
    [4, 27]
    Suffix
    . Принципиально важным является оптимизация выбора лекарственного средства с предварительной оценкой возможной чувствительности к выбранному методу лечения. В настоящее время подбор препарата осуществляется эмпирически, а мультифакториальность природы ревматоидного артрита обуславливает и различную чувствительность пациентов к тераin a group of 104 patients with rheumatoid arthritis (RA) who wer
    (check this in PDF content)

  9. Start
    7943
    Prefix
    Диагноз РА соответствовал критериям Американской ревматологической ассоциации (1987). Продолжительность заболевания составила 9,18±8,97 лет. Распределение больных по рентгенологическим стадиям
    Exact
    [35]
    Suffix
    было следующим: II стадия – 36,54 %, III – 36,54 % и IV – 26,92% . Преобладали пациенты со 2 и 3 классом функциональной недостаточности суставов (ACR, 1992 г.), наличием экстраартикулярных проявлений болезни (79,81%).
    (check this in PDF content)

  10. Start
    9677
    Prefix
    Если активность заболевания по DAS28 после лечения оставалась высокой (более 5,1 балла), то удовлетворительным эффектом терапии можно было считать только значительную его динамику, т.е. уменьшение DAS28 более чем на 1,2 балла
    Exact
    [20]
    Suffix
    . Методы исследования полиморфизма генов. Геномную ДНК выделяли из ядросодержащих клеток 500 мкл переферической крови при помощи набора реагентов производства ООО «Лаборатория Медиген» (г. Новосибирск).
    (check this in PDF content)

  11. Start
    10345
    Prefix
    Анализ исследуемых полиморфизмов проводился с использованием метода рестрикционного анализа продуктов амплификации (ПДРФ-анализ). Амплификация специфических участков генома проводилась с использованием праймеров и параметров температурных циклов, описанных в литературе: TNFA
    Exact
    [13, 24, 30]
    Suffix
    , IL-1B [38], IL-4 [14], IL-6 [18], IL-10 [26]. Продукты амплификации подвергались рестрикции соответствующими эндонуклеазами: в случае генотипирования полиморфизма TNFA С-863А – Bst BAI, TNFA G-308A – Bsp19 I , TNFA G-238A – Msp I, IL-1B T-31C – Alu I, IL-4 C-590T – Bme 18 I, IL-6 G-174C – SfaN I, IL10 C-592A – RsaI («СибЭнзим», Новосибирск).
    (check this in PDF content)

  12. Start
    10376
    Prefix
    Анализ исследуемых полиморфизмов проводился с использованием метода рестрикционного анализа продуктов амплификации (ПДРФ-анализ). Амплификация специфических участков генома проводилась с использованием праймеров и параметров температурных циклов, описанных в литературе: TNFA [13, 24, 30], IL-1B [38], IL-4
    Exact
    [14]
    Suffix
    , IL-6 [18], IL-10 [26]. Продукты амплификации подвергались рестрикции соответствующими эндонуклеазами: в случае генотипирования полиморфизма TNFA С-863А – Bst BAI, TNFA G-308A – Bsp19 I , TNFA G-238A – Msp I, IL-1B T-31C – Alu I, IL-4 C-590T – Bme 18 I, IL-6 G-174C – SfaN I, IL10 C-592A – RsaI («СибЭнзим», Новосибирск).
    (check this in PDF content)

  13. Start
    10387
    Prefix
    Анализ исследуемых полиморфизмов проводился с использованием метода рестрикционного анализа продуктов амплификации (ПДРФ-анализ). Амплификация специфических участков генома проводилась с использованием праймеров и параметров температурных циклов, описанных в литературе: TNFA [13, 24, 30], IL-1B [38], IL-4 [14], IL-6
    Exact
    [18]
    Suffix
    , IL-10 [26]. Продукты амплификации подвергались рестрикции соответствующими эндонуклеазами: в случае генотипирования полиморфизма TNFA С-863А – Bst BAI, TNFA G-308A – Bsp19 I , TNFA G-238A – Msp I, IL-1B T-31C – Alu I, IL-4 C-590T – Bme 18 I, IL-6 G-174C – SfaN I, IL10 C-592A – RsaI («СибЭнзим», Новосибирск).
    (check this in PDF content)

  14. Start
    10399
    Prefix
    Амплификация специфических участков генома проводилась с использованием праймеров и параметров температурных циклов, описанных в литературе: TNFA [13, 24, 30], IL-1B [38], IL-4 [14], IL-6 [18], IL-10
    Exact
    [26]
    Suffix
    . Продукты амплификации подвергались рестрикции соответствующими эндонуклеазами: в случае генотипирования полиморфизма TNFA С-863А – Bst BAI, TNFA G-308A – Bsp19 I , TNFA G-238A – Msp I, IL-1B T-31C – Alu I, IL-4 C-590T – Bme 18 I, IL-6 G-174C – SfaN I, IL10 C-592A – RsaI («СибЭнзим», Новосибирск).
    (check this in PDF content)

