The 22 reference contexts in paper A. Grazhdantseva A., G. Sivolobova F., M. Major , E. Chub V., A. Shvalov N., P. Yudin V., S. Netesov V., V. Loktev B., G. Kochneva V., А. Гражданцева А., Г. Сиволобова Ф., M. Major, Е. Чуб В., А. Швалов Н., П. Юдин В., С. Нетесов В., В. Локтев Б., Г. Кочнева В. (2014) “ПОЛНОРАЗМЕРНЫЙ ПЕПТИДНЫЙ АНАЛИЗ АНТИГЕННОГО ПРОФИЛЯ ПОВЕРХНОСТНЫХ БЕЛКОВ СИБИРСКИХ ИЗОЛЯТОВ ВИРУСА ГЕПАТИТА C // FULL-LENGTH PEPTIDE ASSAY OF ANTIGENIC PROFILE OF ENVELOPE PROTEINS FROM SIBERIAN ISOLATES OF HEPATITIS C VIRUS” / spz:neicon:mimmun:y:2010:i:2:p:115-124

  1. Start
    3880
    Prefix
    Введение Вирус гепатита С (ВГС) является строго антропонозным агентом и вызывает у человека тяжелый вирусный гепатит c возможным прогрессированием в цирроз или первичный рак печени. Характерной особенностью гепатита С является развитие хронических форм заболевания в 7580% случаев и чрезвычайно высокая вариабельность вируса
    Exact
    [6, 17]
    Suffix
    . Постоянное образование новых антигенных вариантов ВГС в организме инфицированного человека позволяет вирусу ускользать от защитного ответа иммунной системы [2]. Показано, что в организме хронически инфицированного ВГС человека образуется большое количество противовирусных антител как к структурным белкам С, Е1 и Е2, так и неструктурным NS2, NS3, NS4 и NS5 [4, 7, 9, 19].
    (check this in PDF content)

  2. Start
    4046
    Prefix
    Характерной особенностью гепатита С является развитие хронических форм заболевания в 7580% случаев и чрезвычайно высокая вариабельность вируса [6, 17]. Постоянное образование новых антигенных вариантов ВГС в организме инфицированного человека позволяет вирусу ускользать от защитного ответа иммунной системы
    Exact
    [2]
    Suffix
    . Показано, что в организме хронически инфицированного ВГС человека образуется большое количество противовирусных антител как к структурным белкам С, Е1 и Е2, так и неструктурным NS2, NS3, NS4 и NS5 [4, 7, 9, 19].
    (check this in PDF content)

  3. Start
    4250
    Prefix
    Показано, что в организме хронически инфицированного ВГС человека образуется большое количество противовирусных антител как к структурным белкам С, Е1 и Е2, так и неструктурным NS2, NS3, NS4 и NS5
    Exact
    [4, 7, 9, 19]
    Suffix
    . Роль антител в патогенезе ВГС инфекции не ясна, однако ряд антител к поверхностным белкам ВГС обладает вируснейтрализующей активностью [11, 25], что свидетельствует о важности изучения иммуногенных свойств данных белков для создания средств профилактического и терапевтического контроля инфекции.
    (check this in PDF content)

  4. Start
    4401
    Prefix
    Показано, что в организме хронически инфицированного ВГС человека образуется большое количество противовирусных антител как к структурным белкам С, Е1 и Е2, так и неструктурным NS2, NS3, NS4 и NS5 [4, 7, 9, 19]. Роль антител в патогенезе ВГС инфекции не ясна, однако ряд антител к поверхностным белкам ВГС обладает вируснейтрализующей активностью
    Exact
    [11, 25]
    Suffix
    , что свидетельствует о важности изучения иммуногенных свойств данных белков для создания средств профилактического и терапевтического контроля инфекции. Неравнозначность участков поверхностных белков Е1 и Е2 ВГС в индукции иммунного ответа была отмечена в целом ряде работ [4, 10, 15].
    (check this in PDF content)

  5. Start
    4686
    Prefix
    ВГС инфекции не ясна, однако ряд антител к поверхностным белкам ВГС обладает вируснейтрализующей активностью [11, 25], что свидетельствует о важности изучения иммуногенных свойств данных белков для создания средств профилактического и терапевтического контроля инфекции. Неравнозначность участков поверхностных белков Е1 и Е2 ВГС в индукции иммунного ответа была отмечена в целом ряде работ
    Exact
    [4, 10, 15]
    Suffix
    . Кроме того, эти белки образуют на поверхности вириона гетеродимер и формируют составные антигенные детерминанты, часть которых представлена фрагментом белка Е1, а часть – белка Е2 [14]. Наиболее антигенно значимым участком белка Е1 является район, включающий 192-211 ак N-концевой части молекулы, и участок 313-327 ак, прилегающий к гидрофобному домену на С-конце белка Е1 [8, 11].
    (check this in PDF content)

  6. Start
    4882
    Prefix
    Неравнозначность участков поверхностных белков Е1 и Е2 ВГС в индукции иммунного ответа была отмечена в целом ряде работ [4, 10, 15]. Кроме того, эти белки образуют на поверхности вириона гетеродимер и формируют составные антигенные детерминанты, часть которых представлена фрагментом белка Е1, а часть – белка Е2
    Exact
    [14]
    Suffix
    . Наиболее антигенно значимым участком белка Е1 является район, включающий 192-211 ак N-концевой части молекулы, и участок 313-327 ак, прилегающий к гидрофобному домену на С-конце белка Е1 [8, 11].
    (check this in PDF content)

  7. Start
    5076
    Prefix
    Кроме того, эти белки образуют на поверхности вириона гетеродимер и формируют составные антигенные детерминанты, часть которых представлена фрагментом белка Е1, а часть – белка Е2 [14]. Наиболее антигенно значимым участком белка Е1 является район, включающий 192-211 ак N-концевой части молекулы, и участок 313-327 ак, прилегающий к гидрофобному домену на С-конце белка Е1
    Exact
    [8, 11]
    Suffix
    . В составе белка Е2 обнаружены два гипервариабельных района HRV1 (384-410 ак) и HRV2 (474-482 ак), антитела к которым обладают выраженной вируснейтрализующей активностью [5, 18]. В настоящее время описано 6 основных генотипов ВГС с уровнем гомологии 65,7-68,9%, более 100 субтипов с уровнем гомологии 76,9-80,1 и миллионы постоянно образующихся внутри каждого инфицированного организма квазиви
    (check this in PDF content)

  8. Start
    5255
    Prefix
    Наиболее антигенно значимым участком белка Е1 является район, включающий 192-211 ак N-концевой части молекулы, и участок 313-327 ак, прилегающий к гидрофобному домену на С-конце белка Е1 [8, 11]. В составе белка Е2 обнаружены два гипервариабельных района HRV1 (384-410 ак) и HRV2 (474-482 ак), антитела к которым обладают выраженной вируснейтрализующей активностью
    Exact
    [5, 18]
    Suffix
    . В настоящее время описано 6 основных генотипов ВГС с уровнем гомологии 65,7-68,9%, более 100 субтипов с уровнем гомологии 76,9-80,1 и миллионы постоянно образующихся внутри каждого инфицированного организма квазивидов с уровнем гомологии 90,8-99% [3, 20].
    (check this in PDF content)

  9. Start
    5514
    Prefix
    В настоящее время описано 6 основных генотипов ВГС с уровнем гомологии 65,7-68,9%, более 100 субтипов с уровнем гомологии 76,9-80,1 и миллионы постоянно образующихся внутри каждого инфицированного организма квазивидов с уровнем гомологии 90,8-99%
    Exact
    [3, 20]
    Suffix
    . Наиболее интенсивно мутациям подвергаются поверхностные гликопротеины Е1 и Е2 [22], поэтому для создания универсальной вакцины, мониторинга инфекции, диагностики и лечения принципиально важно выявить общие закономерности антигенной структуры и уровень антигенной вариабельности основных иммуногенных доменов поверхностных гликопротеинов ВГС.
    (check this in PDF content)

  10. Start
    5603
    Prefix
    В настоящее время описано 6 основных генотипов ВГС с уровнем гомологии 65,7-68,9%, более 100 субтипов с уровнем гомологии 76,9-80,1 и миллионы постоянно образующихся внутри каждого инфицированного организма квазивидов с уровнем гомологии 90,8-99% [3, 20]. Наиболее интенсивно мутациям подвергаются поверхностные гликопротеины Е1 и Е2
    Exact
    [22]
    Suffix
    , поэтому для создания универсальной вакцины, мониторинга инфекции, диагностики и лечения принципиально важно выявить общие закономерности антигенной структуры и уровень антигенной вариабельности основных иммуногенных доменов поверхностных гликопротеинов ВГС.
    (check this in PDF content)