  15. Start
    11668
    Prefix
    Частоту аллелей генов цитокинов вычисляли методом прямого подсчета по формуле: f = n/2N, где n – количество раз встречаемости аллеля (у гомозигот он учитывался дважды), 2N – удвоенная численность обследованных. Распределение генотипов по исследованным полиморфным локусам проверяли на соответствие равновесию Харди–Вайнберга согласно рекомендациям Вейр Б.
    Exact
    [1]
    Suffix
    . Частоту встречаемости отдельных генотипов и их комбинаций определяли как процентное отношение индивидов, несущих генотип (комбинацию генотипов), к общему числу обследованных в группе по формуле: f = n/N, где n – количество раз встречаемости генотипа (комбинации генотипов), N – численность обследованных.
    (check this in PDF content)

  16. Start
    12269
    Prefix
    Статистическую оценку силы ассоциации генов, генотипов и их комбинаций с клиническими эффектами терапии проводили по показателю OR (odds ratio – отношение шансов события в одной группе к шансам этого же события в другой группе) с расчетом 95% доверительного интервала (95% Confidence Interval – 95%CI)
    Exact
    [9, 25]
    Suffix
    . Достоверность (P) ассоциаций и различий частот распределения изучаемых признаков в альтернативных группах определяли по критерию χ2 с поправкой Йетса на непрерывность и двустороннему варианту точного метода Фишера для четырехпольных таблиц [3, 11].
    (check this in PDF content)

  17. Start
    12511
    Prefix
    Достоверность (P) ассоциаций и различий частот распределения изучаемых признаков в альтернативных группах определяли по критерию χ2 с поправкой Йетса на непрерывность и двустороннему варианту точного метода Фишера для четырехпольных таблиц
    Exact
    [3, 11]
    Suffix
    . Отбор генетических комплексов, пригодных для индивидуального прогнозирования эффективности терапии, проводился на основе значений трех статистических критериев: двусторонний вариант точного метода Фишера; информационная мера Кульбака (Jku); диагностический (прогностический) коэффициент Таблица 1.
    (check this in PDF content)

  18. Start
    14207
    Prefix
    /IL6174GG/TNFA238GG/ TNFA308GG/IL-1B31CC 12,900,009,80,0495100,00 IL-4590CT/IL6174GG/TNFA238GG/ TNFA863CC/IL-1B31CC 13,330,009,90,0460100,00 IL-4590CT/IL6174GG/TNFA308GG/ TNFA863CC/IL-1B31CC 13,330,009,90,0460100,00 IL-6174GG/TNFA238GG/TNFA308GG/ TNFA863CC/IL-1B31CC 13,330,009,90,0460100,00 по формуле: DK = 10 lg (P1/P2), где P1 и P2 – частота прогностического признака в сравниваемых группах
    Exact
    [3, 5, 7]
    Suffix
    . Необходимо напомнить, что согласно данному методу анализа, при достижении прогностического коэффициента величины 12,8 вероятность реализации прогноза составляет 95%. В качестве операционных характеристик генетических комплексов в качестве прогностических критериев использовали также показатели чувствительности, специфичности, безошибочности, предсказательной ценности положительного результата
    (check this in PDF content)

  19. Start
    14694
    Prefix
    В качестве операционных характеристик генетических комплексов в качестве прогностических критериев использовали также показатели чувствительности, специфичности, безошибочности, предсказательной ценности положительного результата и предсказательной ценности отрицательного результата по стандартным формулам
    Exact
    [2, 7, 9, 12]
    Suffix
    . Результаты По результатам проведенного 24 недельного лечения пациенты были разделены на группы с высокой эффективностью проведенного лечения, с отсутствием клинически значимого эффекта от проведенной терапии и с развитием неблагоприятных побочных реакций.
    (check this in PDF content)

  20. Start
    16628
    Prefix
    Как правило, среди таких генетических комбинаций присутствует генотип IL-6 -174GG, ассоциированный с высоким уровнем продукции этого провоспалительного цитокина, обладающего выраженными системными и суставными эффектами, во многом определяющими клиническую картину течения РА
    Exact
    [29]
    Suffix
    . С другой стороны, среди этих пациентов достаточно часто выявляется генотип IL-1B -31СС, ассоциированный с низкой продукцией IL-1β, характеризующегося провоспалительной активностью. Этот цитокин, продуцируемый в основном макрофагами, активно инициирует начальные фазы развития системного воспалительного процесса и, по мере развития заболевания, главенствующая роль в его поддержании переходит к
    (check this in PDF content)