  11. Start
    7465
    Prefix
    Указ Президента РФ от 24.12.1993 N 2288, Федеральные законы от 02.03.1998 No 30-ФЗ, от 20.12.1999 No 214-ФЗ). Забор крови проводили только после получения письменного информированного согласия пациента, как описано ранее
    Exact
    [1]
    Suffix
    . Исследование одобрено этическим комитетом ФГУН ГНЦ ВБ «Вектор» Роспотребнадзора. Диагностика антител к ВГС. Наличие антител к ВГС класса G в сыворотке крови определяли с использованием коммерческих тест-систем «D-0751 РекомбиБест анти-ВГС» и «D-0756 РекомбиБест анти-ВГС подтверждающий тест» (ЗАО «Вектор-Бест», г.
    (check this in PDF content)

  12. Start
    8464
    Prefix
    Москва) в соответствии с инструкцией производителя. Генотипирование изолятов ВГС. Генотип ВГС определяли на основе анализа фрагмента 5’UTR-области генома вируса. Для этого проводили амплификацию указанного района генома, как описано в работе
    Exact
    [1]
    Suffix
    , с последующим секвенированием полученного фрагмента. Секвенирование проводили по методу CEQ Dye Terminator Cycle Sequencing на автоматическом секвенаторе CEQ2000XL DNA Analysis System (Beckman Coulter Inc.
    (check this in PDF content)

  13. Start
    13966
    Prefix
    Определение генотипа исследуемых изолятов ВГС проводили при помощи филогенетического анализа последовательности 5’UTR-области генома ВГС (рис. 1). Данная область, несмотря на высокий уровень консервативности, является достаточно информативной для дифференциации генотипов и большинства субтипов ВГС
    Exact
    [16, 17]
    Suffix
    . По результатам анализа в коллекцию сывороток, использованную далее в нашей работе, были отобраны образцы, содержащие ВГС трех генотипов – 1b, 2a/2c (использованный метод не позволяет дифференцировать эти два субтипа) и 3a, которые наиболее широко распространены на территории России, и в частности в г.
    (check this in PDF content)

  14. Start
    20398
    Prefix
    Как следует из представленных на рисунке 3 данных, в белках Е1 и Е2 исследованных нами сибирских изолятов ВГС генотипов 1b, 2а/2с и 3а выявляется значительное количество общих иммуногенных районов, что согласуется с ранее опубликованными данными по изолятам ВГС из разных регионов мира
    Exact
    [4, 12, 15, 16, 22, 24]
    Suffix
    . Важно также учесть, что пептиды синтезированы ТАблИцА 1. СТРукТуРА СИНТЕТИчЕСкИх ПЕПТИдоВ, ПЕРЕкРыВАющИх ПолНую ПоСлЕдоВАТЕльНоСТь Е1- И Е2-бЕлкоВ ВГС (шТАмм H77, ГЕНоТИП 1а) No Позиция акПоследовательность аминокислотNo Позиция акПоследовательность аминокислот A1192-211Y*QVRNSSGLYHVTNDCPNSSGSGG5496-515SGSGIVPAKSVCGPVYCFTPSPVV В1200-219SGSGLYHVTNDCPNSSIVYEAADAH5504-523SGSGGPVYCFTPSPVVVGTT
    (check this in PDF content)

  15. Start
    26148
    Prefix
    Так, в частности, в районе 280-290 ак белка Е1 нами выявлена ранее не описанная в литературе антигенная детерминанта, характерная только для 2а/2с субтипа ВГС выделенных нами сибирских изолятов. Интересно отметить, что детерминанта 412-426 ак, проявляющая межгенотиповые вируснейтрализующие свойства in vitro
    Exact
    [21, 25]
    Suffix
    , и эпитопы конформационной детерминаты 412-423+528-535 ак белка Е2, описанные в [13], выявлены нами также только в случае 2а/2с субтипа ВГС. Однако расположенная рядом блокирующая вируснейтрализацию детерминанта 434-446 ак [25] является высокоиммуногенной во всех исследованных генотипах ВГС.
    (check this in PDF content)

  16. Start
    26239
    Prefix
    Интересно отметить, что детерминанта 412-426 ак, проявляющая межгенотиповые вируснейтрализующие свойства in vitro [21, 25], и эпитопы конформационной детерминаты 412-423+528-535 ак белка Е2, описанные в
    Exact
    [13]
    Suffix
    , выявлены нами также только в случае 2а/2с субтипа ВГС. Однако расположенная рядом блокирующая вируснейтрализацию детерминанта 434-446 ак [25] является высокоиммуногенной во всех исследованных генотипах ВГС.
    (check this in PDF content)

  17. Start
    26384
    Prefix
    Интересно отметить, что детерминанта 412-426 ак, проявляющая межгенотиповые вируснейтрализующие свойства in vitro [21, 25], и эпитопы конформационной детерминаты 412-423+528-535 ак белка Е2, описанные в [13], выявлены нами также только в случае 2а/2с субтипа ВГС. Однако расположенная рядом блокирующая вируснейтрализацию детерминанта 434-446 ак
    Exact
    [25]
    Suffix
    является высокоиммуногенной во всех исследованных генотипах ВГС. Это согласуется с данными, представленными в [26], где из 9 тестированных ВГС - позитивных сывороток человека антитела к блокирующему эпитопу 434-446 ак были выявлены в четырех образцах, а к нейтрализующему 412 - 426 ак только в двух, причем в существенно более низком титре.
    (check this in PDF content)

  18. Start
    26500
    Prefix
    Однако расположенная рядом блокирующая вируснейтрализацию детерминанта 434-446 ак [25] является высокоиммуногенной во всех исследованных генотипах ВГС. Это согласуется с данными, представленными в
    Exact
    [26]
    Suffix
    , где из 9 тестированных ВГС - позитивных сывороток человека антитела к блокирующему эпитопу 434-446 ак были выявлены в четырех образцах, а к нейтрализующему 412 - 426 ак только в двух, причем в существенно более низком титре.
    (check this in PDF content)

  19. Start
    26742
    Prefix
    Это согласуется с данными, представленными в [26], где из 9 тестированных ВГС - позитивных сывороток человека антитела к блокирующему эпитопу 434-446 ак были выявлены в четырех образцах, а к нейтрализующему 412 - 426 ак только в двух, причем в существенно более низком титре. В статье
    Exact
    [23]
    Suffix
    было также показано, что антитела к узнающему эпитопу 412 - 423 ак вируснейтрализующего моноклонального антитела AP33 выявляются лишь в 2,5% случаев природной инфекции ВГС. Авторы высказали предположение, что низкая иммуногенность данного района связана с присутствующим в позиции 417 ак сайтом гликозилирования белка Е2.
    (check this in PDF content)

  20. Start
    27231
    Prefix
    Авторы высказали предположение, что низкая иммуногенность данного района связана с присутствующим в позиции 417 ак сайтом гликозилирования белка Е2. В ряде работ было показано, что в N-концевой (192-202 ак) области белка Е1 расположен высокоиммуногенный эпитоп, обладающий вируснейтрализующей активностью
    Exact
    [7, 8]
    Suffix
    . Нам не удалось выявить в этом районе значимых иммуногенных эпитопов ни для одного из исследованных генотипов ВГС. В опубликованных работах не приведены генотипы тестированных изолятов ВГС, поэтому различия, возможно, связаны с присутствием антигенных детерминант в структуре N-концевой части Е1-белка других, отличных от наших субтипов ВГС.
    (check this in PDF content)

  21. Start
    27822
    Prefix
    В исследуемой группе сывороток нам не удалось выявить антитела ко второму гипервариабельному району Е2-белка в позиции 470-480 ак, хотя в литературе показано наличие иммуногенных эпитопов в данном районе Е2-белка 1а и 1b суб типов ВГС
    Exact
    [4]
    Suffix
    . Возможно, это объясняется наиболее высокой вариабельностью изолятов 1 генотипа ВГС по сравнению с другими генотипами и, соответственно, отличием группы изолятов, исследованных в нашей работе, от изученных в работе [4].
    (check this in PDF content)

  22. Start
    28044
    Prefix
    Возможно, это объясняется наиболее высокой вариабельностью изолятов 1 генотипа ВГС по сравнению с другими генотипами и, соответственно, отличием группы изолятов, исследованных в нашей работе, от изученных в работе
    Exact
    [4]
    Suffix
    . Выявленные нами межгенотиповые различия антигенного профиля поверхностных белков ВГС свидетельствуют о необходимости генотипирования изолятов при изучении свойств поверхностных белков Е1 и Е2 и некорректности в ряде случаев распространения данных, полученных для отдельного генотипа, на вирус гепатита С в целом (как следует из рис. 3, среднее).
    (check this in PDF content)